Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tpr2g0970 ATGGGCAGTGAAGGGTACCATCAAATAGCATGTTATAAAGTGGATGTGCATAATCCAAGTAGAATATGGCAAACTCGAAATATTTTAACAGATGAGCTTTGTGTTCTTGCCATTCAAGTTATCTTTACCGTAGTTTTGTCTCGTTTTCTATTCGTTATGTATAAACCCCTTCATCAACCTCGACTCATTTCACAAATCTCTGTTGGTTTTATACTAATTCAAGCACTTGGGATGTTCCCACCTCTGTTTGGCATTATTTATCCTGCATCTGGGGTGATTAACATCGACGTTCTAACACATACTGGAGTTGTATACTACGCATTCCTTAGTGGTTTGGAGATGAACTTGAATACAATTTTACATGCAAATAAGAAAGCTGCAACGATTGCGATTTCAGGAATCATCTTCCCAATTGTGATAGGACCACCTTTATACGCTATGCATCGAAAAGTTTATGCCAATGGGGATGTATATCCACTTGAAGAAAGTACAGTGAATGCTTATGTAGTATGGACTTTAGTTCTCACTATAACAGGTTTTCCAGTTGTAGTTCACTCACTTTCTGAGCTCAAACTTCTTTATACTGGCCTTGGTAAGGATGCATTAACATCAGCTATGATAAGTGACACATATGGTTGGATTTTATTCACATTATTTGTTCCATTTTCAATTAATGGTAAAAGGGCTATATACTCGGTATTAAGCACCATAATATTTGTTTTCATATGCATCTATGTGGTGCGCCCTTTCGTTGTAAAAGTCATTGATCGCAAGACAGAAAGAGATGAATGGGATGATAGCCAATTACTCTATGTGGTGATGGGGATTTTCGTTTGTGCATACATAACAGATACTCTTGGAACACATGGCGTTGTTGGAGCTTTTGTGTACGGGTTGATTTTACCTCACGGTAAATTTGCTGACATGGTGGCGTCAAAGACTGATGATTTTGGTGGTGCATTTCTAGCGCCGCTATTCTTTAGTGGCAGTGGAATGCGACTCTCAATGAGTACCATTTTCGTCCAGAAGAATTGGCCTTTTACACTTATGGTTATAATCTTGTTGTGTCTTCCAAAGATTTTAGGCACTTTATTTGCCACTTTCTTTTTTGGCACGCCTGCTCGTGACAGTCTTGCTCTAGGATTAATTCTTAATACCAAAGGTGCTATTGCACTCATAATGCTCAATACTGCTTGGGATAAATTGATTATTTCTGGACCAACTTACACTGTTATAACCTCTGGAGTCCTTTTAATGACTATAGTGGTGCCTCCCATCGTCAATGCAATATACAAGCCCAGAAAACGATTTGAGCAAAACAAGCTAAAGACTATGGAGAAGTTAAGATTTGATGCTGAACTTAGGATTCTAGCATGTGTTCACAATACTCGTCAGGCTGCGGGGATTATTAGTCTCATCGAATATTTCAATGCCACTAGACTTTCACCGATACATGTTTTTTCACTTTATCTTGTGGAGCTCACAGGACGTGCTGGTGCACTTGTTGCTGCTCATATGGAGAAGCCCGGTGGCCAACCTGGAGCACAAAATCTTACAAGATCCCAGGTAGAGCTAGAAAGTATTAATAGTATCTTTGGAGCATTTGGAGAAGCATATGATGCTGTCAGAGTGGAAACCTTAAATGTTGTGTCAGCTTATTCAACCATTCACGAGGACATATACAACTCTGCTAATGATAAACGCACAAGCTTGATTATCCTACCATTCCACAAACAAGTAAGTTCAGAAGGTGCACTTGAAACAACTAGTATTGTGTACAAAGATATAAACATGAATGTGATGCAAAGTGCACCTTGCTCTGTGGGAATCTTTGTTGATCGTGATCTTGGGCTATTGTCGAAAACAAAATTTTGTATTTGTATGATCTTTATTGGAGGTCCCGACGATCGTGAAGCTTTAGCTGTTGCATGGAGGATGGCTGGGCACCCAGGAACCAAATTATCAGTGGTTCGAATGCTCTTGTTTGATGAAGCTGCAGAAGTAGACACTTCATGTCACACTGAAGCACAAGGCATACTATCTGTTGTAATGGATAGTGATATGCAAAATGACTTGGATGACGAGTATTTGAATTCCTTTAGACTGACAGCAGTGAGCAACAATGATTCTATGTCTTATTCAGAGGTTGATGTTCATTCAGGTGAAGATATTCCCATAGTCCTCAATGAGCTAGAGAGTTTAGGCTGTGATTTATACATAGTTGGACAAGGGAATCGTAGGAACTCTCAAGTCTTTTCAAATTTATTGGAATGGTGTGATTGTTCAGAACTTGGAGTTATAGGGGATATGTTGGCCTCAGAAAATTTTGGTTCGCGCTCATCTGTGCTAGTTGTGCAACAATATGGGTATGGAGGAATGGTTTTACCAAATCAACACGACCACCTGACAACTAATAACGATGGTGTTGAGGCACTTGTCGTGAAGACAGAATAA 2454 0.3949 MGSEGYHQIACYKVDVHNPSRIWQTRNILTDELCVLAIQVIFTVVLSRFLFVMYKPLHQPRLISQISVGFILIQALGMFPPLFGIIYPASGVINIDVLTHTGVVYYAFLSGLEMNLNTILHANKKAATIAISGIIFPIVIGPPLYAMHRKVYANGDVYPLEESTVNAYVVWTLVLTITGFPVVVHSLSELKLLYTGLGKDALTSAMISDTYGWILFTLFVPFSINGKRAIYSVLSTIIFVFICIYVVRPFVVKVIDRKTERDEWDDSQLLYVVMGIFVCAYITDTLGTHGVVGAFVYGLILPHGKFADMVASKTDDFGGAFLAPLFFSGSGMRLSMSTIFVQKNWPFTLMVIILLCLPKILGTLFATFFFGTPARDSLALGLILNTKGAIALIMLNTAWDKLIISGPTYTVITSGVLLMTIVVPPIVNAIYKPRKRFEQNKLKTMEKLRFDAELRILACVHNTRQAAGIISLIEYFNATRLSPIHVFSLYLVELTGRAGALVAAHMEKPGGQPGAQNLTRSQVELESINSIFGAFGEAYDAVRVETLNVVSAYSTIHEDIYNSANDKRTSLIILPFHKQVSSEGALETTSIVYKDINMNVMQSAPCSVGIFVDRDLGLLSKTKFCICMIFIGGPDDREALAVAWRMAGHPGTKLSVVRMLLFDEAAEVDTSCHTEAQGILSVVMDSDMQNDLDDEYLNSFRLTAVSNNDSMSYSEVDVHSGEDIPIVLNELESLGCDLYIVGQGNRRNSQVFSNLLEWCDCSELGVIGDMLASENFGSRSSVLVVQQYGYGGMVLPNQHDHLTTNNDGVEALVVKTE* 818
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tpr2g0970 817 Gene3D - 35 441 IPR038770 -
Tpr2g0970 817 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 41 428 IPR006153 GO:0006812|GO:0015299|GO:0016021|GO:0055085
Tpr2g0970 817 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 21 802 - -
Tpr2g0970 817 PANTHER CATION/H+ EXCHANGER 3 21 802 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Tpr2g0970 Tpr-Chr2 11614973 11617983 Dispersed/Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Tpr2g0970 9 788 Antiporter Super Family AT2G13620 36.283 2.15e-172 516
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tpr2g0970 - - gmx:100804266 1177.93