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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tpr2g4299 ATGTCTTCTGAACATAATGATACAATTGCTCAATTAAGAACATGCGTATACCTGCCTCCGCGGGTTGGTCTAATCTTTGCAGCTACATTCAATAAAACATGGACTGGAAAAATGAAGATGTTGTTCTACTTTGATTCACAAGAAAATCTAGGACTAATTTCAATGTTTGGGTACATGCTCTTCCTATTCTACATTGGTGTTAAAACAGAAATGAGTGTAGTCCACAAAACTAGAAGTGGTGTCACTAACATAGGAGTTATTGGTATAATAGCTCCATATTTATGTGGCATGGCTGTTCTAAATTCCTACTCATCAAAATACCTAACAGATTTGCAAGTAAGACTCCTTGGAGCTATCATTGGATTGTTTAGTATGGCCCCTTTTCCTGTCATTTCCTCAACTTTAAGTGATCTCAAGATTCTCAATTCAGAATTGGGCCGAATTGGTCTATCAGCATCATTAGTTAGTGAGCTTTTCAATGTGTTCTTAGCATCAATGATAACAATTTCTAAATTACGTGAAGAGCGTGGTGAAGTGAATGCTATGCTTTGTGCTTTGGCTGCTATCTTGTATATACTCTTGGTTATATTCATTATTCGACCAGCGATGTTTTGGATTATAAAACAAACACCAGAAGGTTCGCATGTGAGTGATAACTATGTCTATAGTATACTCACACTAACTTTGTTTACAGGCTATGCTTCATATAGATTTGGATTCTTTGCACTTTTTGGACCATTTATATTGGGTTTGGCTATTCCAGAAGGACCTCCATTAGGCACAGCTATTGTCAAAAAAATCGATACTTTTGTTAATGAGATTTTCTTCCCCATTTTTGTGACCACATGTTGTATGAGGGTAGATTTGAAAGACTTGTTGATTTGGAGAAATCAAAGTGATGGAAGTGTTGATTATTTTATGGTACAAACTTTGGTTATTGTTCAAGTCATTGTTGTTACCAAATTTGTTGCTTGTATGATAATTCCTTTACGCAATGGGATGCCATGGAACGATGCTATTTGCTTATCTTTGATTATGAGTTCCAAAGGCTTTGTTGAAATGGTTGCTTTCTCTTTGGTCAGAGATTCCAAAGGTCTACCAGGTAACATCTTTGCATTATTGATGATATGCATCATAGTAAACTCAACATTGATTCCAATGATGTTGGGTTATATGTACGATCCAACAAAGAAATACGCAGGTTACATAAAGAGAAACATAGCAGATCTAAAAAGTAACTCAGAATTTCGAGTTTTAGCATGTATTCATAGACCAAACAACATTCCTGCAACAATAAATCTTCTAGAAGCAACATATCCAACAAAAGAAGAACCAATATGTACTTATGCACTTCAACTCGTGGAATTAATAGGAAGAGCTTCACCAATTTTCATCTCTCATAATCTTCAAAAAAAGAATAAATCAAATTCAGACACATCAATGGCAGATAAGTTACTTGAATCATTTAGAAGTTTCGAAAGAGAGTTCCAAGATTGTTTAGTTGTCAATGCATTCACAGCTATCTCACCACCAGAAATGATGTACGACGACATTTGCACATTAGCACTCGATAACTTTACATCACTTATTATTCTTCCTTTTCATCGACAATGGTCTTGTGATGGTAACTCAGTCGAGCTTGAAGACGAGTCATTAAGGGACATAAACTATAGAGTTCTGGAAAGAGCACCATGTTCTGTTGGTGTTTTAATCGAACGAGCACAAATGACACATATTTTTTCACCCGAAACACCATATAAAGTGTGTTTGATATTTATAGGTGGGAAAGATGATAGAGAAGCACTTTTTTTCACAAAGAGAATGACTAAGAATCCACATGTGAAACTTACAGTGGTTCGATTCTTGTCCTGCGATGATGATGTTGACGATGATTCGAAGGGAAGTGGTTGGGAGAATAAACTTGATAATGAACTGTTGGATGAAATTAAGACAAAGAATAAGATTGGTAATGTTAGTGTTAAATATGTTGAGAGAACAGTGAAAGATGGACCAGAAACAGCATTGATTATAAGGTCTTTGGCCACTGAATTTGACTTGATTGTTGTTGGGAGACAAGCTGGTGTTGAAACTCCTCAAACTTCTGGATTGTTGCAATGGAGTGAGTATTCTGAACTTGGTGTTTTGGGAGATTTGTTGGTTTCTACTGATGCTGGTGGTAAAGCTTCTGTTTTTGTTATACAACAACAAAGAACAACTATGGATGTTTAA 2229 0.358 MSSEHNDTIAQLRTCVYLPPRVGLIFAATFNKTWTGKMKMLFYFDSQENLGLISMFGYMLFLFYIGVKTEMSVVHKTRSGVTNIGVIGIIAPYLCGMAVLNSYSSKYLTDLQVRLLGAIIGLFSMAPFPVISSTLSDLKILNSELGRIGLSASLVSELFNVFLASMITISKLREERGEVNAMLCALAAILYILLVIFIIRPAMFWIIKQTPEGSHVSDNYVYSILTLTLFTGYASYRFGFFALFGPFILGLAIPEGPPLGTAIVKKIDTFVNEIFFPIFVTTCCMRVDLKDLLIWRNQSDGSVDYFMVQTLVIVQVIVVTKFVACMIIPLRNGMPWNDAICLSLIMSSKGFVEMVAFSLVRDSKGLPGNIFALLMICIIVNSTLIPMMLGYMYDPTKKYAGYIKRNIADLKSNSEFRVLACIHRPNNIPATINLLEATYPTKEEPICTYALQLVELIGRASPIFISHNLQKKNKSNSDTSMADKLLESFRSFEREFQDCLVVNAFTAISPPEMMYDDICTLALDNFTSLIILPFHRQWSCDGNSVELEDESLRDINYRVLERAPCSVGVLIERAQMTHIFSPETPYKVCLIFIGGKDDREALFFTKRMTKNPHVKLTVVRFLSCDDDVDDDSKGSGWENKLDNELLDEIKTKNKIGNVSVKYVERTVKDGPETALIIRSLATEFDLIVVGRQAGVETPQTSGLLQWSEYSELGVLGDLLVSTDAGGKASVFVIQQQRTTMDV* 743
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tpr2g4299 742 PANTHER CATION/H(+) ANTIPORTER 4 22 739 - -
Tpr2g4299 742 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 14 388 IPR006153 GO:0006812|GO:0015299|GO:0016021|GO:0055085
Tpr2g4299 742 Gene3D - 456 701 - -
Tpr2g4299 742 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 22 739 - -
Tpr2g4299 742 Gene3D - 14 400 IPR038770 -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Tpr2g4299 Tpr-Chr2 46405868 46408678 Dispersed/Transposed
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Tpr2g4299 23 737 Antiporter Super Family AT5G22900 36.048 1.40e-157 476
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tpr2g4299 - - cam:101496863 1099.35