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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Sto5g4046 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3828 0.419 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1275
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Sto5g4046 1275 Pfam Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) 846 922 IPR000477 -
Sto5g4046 1275 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 8 652 - -
Sto5g4046 1275 PANTHER CATION/CALCIUM EXCHANGER 4 8 652 - -
Sto5g4046 1275 Gene3D - 416 643 IPR044880 -
Sto5g4046 1275 Gene3D - 182 307 IPR044880 -
Sto5g4046 1275 Pfam zinc-binding in reverse transcriptase 1138 1228 IPR026960 -
Sto5g4046 1275 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 491 642 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Sto5g4046 1275 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 152 294 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Sto5g4046 Sto-Chr5 49058198 49065930 Dispersed/Transposed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Sto5g4046 101 648 Antiporters AT5G17850 43.739 8.39e-120 382
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Sto5g4046 K13754 - gmx:100796101 996.882