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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tpr2g4342 ATGGAAAATCAGATGCACAGCAAGCAACCTCAATGCCGATGGGAGATGGAAACTGCACCAAATTCTGAAATGATCGGAAATGATACCGAGAAGGAGAGATCTAAGCTTATAGATCTTGCTTCAGCTGCTATGGATCAACTCATCAAGTTGGCAGAACCAGATTCCCATCTCTGGATCAAGAGTCCAGAGAGTGGGAAGGAAATGCTTAACCGCGACGAGTATGAAAAGATTCGTTCTCCTTTTAATACTCCGAAACCAAATGGATTTGTAACTGAAGCTACAAAAAAGATTGTGCGAAATGGATCTATGCAACTGATTACATATGGGTGGATCATTCTCAATATGATGAGAGTGCTGTCCACCGGTCCAATGGTTAACTCCGGCATCGTATATGGTGCTCATAGATGGGTTACAACTCTCAAGAGGCTCTCTGAATCTCTTGCCGTCCCAATGTCTGTCGTACCATCTGATGACCCTACAGAGGGCCCAAAATTTGCGAGTTGGACGAGATGGGAAAAGGAGAATTCACCCTATCAGAGAGGGGCTTGGGTGCGTTTGTATGGCGTTCCTCTTCATGCTTGGAACGAGCAATTCTTTAAGTTGTGTGTTTTTGAATGTGGAGGGTTTCTTCGAACGGATTGTTGTGCTGCTGAAAAGAATCGACTTGACTTCGCGCGGGTTCTGATCGCTACCCCTGAACTTGACTTAATCAAAAGAAGTGTGACTGTCTTGGTAGATGGCATTCAAGTGGAGATTAAGATTGTGGAGGAGTGGGGGTATGCTATGGGAGAGGATTCTTGTCTCTTTGAAGAGGATAGCGAGGCAGAATCATCTTGTGGTGAGGGTCAAGATGATCCGGAGGTTCATCGCAATATTGACATGCTAGTCAATCAAGTTAAAGAAGGACTTGAGGTGGAGGATCATAATGAATTCCAAGGCAAGCAGGATGAAGAGTTTTTAGATAAGCTTGAAGCTAATTCAGGTTCTAAGGGAGTTGGGACAAATTCAGTTTTAAGGATGGACTCTCTTGAAGTGTTTGGAAATCAAGATGATCGGGCAGAGGTGTCTTCCCCACCGGGGAATGCTTTGGTTCGTCCTTCTTTTCGGCCGCTTATTGGTAAGCGTACTAGTTCTTGTCCTCCGGAGGCGAGGCGTTCCGTTATGTCAGGGCCTTGGAGTTTGGAGTGGTTACAGGATCAGAATTATGGGGATGCGGGAGTGATTTTTTCTGCAAGTAAGAAAAGTAGAAAGGAGGTTTTTCACGGACCGAGCCTTAAGCGGAAAGTGGATCAGGATTCGAGGAGACGGAAAGCAGGAGGTGTGCTTCGTCATCCAATCCATAGTCTTAAAAAAGTGGCTAGGATGCCATGCAAGGATCGTGGTGAGGTGTTAAAGGTCTTGAAGAAAAGTGTTCGTCGGCGCAGGGGTGGAGATGGGCTTAATCGATCTTGCTCTATGAGCTGTCATGTTTCCTCCGGAGATTCAGGTTCGTTGGGGTCTGTAAACAACGATTGGATGAATTGGGTGGCTGTTCATGGTAACGACCACATGGCGGTGGATGATGTGTGGGGAATCGGGAAAGCTATCGGGGTTAAGTTCAAGGGAGACAATGTGAATATGTTCAATATTCTTTCTAGGGCGAGTAAAGGCAAGAGGAAGGCTTCAGGGTTGATGGGGGAGAGAGTTTTTATGAAGATTATCTCTTGGAACATTAGAGGGCTGGGAGGCCTTGAGAAAAGGAAGGAAGTACGTAAGATGGTGGGGGAGTTGAAACCCTTCATCCTGTGTATTCAAGAAACGAAGTTGCAAAATTGTGATACTTTTCTTAGCTCGACTCTTTGGGGTAGTTCCTCGCACGGTTTTTCTTATCGTCCATCGGTTGGGGCATCTGGAGGGCTTCTAACTTTGTGGGATTCTTCTGAGGTGGATGTGTGGTCGACTGAGAGCCGAGAGCATGTGTTGTGGTGTCATGGTCGGTTCTCGAAGTCAGGGGAAGAATTTTATGTGGCAAATGTCTATGCGCCCTGTGATGATGGGGCTAAGCAAGGGCTGTGGGATTCTATTTCCGCGCGGCTCCAATTGCTGGCGGGGAAGAGGGTGTGTGTGTGTGGGGACTTTAATGCGGTCAAACACATTGATGAAAGACGATCGTTTACTTGGTTCAAAGGGGATGGTCACTCGATGAGCCGACTTGATAGGTTTCTTCTTTCCGAGGAGTGGTGTTTGGATTGGCCTAACTGTAAGCAAATGGCCAAACTGAGAGGGTTGTCTGATCATTGTCCCCTGGTCTTATCTGCGAATGAGGAAGATTGGGGGCCAAGACCGTCGCGTATGCTTAAGTGCTGGAAGGATATACCTGGGTATAACTTGTTTGTCAAAGATAAGTGGAATTCGCTCCAAGTGGATGGTTGGGGTGGTTATGTTTTAAAGGAAAAACTTAAGATGATTAAGGCGGCTTTAAAAGACTGGCATAAGACTCATGCTCAGAATCTTCCTAGTCGTATAGATAATTTGAAAATCAGGCTTTCAGCTCTCGATGAGAAGGGGGGAGGGGAAGATGATCTTTCTGAGGAGGATCTCGTTGAGCTTCATGGGGTTTCGGTCGACATTCACTCGCTATCTAGGTTGCATGCTAGCATTAGTTGGCAACAATCTCGATCGTTATGGCTTAAGGAAGGGGATGCTAATTCTAAGTATTTTCATTCAGTTTTGGCGAGTCGTCGTCGAAGGAATGCTTTGTCAGTCATTCAGGTAGATGAGGTTTCGTTGGAGGGTGTTAATCCTATTAGGCAAGCGGTGTTTTCGCATTTTGAGTCTCATTTTCAGGCTCCTAATGTGGATAGGCCTGGGGTTGACGACCTTCAGTTTAAGAGGTTAGATCCGATGGAGATTGGTGGCTTAACCAAACCTTTTTCGGAGACTGAGGTGAAGCTAGCTGTGTGGGATTGCGATAGTTTTAAAAGCCCAGGCCCTGATGGTATTAATTTCGGCTTTATTAAAGATTTCTGGGCCGAGCTTCGAGGCGACGTAATGCACTTTCTCTCTGATTTCCATCGAAATGGCAAGTTGACGAAAGGTATTAACTCGACCTTCATTGCTCTGATCCCCAAAACGGATAGTCCTCAGAGGCTGAGTGACTTTCGCCCTATTTTGCTTGTCGGATGCCTCTATAAAATATTGGCGAAGGTTTTAGCTAATAGGTTGCGTCAAGTGATTGGTAGTGTTATCTCTGAGTCCCAGACTGCGTTCGTAAAGAACAGACAAATTCTAGATGGTATTCTTATAGCTAACGAGGTGGTGGATGAGGCGCGAAAGTCTAAAAAGGATCTTTTGTTGTTTAAGGTTGATTTTGAGAAAGCTTATGATTCGGTGGATTGGGGGTATCTTGATGCTGTTATGGGGAGAATGTCATTTCCGACTTTGTGTCCGACTGATGAATTCCCTCTTAGGCGAGGGCTAAGGCAGGGTGATCCGCTCTCTCCTTTCCTTTTTCTTCTAGCGGCTGAGGGCCTTAATGTGCTTATGGAAGCTATGGTGGCTCGTAACTTGTTTACAGGTTATAGTTTTGGTGGTCAGGGGTCGGTCACGGTGTCACACCTTCAATTTGCTGATGATACTCTCTTGATGGGGGTAAAAAGTTGGGCAAATGTTCGGGCTTTGCGGGCTGTTTTAGTGCTTTTTGAAACTATGTCTGGCTTGAAGGTTAATTTTAATAAAAGTATGTTGGTTGGCGTTAATATCCCTGAGTCCTGGTTGTGTGAAGCTGCGTCTTCTCTGTGTTGTAAAGTGGGAAAGATTCCTTTTCTTTATCTGGGTCTTCAAATTGGGGGTGATCCGCGTCGTTTGGTATTTTGGGAACCGATGTTGACTCGTTTAAAGAACAGATTGTCTGGGTGGAAGAGCCGCTTTTTGTCTTTTGGTGGTCGTCTGGATTCTAGGAAAATCTCTTGGGTTAGTTGGAAATCTGTTTGTTTACGTAAGGAGTATGGAGGTTTGGGGGTTAGACAGTTGCGTGAGTTCAACATAGCGTTGTTGGGTAAGTGGTGTTGGAGGATGCTGGTGGACAGAGAGGGGTTGTGGTTTAGAGTGCTGGTAGCTAGGTATGGGCTTGAGGGAGGTAGTCTGCGGGCGGATGGTCAGAGAGGGTCGGTGTGGTGGAGGGAGCTGGCGCGTATTCGGGAGGGTGTTGGTGAGCCAGGTGGTAGTTGGTTTAGGGAGCATGTTTCGAGGAGGGTGGGGGATGGGTCATATACTCTTTTTTGGACCGATCCGTGGTTGGAGGGGATTTCGTTACGGGAGCGGTTTGGACGACTTTTTGAGTTGGCGGTGACCAAATCTCGTTCGGTCGCAGAGATGTTTGCTTTGGGTTGGGGGGAAGATGGTGGGGCGTGGGAGTGGCGGAGACGGTTGTGGGCGTGGGAGGAGGAGATGTTGGGGGAGTGTCAGTCTTTACTTCTTGACATTTCTTTGCAGGATCAGGCTATTGACAGGTGGCAATGGAGACTTGACCCTGACACAGGTTATACGGTCGGGGGAGTTTATCAGCTTTTGACGTCTCAGGATTCAGTTACTTTGGATGATGCGGATAATCTTATATGGCATTCTCAGGTTCCCTTGAAGGTTTCCATCTTTGCGTGGCGATTATTGCGGGATAGGTTGCCTACGAGAGCAAACCTGGTTACTCGTGGCGTTTTGTCTACTACGGTTGCCACTTGTGTTTTTGGATGCGAAGCGGCTGAGTCGGCTCATCATTTATTTCTATCTTGTAGTATTGCTGGATCGCTTTGGGATTTAGTTCGCGCATGGATTGGCATTTCCTTGGTGGATTCCACTTCTCTGCGTGATCATTTTGTTCAGTTTACGGCTTTATCAGGTGGATCTCGGGCGAGACGGTCCTTTCTGCAGCTTGTTTGGCTCGCTTGTGTTTGGGTGTTATGGACAGAGAGAAATCATCGGTTGTTCAAGGGCTCAACGGGCACACCTCATATTTTATTGGACAA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1702
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tpr2g4342 1701 PANTHER OS01G0885550 PROTEIN 932 1596 - -
Tpr2g4342 1701 ProSiteProfiles Reverse transcriptase (RT) catalytic domain profile. 1016 1275 IPR000477 -
Tpr2g4342 1701 SUPERFAMILY DNA/RNA polymerases 984 1247 IPR043502 -
Tpr2g4342 1701 CDD RT_nLTR_like 1030 1275 - -
Tpr2g4342 1701 Gene3D Endonuclease/exonuclease/phosphatase 560 765 IPR036691 -
Tpr2g4342 1701 ProSiteProfiles START domain profile. 29 76 IPR002913 GO:0008289
Tpr2g4342 1701 Pfam Domain of unknown function (DUF4283) 178 229 IPR025558 -
Tpr2g4342 1701 Pfam Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) 1035 1275 IPR000477 -
Tpr2g4342 1701 SUPERFAMILY DNase I-like 563 764 IPR036691 -
Tpr2g4342 1701 Pfam zinc-binding in reverse transcriptase 1508 1596 IPR026960 -
Tpr2g4342 1701 PANTHER REVERSE TRANSCRIPTASE ZINC-BINDING DOMAIN-CONTAINING PROTEIN-RELATED-RELATED 932 1596 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Tpr2g4342 Tpr-Chr2 47146387 47159690 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Tpr2g4342 32 121 Homeobox Transcription Factor Family AT3G61150 38.889 2.63e-11 67.0
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tpr2g4342 - - mtr:MTR_7g083690 702.975