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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Spst3g04670 ATGTTGAAGCTTTTGGTTAATAGAACGGCTAATGTTTCAACTTCTCGCAATCACAATGGCTTTGCCGCATTCAGTTTGTCTAGCGATGTGTACGAGGTTACCGTTGGAAAGCAGCTTAGCTCTAAGCTGAGTACTGGTCAGAGCTCCAAGCTGAGTACTGCTCAGAAATTGAGTACTGTCCAGAAATTTAGTCAAGAGCAGCTGGAGCATTGCATTACTTTATATTATTTGGTCATATTTTGTTGTGCACTAACGTGTGTTCATTCACTACAATTTGCGACTGTAGATGCAGAAGAGGTATCAGGTTCTAGGCCTGCTGAAGTTTTGAACCTGGTGCAAAGTAAATGGGTAGGATCTTCAAATTTGAATACAGTTGTGGATCCGTTAAATGGTGACTCATTTATTAAAGTTGCTGAAGTTGACGAAACAGGCATTCAGCCCTTTGTGGAAAGCTTGTCCAGCTGTCCCAAACATGGTGTACACAATCCTTTTAAGGCACCAGAGAGGACTGTTGCCCTAATGGGATTTTGCTGCGGAGTTATGCATAGGTGGATTATCTTGATTAATCCCAGAGGTTTCAACCTTTTTGCGCTCAGGTATTCTAAAGCTGCCTATGATAAATATCTTATGTATGGAGACATATCTACTAAGGCAGCTCACATGCTATCACTTCCTAAGGTTTCAGATTTCTTTACAAGGTTAATACAAAGAGTTTCTCCAAAGAGTTACCAGCAGGCTTTTGGAGAAGTCTATGTGACACAAAAGTTTCTAGAGAATTTTTGCGGGGATCAGGTTCGTTTCTTAGCAAGATCATTTGCAGTACCCGGAAATCATCTTGGACAACAAAGTCATGGTTTTCGTTGGCCCTATGGTCCTGTGGCAATTATTACTCCTTTTAATTTTCCCTTAGAGATTCCTGTTCTTCAATTGATGGGTGCACTCTATATGGGCAACAAACCAGTCCTTAAAGTTGATAGCAAGGTGAGCATTGTCATGGAACAAATGTTACGTCTGCTTCACACCTGTGGCTTACCTGTTGAAGATGTAGACTTCATAAATTCTGACGGGAAGACAATGAACAAACTGTTACTGGAGGCAAATCCACGAATGACCCTTTTTACTGGTAGTTCAAGAGTGGCTGAGAAGTTAGCCCTTGATTTGAAGGGCCGTGTTAAATTGGAAGATGCTGGATTTGACTGGAAAATACTGGGTCCTGATGTCCATCAGGAAGATTACACTGCGTGGGTGTGTGATCAAGATGCATATGCATGCAGTGGTCAGAAATGCTCTGCCCAATCATTATTATTTATGCACGAGAACTGGTCTAAAACTTCCTTGCTATCGAAGTTAAAAGATCTTGCTGAAAGAAGAAAGTTGACAGACTTGACAATTGGCCCAGTCCTCACAGTTACGACTGATTCTATGCTTGAACATGTCAATAAGTTGCTTGAGATACCAGGATCAAAGCTGCTCTTCGGAGGTCGACCTTTGGAGGATCATTCAATTCCGTCTATTTATGGTGCTATTAAACCAACAGCTGTTTATGTTCCTCTTGAGGAAATTATGAAGGATAACAATTTTGAACTTGTGACAAAAGAAATATTCGGACCCTTCCAGATTATTACCGATTACAAAAATAGTCAACTATCAGTTGTATTGGATGCTTTGGAAAGAATGCATAACCATTTGACAGCTGCTGTAGTTTCGAATGATCCTTTATTTGTGCAGGAAGTCATTGGCAAGACGGTAAATGGTACTACTTATGCTGGTTTAAGAGCAAGGACAACCGGAGCTCCACAGAATCATTGGTTTGGACCCGCCGGTGATCCTAGAGGTGCAGGAATTGGTACTCCAGAGGCCATAAAACTTGTATGTCTGCTTCCTCTTATCAACGCCTGCCAGAATATCCTTCGAATTGCGCCTGTGCCTGTATCAGAGTCTGACGCCTGCCAAAATATCCTTCGAATTGCACCTATGCCTGTATCAGAGGTGTATGACGATGGTTCGTATGATGATTGTTTATACTGGGTGTATGACGATGGTTCGTATGATGATTGTTCGTACTGGGTGTATGACGATTGCTCGTACTGGGTGTATGATGATTGTTCATATTGGGTGTATGACGATGGTTCGTATGACGATTGTTCGTATTGGGTGTATGAAGATGGTTCGTATGACGATTGTTCGTACTGGGTGTATGACGATTGTTCGTATGACGATGGTAATCAGTACCATGCTGGAATCGGTACCTTTGCCCTTATAGATCCATGTGTAGCTTTGACATCAACAGTTGCTTCAGTAGCCAATGTGCTGAATCTTGCAATTTCAACCATGACTTTGTTAGAGGTAATCAAGGATGCTTCAATCAATTCAAAACCGCTTGATTTACCTTTGGATTACCCAATTGTTCTGAACCCAGATAGTATCTTACCCAATTTAAAGCCAAAAGACATAGATGAATCTTCTTCATCACTCATAAAGCCCCTTATCGGATGGAATGTTCCGCCAACTGTTGCTGAGATCACTGACATTAACAAAAAGTTCTTTACACAGCTGAATGCTAGGTTCATGAACACTAATAATTTGGATAAGGGTGAGTTTATTAGTAGTTTGAAGTCTTATCTAGAAAACATCAGGGACAAAGTAGGGGTTGTGATTGAGGTCGATACGTCCAGTAGTGATTATAACAGGATTTTGATTGATAAGCTTGGAACATTCGTGGGTAAAGATGTTGCTGGCCTGGTATTGAATGGGTGTGTATCTTTGGAGATTTGGGACGTGATTGAGGCTTTGATTGTTAATGTTACTATTGAGCATTCTTGCTATTCAAACCTGATTACCAAATTAGTGGAAAAAAAGAGGTCTTATTTGCTCTGTTTGTGCATAAAGCATGTTTGGGATCTTGGTTCATCAGAAATAATCACCATTTTGAGGTATTTTCTTTCTCCATCCAAAGATGCTTATGACAGTATGGTAACTGTGAAGCTGGAGTGGGAGAGCCAAGCAGTGTTAGCCATTGAGACAGCAAGTGATAGCAAGCTGAAGACGAAGAAATTGGTTATGGCAAAGGAGGCTTCCATTTTGCTTATGATGGCATATGATGGTTTCTCTGCGTCTGAGACTTGTTTGCATTATCTGATTGCTTCATCCAACATCAATGACGTGGTGCTATCCCCTTCATTCGGTAAGTTGAATGGAAAAGAATTACTAAATTTGATTCGCTATTTAGCCAAATGGTTGAAGAAATACCAGAGGTTTCCACAAGCACGACCATGTCCGAGAGCCTCGTCGGTTTTGAATTTGAAGGCTTGCGATTGGGTTCCTAAACTCGAAGATGTTATAAAATATCTTGGCTTGGTGCTTGATGAGAAATTTTCGTCATTGGTGTTACATCCATTGTTTCACGAGGAGCTGAGATCAATTGAAGAAATGGTTAGTTGTTTAACTTCTGAAGCCAAATTTTGTAACTTAATGGCTGATGTAATCGACATACTAAAGATCGATCGTGAAAATTTGTAA 3519 0.4069 