Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tpr1g0259 ATGATTGGCACACTAACACTACCTAGCTCACACATCTTCAAATTCAGTGATAACAAAATGGTTGAAGGTGTTGGTAGCTCTATGGGGTTATCAGAAAAGAAAAACCTCATAATCCAAGTCATCACAGGACGGTGGTTTGTAGTGTTTGCTTCCTTTCTAATCATGTCAGCTTCTGGAGCCACCTACATGTTCAGTATTTACTCCGGCACCATAAAAAGAGCCTTAGGCTATGACCAAACAACTCTTAACCTCCTTAGTTTCTTCAAAGACTTAGGTGGTAACCTTGGTATTTTCTCTGGTTTAATCAATGAAATCACACCACCTTATGTTGTTCTTGCAATGGGTTCAGTTCTTAACTTTTTTGGTTATTTCATGATTTGGTTAGCAGTGACCAAAAAAATTTCAAAACCAAAAGTTTGGCAAATGTGTCTTTATATTTGTATAGGTGCTAATTCTCAGTCTTTTTCAAATACTGGTTCACTTGTTACTTGTGTTAAGAATTTCCCCGAAACACGCGGCGTTGTTTTGGGGATTTTGAAAGGTTTTGTTGGTCTTAGTGGTGCTATTATCACACAACTTTATTATGCTATTTATTTTGATGATCCAAAAGCTTTGATTTTACTCATTGCTTGGCTTCCTGCTGCAATTTCCTTTCTTTTTCTTCGAACCGTTCGATATATGAAACCAGTTAGACAGACCAATGAACTTGATGTTTTCTATAAGTTTTTGTATATTTCACTTAGTCTAGCTGGTTTTTTATTGGTTATGATTATACTACAGAACAAATTGTCTTTTAAACAAAGTGAGTATATTGGAAGTGCTTCTGTAGTGCTTATTTTGTTGTTCCTACCTATTGCTGTGGTTTTCGTCGAACAGAAAAAGATTTACACGAGTCAAAAACTTGCATTTGTCGATCCATTTTCGGTTAAAATAGTAACCGATCAAGGAGCAAAAAATGGTGATAATAACAATGCAATGGTTAGTGTTGAAGAAAAAGAAACTAGATGGTGGCAAAATATTTTTAGTCCACCAGAAAAAGGTGAAGATTATACAATACTTCAAGCACTTTTCAGCATAGACATGATATTGCTATTTTTTGCTGGTACCTGTGGTGTTGGTGGAACATTAACAGCAATTGATAATTTGGGTCAAATTGGAATATCACTTGGATATCCAAAAAAAAGTATAAGCACATTTGTTTCATTAGTGAGTATTTGGAATTACCTAGGAAGAGTTTTCTCAGGTTTTGTTTCAGAACATGTTTTAACAAAGTACAAATTTCCAAGACCACTTATGTTAACATTAACTCTGTTTTTATCTTGTGTCGGTCACTTATTAATAGCCTTTGATGTTCAAAATGGTCTTTATTTTGCTTCAGTAATCATTGGTTTTTGTTTTGGTGCACAATGGCCATTAGTTTTTGCCATAATTTCAGAGTTATTTGGTTTGAAATACTATTCAACTTTGTACAACTTTGGTGGGGTAGCTAGTCCAATTGGACTATATTTCCTTAATGTTAGGGTCACTGGTCATTTATATGACAAAGAAGCTAAGAGACAATTGGTTGCAAGAGGAGTACCAAGAAAATTGGGTGAGGAATTGAATTGTGTAGGAGCAAGTTGTTATAAATTGTCTTTCATTATTATCACTGCAGCTACTTTGATTGGTGCTTTTATTTCACTTATTTTGGTGGCTAGAACTATTCAGTTTTATAAAGGTGATATATACAAGAGGTACCGATCGGAACCGGTGGAAGTTGAAGGTGATACGGCTGAGATGAAGGTGGTCCAAAGTGGTGGTGAAAGAGGTCAAGATGAAGCAAAAGCTGCAGAGAAGTAG 1839 0.3535 MIGTLTLPSSHIFKFSDNKMVEGVGSSMGLSEKKNLIIQVITGRWFVVFASFLIMSASGATYMFSIYSGTIKRALGYDQTTLNLLSFFKDLGGNLGIFSGLINEITPPYVVLAMGSVLNFFGYFMIWLAVTKKISKPKVWQMCLYICIGANSQSFSNTGSLVTCVKNFPETRGVVLGILKGFVGLSGAIITQLYYAIYFDDPKALILLIAWLPAAISFLFLRTVRYMKPVRQTNELDVFYKFLYISLSLAGFLLVMIILQNKLSFKQSEYIGSASVVLILLFLPIAVVFVEQKKIYTSQKLAFVDPFSVKIVTDQGAKNGDNNNAMVSVEEKETRWWQNIFSPPEKGEDYTILQALFSIDMILLFFAGTCGVGGTLTAIDNLGQIGISLGYPKKSISTFVSLVSIWNYLGRVFSGFVSEHVLTKYKFPRPLMLTLTLFLSCVGHLLIAFDVQNGLYFASVIIGFCFGAQWPLVFAIISELFGLKYYSTLYNFGGVASPIGLYFLNVRVTGHLYDKEAKRQLVARGVPRKLGEELNCVGASCYKLSFIIITAATLIGAFISLILVARTIQFYKGDIYKRYRSEPVEVEGDTAEMKVVQSGGERGQDEAKAAEK* 613
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tpr1g0259 612 Gene3D MFS general substrate transporter like domains 356 571 IPR036259 -
Tpr1g0259 612 Gene3D MFS general substrate transporter like domains 40 232 IPR036259 -
Tpr1g0259 612 PANTHER UNCHARACTERIZED NODULIN-LIKE PROTEIN 28 599 - -
Tpr1g0259 612 CDD MFS_Mch1p_like 43 557 - -
Tpr1g0259 612 SUPERFAMILY MFS general substrate transporter 44 568 IPR036259 -
Tpr1g0259 612 Pfam Nodulin-like 44 289 IPR010658 -
Tpr1g0259 612 PANTHER MFS TRANSPORTER 28 599 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Tpr1g0259 Tpr-Chr1 2173554 2175867 Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Tpr1g0259 34 582 Nodulin-like Gene Family AT2G39210 68.223 0.0 774
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tpr1g0259 - - gmx:100808975 917.531
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Tpr1g0259 1 2173554 2175867 Tpr1g0259 1 2173554 2175867 ECH