Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tpr2g4186 ATGAGTGTAGTCCACAAAACTAGAAGTGGTGTCACTAACATAGGAGTTATTGGTATAATAGCTCCATATTTATGTGGCATGGCTGTTCTAAATTCCTACTCATCAAAATACCTAACAGATTTGCAAGTAAGACTCCTTGGAGCTATCATTGGATTGTTCAGTATGGCCCCTTTTCCTGTCATTTCCTCAACTTTAAGTGATCTCAAGATTCTCAATTCAGAATTGGGCCGAATTGGTCTATCAGCATCATTAGTTAGTGAGCTTTTCAATGTGTTCTTAGCATCAATGATAACAATTTCTAAATTACGTGAAGAGCGTGGTGAAGTGAATGCTATGCTTTGTGCTTTGGCTGCTATCTTGTATATTCTCTTGGTTATATTCATTATTCGACCAGCGATGTTTTGGATTATAAAACAAACACCGGAAGGTTCGCATGTGAGTGATAACTATGTCTATAGTATACTCACACTAACTTTGTTTACAGGCTATGCTTCATATAGATTTGGATTCTTTGCACTTTTTGGACCATTTATATTGGGTTTAGCTATTCCAGAAGGACCTCCATTAGGCACAGCTATTGTCAAAAAAATCGATACTTTTGTTAATGAGATTTTCTTCCCCATTTTTGTGACCACATGTTGTATGAGGGTAGATTTGAAAGACTTGTTGATTTGGAGAAATCAAAGTGATGGAAGTGTTGATTATTTTATGGTACAAACTTTGGTTATTGTTCAAGTCATTGTTGTTACCAAATTTGTTGCTTGTATGATAATTCCTTTACGCAATGGGATGCCATGGAACGATGCTATTTGCTTATCTTTGATTATGAGTTCCAAAGGCTTTGTTGAAATGGTTGCTTTCTCTTTGGTCAGAGATTCCAAAGGTCTACCAGGTAACATCTTTGCATTATTGATGATATGCATCATAGTAAACTCAACATTGATTCCAATGATGTTGGGTTATATGTACGATCCAACAAAGAAATACGCAGGTTACATAAAGAGAAACATAGCAGATCTAAAAAGTAACTCAGAATTTCGAGTTTTAGCATGTATTCATAGACCAAACAACATTCCTGCAACAATAAATCTTCTAGAAGCAACATATCCAACAAAAGAAGAACCAATATGTACTTATGCACTTCAACTCGTGGAATTAATAGGAAGAGCTTCACCAATTTTCATCTCTCATAATCTTCAAAAAAAGAATAAATCAAATTCAGACACATCAATGGCAGATAAGTTACTTGAATCATTTAGAAGTTTCGAAAGAGAGTTCCAAGATTGTTTAGTTGTCAATGCATTCACAGCTATCTCACCACCAGAAATGATGTACGACGACATTTGCACATTAGCACTCGATAACTTTACATCACTTATTATTCTTCCTTTTCATCGACAATGGTCTTGTGATGGTAACTCAGTCGAGCTTGAAGACGAGTCATTAAGGGACATAAACTATAGAGTTCTGGAAAGAGCACCATGTTCTGTTGGTGTTTTAATCGAACGAGCACAAATGACACATATTTTTTCACCCGAAACACCATATAATGTGTGTTTGATATTTATAGGTGGGAAAGATGATAGAGAAGCACTTTTTTTCACAAAGAGAATGACTAAGAATCCACATGTGAAACTTACCGTGGTTCGATTCTTGTCCTGCGATGATGATGTTGACGATGATTCGAAGGGAAGTGGTTGGGAGAATAAACTTGATAATGAACTGTTGGATGAAATTAAGACAAAGAATAAGATTGGTAATGTTAGTGTTAAATATGTTGAGAGAACAGTGAAAGATGGACCAGAAACAGCATTGATTATAAGGTCTTTGGCCACTGAATTTGACTTGATTGTTGTTGGGAGACAAGCTGGTGTTGAAACTCCTCAAACTTCTGGATTGTTGCAATGGAGTGAGTATTCTGAACTTGGTGTTTTGGGAGATTTGTTGGTTTCTACTGATGCTGGTGGTAAAGCTTCTGTTTTTGTTATACAACAACAAAGAACAACTATGGATGTTTAA 2019 0.3591 MSVVHKTRSGVTNIGVIGIIAPYLCGMAVLNSYSSKYLTDLQVRLLGAIIGLFSMAPFPVISSTLSDLKILNSELGRIGLSASLVSELFNVFLASMITISKLREERGEVNAMLCALAAILYILLVIFIIRPAMFWIIKQTPEGSHVSDNYVYSILTLTLFTGYASYRFGFFALFGPFILGLAIPEGPPLGTAIVKKIDTFVNEIFFPIFVTTCCMRVDLKDLLIWRNQSDGSVDYFMVQTLVIVQVIVVTKFVACMIIPLRNGMPWNDAICLSLIMSSKGFVEMVAFSLVRDSKGLPGNIFALLMICIIVNSTLIPMMLGYMYDPTKKYAGYIKRNIADLKSNSEFRVLACIHRPNNIPATINLLEATYPTKEEPICTYALQLVELIGRASPIFISHNLQKKNKSNSDTSMADKLLESFRSFEREFQDCLVVNAFTAISPPEMMYDDICTLALDNFTSLIILPFHRQWSCDGNSVELEDESLRDINYRVLERAPCSVGVLIERAQMTHIFSPETPYNVCLIFIGGKDDREALFFTKRMTKNPHVKLTVVRFLSCDDDVDDDSKGSGWENKLDNELLDEIKTKNKIGNVSVKYVERTVKDGPETALIIRSLATEFDLIVVGRQAGVETPQTSGLLQWSEYSELGVLGDLLVSTDAGGKASVFVIQQQRTTMDV* 673
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tpr2g4186 672 PANTHER CATION/H(+) ANTIPORTER 4 1 669 - -
Tpr2g4186 672 Gene3D - 1 330 IPR038770 -
Tpr2g4186 672 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 1 669 - -
Tpr2g4186 672 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 11 318 IPR006153 GO:0006812|GO:0015299|GO:0016021|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Tpr2g4186 Tpr-Chr2 44666522 44668640 Transposed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Tpr2g4186 55 667 Antiporter Super Family AT5G22900 38.715 2.28e-155 467
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tpr2g4186 - - cam:101496863 1021.92