MLKLLVNRTANVSTSRNHNGFAAFSLSSDVYEVTVGKQLSSKLSTGQSSKLSTAQKLSTVQKFSQEQLEHCITLYYLVIFCCALTCVHSLQFATVDAEEVSGSRPAEVLNLVQSKWVGSSNLNTVVDPLNGDSFIKVAEVDETGIQPFVESLSSCPKHGVHNPFKAPERTVALMGFCCGVMHRWIILINPRGFNLFALRYSKAAYDKYLMYGDISTKAAHMLSLPKVSDFFTRLIQRVSPKSYQQAFGEVYVTQKFLENFCGDQVRFLARSFAVPGNHLGQQSHGFRWPYGPVAIITPFNFPLEIPVLQLMGALYMGNKPVLKVDSKVSIVMEQMLRLLHTCGLPVEDVDFINSDGKTMNKLLLEANPRMTLFTGSSRVAEKLALDLKGRVKLEDAGFDWKILGPDVHQEDYTAWVCDQDAYACSGQKCSAQSLLFMHENWSKTSLLSKLKDLAERRKLTDLTIGPVLTVTTDSMLEHVNKLLEIPGSKLLFGGRPLEDHSIPSIYGAIKPTAVYVPLEEIMKDNNFELVTKEIFGPFQIITDYKNSQLSVVLDALERMHNHLTAAVVSNDPLFVQEVIGKTVNGTTYAGLRARTTGAPQNHWFGPAGDPRGAGIGTPEAIKLVCLLPLINACQNILRIAPVPVSESDACQNILRIAPMPVSEVYDDGSYDDCLYWVYDDGSYDDCSYWVYDDCSYWVYDDCSYWVYDDGSYDDCSYWVYEDGSYDDCSYWVYDDCSYDDGNQYHAGIGTFALIDPCVALTSTVASVANVLNLAISTMTLLEVIKDASINSKPLDLPLDYPIVLNPDSILPNLKPKDIDESSSSLIKPLIGWNVPPTVAEITDINKKFFTQLNARFMNTNNLDKGEFISSLKSYLENIRDKVGVVIEVDTSSSDYNRILIDKLGTFVGKDVAGLVLNGCVSLEIWDVIEALIVNVTIEHSCYSNLITKLVEKKRSYLLCLCIKHVWDLGSSEIITILRYFLSPSKDAYDSMVTVKLEWESQAVLAIETASDSKLKTKKLVMAKEASILLMMAYDGFSASETCLHYLIASSNINDVVLSPSFGKLNGKELLNLIRYLAKWLKKYQRFPQARPCPRASSVLNLKACDWVPKLEDVIKYLGLVLDEKFSSLVLHPLFHEELRSIEEMVSCLTSEAKFCNLMADVIDILKIDRENL 1172
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Spst3g04670 1172 FunFam Aldehyde dehydrogenase 12 405 593 - -
Spst3g04670 1172 Pfam Aldehyde dehydrogenase family 228 590 IPR015590 GO:0016491
Spst3g04670 1172 Gene3D Aldehyde Dehydrogenase; Chain A, domain 1 106 407 IPR016162 GO:0016491
Spst3g04670 1172 Gene3D Aldehyde Dehydrogenase; Chain A, domain 2 408 591 IPR016163 GO:0016620
Spst3g04670 1172 PANTHER F6A14.6 PROTEIN 778 1170 - -
Spst3g04670 1172 ProSitePatterns Aldehyde dehydrogenases cysteine active site. 422 433 IPR016160 GO:0016491
Spst3g04670 1172 SUPERFAMILY ALDH-like 221 615 IPR016161 GO:0016491
Spst3g04670 1172 FunFam probable aldehyde dehydrogenase 196 397 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Spst3g04670 Spst-Chr3 98487105 98501726 Dispersed/Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Spst3g04670 88 624 Aldehyde Dehydrogenase Gene Family AT5G62530 77.323 0.0 885
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Spst3g04670 K00294 - gmx:100806579 931.398