Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Spst2g02207 ATGCAGCAAGCTGGGCAATCGCTTTATGATCCTCGGGTTCCTCACCTTAAAAAGCTGCTTCATGGGAATTTTTTCTTTCCTTCTGAAAAATTCTTAGATCCTGAAATTTTGGATACTTTAGTTTGCCTTGGACTTAGGACAACTCTGGGATTTACTGGCTTGCTTGATTGTGCTAGATCAGTCAGCCTCTTGCATGATTCTAGGGACATTGATGCCTTCAAACATGGTGGAGAGTTACTGAGCCTTTTAGATACATTAGCATGTAAGCTCGCAAATAAAGGAGAATGTGATAATGATGATCAACAGGGTGGTGTGGCTCTGGGAAGTAGTAGCATGCAGGGTGATGCTTTTGTATATGATGGCTTTCCTAAAGATGAGACCTGCCTAACTAATATTGATTCAGTTTTAAGCAGCTCAACATGTGATATGGTAGAAGAAGAATTTTGGTCTGAATTGAAGCTAATCTCTTGGTGTCCAGTAATTTCTGATCCAGTTGTGACGGGACTTCCATGGTTAAAATCCAAAAACCAAGTAGTAGCACCCCCCACTAGAGTGAGGCCTAAATCACAGATGTGGATGGTATCTTCCTCAATGTTCATTTTAGATGGTGAATGTAACACTACATATCTACAAAATGAACTCGGGTGGATGGGTTGCCCTAATGTCAGTGTTTTAACAAGACAGTTAATTGAGTTATCTAAGTCCTATCAGCAACTTAAGATAAATTCACTGCTGGATCCTGGTTTTGATGCTCAGTTGCAAAAGGAGATACCTTGCCTTTACTCAAAATTGCAGGAATATATTAATACTGATGATATTAGTAACCTGAAAGCAGGTTTAGATGGTGCTTCATGGGTTTGGATTGGTGATGATTTTGTATCACCAAATGCACTTGCATTTGATTCACCAGTAAAATTTACGCCTTATTTGTATGTTGTTCCATCTGAACTATCAGAGTATAAAGATTTGTTGATAAAGTTGGGAGTTAGATTGAGTTTTGGTATTTCAGACTATATTCAAGTATTGCAAAGGTTGCAGAATGATGTGCATGGGGTTCCTCTGTCTATTGATCAGTTAAATTTTGTCCATCGTGTCCTTGAAGCCATAGCAGAATGTTGCTTGGAGAAGCCACTTTTTGAGCCTTTTGATAGTTCCTTGTTGATTCCTAATGATTTTGGAGTTCTGATGCAAGCAGGAGATCTTGTATATAATGATGCACCTTGGCTGGAAAACAGCTCTCTTATTGGGAGACATTTTGTGCATCCAGTTATAGGCAACGATTTGGCAGACAAGCTTGGTGTACAGTCAGTTCGGTGCCTTTCTTTAATCAGTGATGATTTGACTAAAGATCTGCCCTGCATGGACTTCAATAAAGTAAATGAACTTTTGGCGCTGTATGGAAACCATGAGTTTTTGTTGTTTGACCTTCTTGAGTTGGCAGATTGCTGCCAAGCCAAGAGATTACACCTGATCTATGATAAGAGGGAACATCCTCGCCAATCCCTGCTGCAGCACAATTTAGGAGCCAAGGCAGTGCTAGACCAATTTATTGAGGGAGTTAGGTTGCTGCTTGTGACATTGTGGCAACAAGTTCTAGTCCTAGAAACAACTTCCCTAGACAGTGAATTCCAAGGGCCTTCCCTTCTAGCAATCTTTGAAGGTGCCTGTTTGAGTCGAGAGGAATTTAGTAATTTCCAGCTCCGTCCTCCATGGCGATTGCGTGGCAACACAATTAACTATGGTTTGGGATTGGTTTCCTGCTATTCCATATGTGACCTTCTCTCAATCATTTCTGGTGGCTTCTTTTATATGTTTGATCCTCGTGGTTTGGTACTTGGTACACCTTTGACTAATGCCCCATCAGCAAAGATGTTTTCTTTGACAGGTACTGATCTGACTCAACGATTTTGTGATCAATTTAGTCCAATGCTCATTGATCGAAATGACTTATGGTTATTAGCTGATTCTACCATTATTCGCATGCCTATATCATCTGATTGTTTGAAGGTTGGACCTGACCTTGGATCAAACAGCATAAAGCATATTATGGAAATATTTATGGAGCATGGATCTAGAGCACTCCTGTTTTTGAAGTCGGTTTTACAGGTATCCATATCAACATGGGAAGAAGGACGTTCTAATCCAAGCCAGAATTTTTCAATAAGCATTGACCCATCATCTTCTATTTTGAGGAATCCATTTTCTGAAAAGAAATGGAGAAAGTTTCAATTATCAAGAATATTTAGCAGCTCCAATGCGATGATAAAGATGCATGCAATTGATGTGAATTTATATTCAGAAGGAACTACAGTCATTGATCGATGGCTTGTTGTACTCAGCCTGGGTTCTGGGCAAACAAGAAATATGGCTCTTGATCGGCGGTATCTTGCATACAACTTGACTCCTGTTGCTGGAATAGCAGCACTTATATCCAGAAATGGCCATCATGCCAATTTGTACTCAAGGAGCTCAATAATGGCCCCTCTTCCTTTGTCTGGTTGTATAGACATGCCTGTCACTATCATAGGTTGCTTCCTCGTGTGTCACAATAGGGGTCGTTATCTCTTTAAATACCAAGACAGAGGGGCTTCTTCTGAGGGACACTTTGATGTCGGAAATCAATTAATTGAATCTTGGAACAGAGAGGTCATGTCTTGTGTATGTGATTCCTATGTTGAAATGGTTTTGGAGATTCAAAAGCTAAGAAGAGATATTCCAAGCACCTTATTTGATTCTAGTGCCTATTCTGCAATCAGTGTCTCATTGAAGGCTTATGGAGATCAAATATACTCCTTTTGGCCACTTTCTTGTGAGAAGCATGTACCGAGTGATCAACATGGTAATCATGACAACAACCCTCCAAGTCCAACAGTAATTGTTCTTAAAGCTGACTGGGAATGTCTTAAAGATCGTGTTATACATCCATTTTATTCTCGTATTATTGACCTTCCAGTATGGCAGCTGTACTCCGGAAATTTGGTCAAGGCTGAAGAAGGCATGTTTCTTTCCCAGCCAGGGAATGGGCTAATTGGTAATTTACTTCCAGCTACAGTTTGCAGCTTTGTAAAGAAGCATTATCCTGTATTTTCAGTGCCATGGGAATTGGTGACTGAAATCCAAGCTGTGGGATTTTCAGTGCGAGAAATTAAACCTAAAATGGTTAGGGATCTCCTAAAATTTTCTTCAAAACCAATTGAGCTGCGGTCAGTTGACATGTATATAGATGTTCTCGAATATTGCTTGTCTGATTTTCAGCATGCAGAGTCATCCAGCTCACCCAGAGATAATGATCCTGCTAGTACCAATGATTTTTGTCAGGAAACTGATATCAGAATCACTTCTTCTCAGCTGGGGAATAATATCAACAGGTTCACTGGCAAGCCTACTCGGGGAGAAGCCAGTTCAGGAGATGCATTGGAAATGATGACAAGTTTAGGGAAGGCTCTATTTGATTTTGGTCGGGGTGTTGTTGAAGATATTGGTAGATCAGGAGCACCTGGGGCTTACAATAATAACATGACTTTCATTGATCAAAATAGGGACCAGAAGTTCATATTAATTGCTGCAGAACTCAAAGGCTTACCATTTCCAACTGCAACTAGCCATTTAAAAAAATTGGGTTTTACTGAACTTTGGATTGGGAATAAAGAGCAACAGTCATTAATGGTTCCGTTGGGAGAAAAATTTATTCACCCTAAAATAATAGACAGGCCTCTCTTAGGTGGCATTTTTTCTAATGTTTCCCTTCAATCACTATTGAAACTGCAGAATTTCTCTCTTAATCTACTGGCCAATCATATGAAACTAATTTTCCACGAAGATTGGGTGAGACATGTAATGGGATCAAATATGGCTCCATGGCTTTCTTGGGAGAAACTTCCTAGTTCTGGCAGTCAAGGGGGTCCTTCCCCTGAATGGATTAGAATCTTTTGGAAAAGTTTTAGCGGCTCACCAGAGGAATTATCCCTTTTCTCTGATTGGCCCCTAATTCCTGCATTTCTTGGTAGGCCAGTCTTGTGCCGTGTAAGAGAGCGACATCTGGTATTCATTCCTCCTCATTTGGAGCACTCATCGGCAACCATTGGGATTTCAGAAAGAGAATCTGCTGAAAGTTATGTGACTGGGGTTAGGGTATCAGGGGATAATACTTCTGAAACTGAGTTAGCTGAGTCCTACATTTCAGCTTTTGAAAGATTCAAAACCAGTTATCCCTGGTTGTTGTCAATGTTAAACCAGTGCAACATACCCATATTTGATGAGGCATTTATAGATTGTGCTGCTTCAAGCAATTGTTTTTCCATGTCTGGTCAATCACTTGGTCATGTTATTGCATCCAAACTTGTGGCAGCTAAGCAAGCTGGATATTTCACTGAACCTACTAATCTCTCAACATCAAATTGTGATGCACTTTTTTCACTTTTTTCTGATGAATTCTTCTCCAATGATTTTCAATATGCTCGCGAAGAAATTGAAGCTTTGCGTTCTCTCCCAATATATAAAACAGTTGTTGGTTCTTATACTAAGTTGCAAGGTCAAGATCAGTGCATGATCCCTTCAAAATCATTTTTAAAACCGTATGATGAACATTGTCTTTCTTGTGCCACTGATTCAAACGAAAGTTCATTTCTTCGGGCACTTGGAGTACAGGAGTTGCATAATCAACAGATCTTAGTACGCTTTGGCTTGCCTGGCTTTGAGGGTAAATCTCAGAATGAGCAGGAGGGAATATTAATATATGTTTTTAAAAATTGGCACGATCTTCAATCAGATCAAGTGGTGGTTGATGCTTTGAAAGAAACTAAATTTGTTAGAAATTCTGATGAGTTTTCAACAGATCTGTTGAAGCCCAAGGATTTATTTGATCCTGGTGATGCTATCTTAATATCTATATTCTTTGGTGAGAGAAGAAAATTTCCTGGAGAGAGGTTCAGTACAGATGGGTGGCTTCGAATACTAAGGAAAATTGGGCTTCGAACTGCTACAGAGGTAGAGGTAATAATTGAATGTGCCAAAAGAGTCGAGTTTCTAGGAATTGAGTGCATGAAATCAGGTGATGTGGATGATTTTGAGACTGACTTAATCCACACTAATTCTGAAGTTTCACCAGAGGTGTGGGCATTGGGAGGATCTGTAGTTGAGTTTGTTTTCTCCAACTTTGCCCTTTTCTTTAGCAACAACTTCTGTGATCTTCTTGGCAAGATTGCATGTGTCCCTGCTGAACTGGGGTTTCCTAGTGTTGGTTGCAAGAGGGTGCTTGCTTCATATAATGAAGCTATTTTGTCTAAAGATTGGCCTCTAGCTTGGAGTTGTGCTCCCATTCTATCTAAACAACACACAGTTCCTCCAGAGTACTCATGGGGACCTCTGCATCTACAAAGTCCTCCTGCTTTCTGTACAGTTTTGAAGCACCTACAAGTAATTGGGACAAATGGAGGGGAAGATACTCTGGCTCATTGGCCCATTGCTTCAGGAATGAACATTGAGGAATGTACCTGCGAGATTTTGAAATATTTAGACAAAATTTGGGGTTCACTTTCTTCCTCAGATGTGGCAGAGCTACGCAAAGTGGCCTTTCTTCCTGTTGCAAATGGAACACGCCTTGTGTCTGCCGATGCTCTTTTTGCTCGTTTAATAATTAATTTGTCTCCATTTGCTTTTGAGCTTCCTACTGTATATCTCCCATTTGTAAAAATTCTTAAAGATTTGGGACTTCAGGATATGTTAACACTTTCTGCTGCAAAGGGTCTTCTATTCCATCTTCAGAAATCTTGTGGATATCAGCGACTGAATCCCAATGAGCTGCGTGCAGTGATGGAAATTTTGAATTTCATTTGTGATCAGATTGTGGAGGGGAACACATTAGATGGGTCAAACTGGACATCAGAAGCCATAGTTCCTGATGATGGCTGCAGACTTGTTCATTCAGGATCCTGTGTCTATGTTGATTCTTATGGTTCTCGATACGTCAAATGTATTGATACTTCCAGAATTAGATTTGTTCATGCAGATCTTCCTGAGAGAGTCTGTATTACGCTTGGCATCAAAAAATTGTCTGACATTGTCATAGAGGAACTAGATGAGAATCACGCACTACAGACTTTGGATTCCCTTAGATCTGTTTTACTAGTGACCATCAAACAGAAGTTATCAAGCAAGTCTCTTCAAACTGCTGTCTGGACCATTGTAAAGAGCATGAGCTGCTACATTCCTGCATTCAATAGTTTTTCACTGGATACAATAAAATGCTTATTGAACTCTACTGCAAAAATGATGCAATTTGTAAAGTGTCTCAAAACAAAATTTCTGCTAATGCCCAATTTAGTAGATGTTACACGTGCAGGCAAAGATTTCACCATCCCAGAGTGGAAGAATGATTCTGCACATCAAACTCTTTATTTTTTGAACCAATCGAGATCCTGTATTCTAGTTGCTGAGCCACCAACTTATATTTCCCTTTTTGATCTCATTGCTATTATAGTCAGTCAGGTATTAGGCTCTCCAATCATATTGCCCATTGGGTCCTTATTTGGTTGTCCTGAAGGATCTGAGATTGCAGTTGTTAATGTTTTGAAACTCTGCTCTGATAAGAAAGAAGTTGAACCCATAAATGGGAGCAGCAATATGGTTGGGAAGGAAATTTTGGCACAAGATGCACGTCTTGTGCAGTTCCATCCATTAAGGCCCTTTTATTCTGGTGAAATAGTAGCTTGGCGATCTCAACATGGTGAAAAGCTGAAATATGGGAGGGTTTGTGAAGATGTAAGACCATCTGCAGGTCAAGGTCTGTACAGAATTAAAATTGAAGTGGCACCTGGGGATACGCAATTTTTCCTTTCATCACAAGTGTTTTCATTTAAAAGTGTATCAGCAAGCAGTCCTCTAAATGAAACACTGGTGCATGATAGCCCTTTATTAGGAAGTGACATGACCCGTGTTGATTTCGCGGAGAGCTCAGAAAGGAGTGAAAGCTATTCTCAGGCAAAGCCTGTGAGAGAGCAGTCTGGCAAGGTTTCAGCTGCAGAACTCGTCCAGGCTGTAAATGAAATCCTCTCGGCTGCTGGGATCAAAATGGACGTGGAGAAGCAGGCGCTACTTCAAAGAACAATAAATTTGCAAGAAAATCTAAAGGAGTCTCAAGCAGCTCTTGTTTTGGAGCAGGAAAAGGTTGAAAAGGCAACAAAAGAAGCTGATACAGCAAAAGCAGCATGGATTTGTCGGGTTTGTCTGAGTTCTGAGGTTGATATAACGATAGTTCCTTGTGGTCATGTATTGTGTCGTAGATGTTCTTCTGCAGTGTCAAGGTGTCCGTTTTGCCGGCTTCAGGTTACAAAAGCTATCAGAATTTTTCGTCCATAA 7356 0.4027 MQQAGQSLYDPRVPHLKKLLHGNFFFPSEKFLDPEILDTLVCLGLRTTLGFTGLLDCARSVSLLHDSRDIDAFKHGGELLSLLDTLACKLANKGECDNDDQQGGVALGSSSMQGDAFVYDGFPKDETCLTNIDSVLSSSTCDMVEEEFWSELKLISWCPVISDPVVTGLPWLKSKNQVVAPPTRVRPKSQMWMVSSSMFILDGECNTTYLQNELGWMGCPNVSVLTRQLIELSKSYQQLKINSLLDPGFDAQLQKEIPCLYSKLQEYINTDDISNLKAGLDGASWVWIGDDFVSPNALAFDSPVKFTPYLYVVPSELSEYKDLLIKLGVRLSFGISDYIQVLQRLQNDVHGVPLSIDQLNFVHRVLEAIAECCLEKPLFEPFDSSLLIPNDFGVLMQAGDLVYNDAPWLENSSLIGRHFVHPVIGNDLADKLGVQSVRCLSLISDDLTKDLPCMDFNKVNELLALYGNHEFLLFDLLELADCCQAKRLHLIYDKREHPRQSLLQHNLGAKAVLDQFIEGVRLLLVTLWQQVLVLETTSLDSEFQGPSLLAIFEGACLSREEFSNFQLRPPWRLRGNTINYGLGLVSCYSICDLLSIISGGFFYMFDPRGLVLGTPLTNAPSAKMFSLTGTDLTQRFCDQFSPMLIDRNDLWLLADSTIIRMPISSDCLKVGPDLGSNSIKHIMEIFMEHGSRALLFLKSVLQVSISTWEEGRSNPSQNFSISIDPSSSILRNPFSEKKWRKFQLSRIFSSSNAMIKMHAIDVNLYSEGTTVIDRWLVVLSLGSGQTRNMALDRRYLAYNLTPVAGIAALISRNGHHANLYSRSSIMAPLPLSGCIDMPVTIIGCFLVCHNRGRYLFKYQDRGASSEGHFDVGNQLIESWNREVMSCVCDSYVEMVLEIQKLRRDIPSTLFDSSAYSAISVSLKAYGDQIYSFWPLSCEKHVPSDQHGNHDNNPPSPTVIVLKADWECLKDRVIHPFYSRIIDLPVWQLYSGNLVKAEEGMFLSQPGNGLIGNLLPATVCSFVKKHYPVFSVPWELVTEIQAVGFSVREIKPKMVRDLLKFSSKPIELRSVDMYIDVLEYCLSDFQHAESSSSPRDNDPASTNDFCQETDIRITSSQLGNNINRFTGKPTRGEASSGDALEMMTSLGKALFDFGRGVVEDIGRSGAPGAYNNNMTFIDQNRDQKFILIAAELKGLPFPTATSHLKKLGFTELWIGNKEQQSLMVPLGEKFIHPKIIDRPLLGGIFSNVSLQSLLKLQNFSLNLLANHMKLIFHEDWVRHVMGSNMAPWLSWEKLPSSGSQGGPSPEWIRIFWKSFSGSPEELSLFSDWPLIPAFLGRPVLCRVRERHLVFIPPHLEHSSATIGISERESAESYVTGVRVSGDNTSETELAESYISAFERFKTSYPWLLSMLNQCNIPIFDEAFIDCAASSNCFSMSGQSLGHVIASKLVAAKQAGYFTEPTNLSTSNCDALFSLFSDEFFSNDFQYAREEIEALRSLPIYKTVVGSYTKLQGQDQCMIPSKSFLKPYDEHCLSCATDSNESSFLRALGVQELHNQQILVRFGLPGFEGKSQNEQEGILIYVFKNWHDLQSDQVVVDALKETKFVRNSDEFSTDLLKPKDLFDPGDAILISIFFGERRKFPGERFSTDGWLRILRKIGLRTATEVEVIIECAKRVEFLGIECMKSGDVDDFETDLIHTNSEVSPEVWALGGSVVEFVFSNFALFFSNNFCDLLGKIACVPAELGFPSVGCKRVLASYNEAILSKDWPLAWSCAPILSKQHTVPPEYSWGPLHLQSPPAFCTVLKHLQVIGTNGGEDTLAHWPIASGMNIEECTCEILKYLDKIWGSLSSSDVAELRKVAFLPVANGTRLVSADALFARLIINLSPFAFELPTVYLPFVKILKDLGLQDMLTLSAAKGLLFHLQKSCGYQRLNPNELRAVMEILNFICDQIVEGNTLDGSNWTSEAIVPDDGCRLVHSGSCVYVDSYGSRYVKCIDTSRIRFVHADLPERVCITLGIKKLSDIVIEELDENHALQTLDSLRSVLLVTIKQKLSSKSLQTAVWTIVKSMSCYIPAFNSFSLDTIKCLLNSTAKMMQFVKCLKTKFLLMPNLVDVTRAGKDFTIPEWKNDSAHQTLYFLNQSRSCILVAEPPTYISLFDLIAIIVSQVLGSPIILPIGSLFGCPEGSEIAVVNVLKLCSDKKEVEPINGSSNMVGKEILAQDARLVQFHPLRPFYSGEIVAWRSQHGEKLKYGRVCEDVRPSAGQGLYRIKIEVAPGDTQFFLSSQVFSFKSVSASSPLNETLVHDSPLLGSDMTRVDFAESSERSESYSQAKPVREQSGKVSAAELVQAVNEILSAAGIKMDVEKQALLQRTINLQENLKESQAALVLEQEKVEKATKEADTAKAAWICRVCLSSEVDITIVPCGHVLCRRCSSAVSRCPFCRLQVTKAIRIFRP 2451
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Spst2g02207 2451 SUPERFAMILY RING/U-box 2404 2445 - -
Spst2g02207 2451 SMART ring_2 2405 2438 IPR001841 -
Spst2g02207 2451 ProSiteProfiles Zinc finger RING-type profile. 2405 2439 IPR001841 -
Spst2g02207 2451 PANTHER ZINC FINGER, C3HC4 TYPE (RING FINGER) FAMILY PROTEIN 6 508 - -
Spst2g02207 2451 Pfam Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) 2405 2444 - -
Spst2g02207 2451 Coils Coil 2361 2402 - -
Spst2g02207 2451 Gene3D Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger) 2381 2450 IPR013083 -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Spst2g02207 Spst-Chr2 21238308 21258432 Tandem
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Spst2g02207 2361 2449 C3H Transcription Factor Family AT1G73950 31.111 7.68e-09 58.9
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Spst2g02207 K17592 - gmx:100789980 4285.33