Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Seca9g04934 ATGATTCTTAGGCAGAAAAATGACAAGCTCAGAGCTGAGAACAGTGTGATGAAAAAAGATTTAGCAAATCCAATGTGTAACACCTGTGGTGGACCACCAATTCCTGGCCAAATTTTATTGGAGGAGAACCAAATTAGAATTGAAAATGCTCGATTAAAGGATGAACTGAACATGATTTGTGCCTTGGCAAACAGGTTCTTGGGTAGGCCACTTTCATCCTTGGCCAGTCCCATGCCTCTGCCAACCCCAAATTCTGGTCTTGAACTTGGTATTGGAAGAAATGGGGCTGGTTCAGGCAATTTTAGCATGTCCTTGCCAATGGGACTTGATGTTGGAGATGGTGTTATGGGCACTCCACCACCTACATTACTTGGGATAAGATCATCAATGGGGTTGATTGGAAATGAAGTCCAGCTTGAGAGATCTATGCTTATAGATGTTGCAGTAGCTGCTATGGATGAATTTCTTAAGATGACTCAACCAGATAGCCCTCTTTGGATTAGGAGTTCAGGTGGAAGCAAGGAAGTGCTGAACCATGAGGAGTATTCAAGGGTGTGTTCTTATATCAGGCCAAAACCCACTGGTTATGTAACTGAAGCTTCAAGAGAAACTGGGTTAGTCATAATCAACAGTTTGGCCCTTGTGGACCTATTGATGGATGCGGATCGATGGTCAGAGATGTTTCCATATATGATTGCTAGAGTTGTCACTTTGGATGTAATTTCTAGTGGAATGGGTGGAACCAGAAATGGAGCTTTGCAAGTGATGCATGCTGAGGTTCAATTGCCTTATCCACTAGTCCCTGTTCGTCAATTGAGTTTCCTCAGGTTTTGCAAGCAGCATGCAGAAGGTGTGTGGGCTGTGGTTGATGTTTCAGTTGACATTGGTCATAATGCTACCAATGGAATCCAATTTATGAACTGTAGGAGGCTTCCTTCTGGCTGTGTTGTTCAAGATATGCCCAATGGTTTCTCCAAGTATGATGAGAGTGTTGTCCACCAACTCTATCGCCTATTGGTTAATTCTGAAATTGGATTTGGTGCTCATAGATGGATTGCAACTCTCCAAAGGCAGTGTGAATGCTTTGCAATCCTCATGTCCCCTTCCATACAACCTGAGGACCCCACAGCCACAAGCCAAGCTGGTAAGAGAAGCATAATGAAGCTTGCACAACGCATGACTGATTACTTCTGGTCTGGGATTTTTGTTTCATCGGCTTGCAAGTTGGACATCATTCACATTGGTGGTAACAATGACATGAGAATCATGTCCAGGAAACATGTGGATGAATCTAGTGAGTCTCAGGGTATTGTGCTGAGTGCTGCAACTTCTATATGGATACCAGTGTCAAGGCAGAGGGTGTTTGATTTCTTGCGTGATGGAAGGCTCAGAGGTGAGTGGGATGTCTTGTCTAGTGGTGGAGGAATGCAGGAGATGTTCCATATTCCTAAAGCACAAGGAAGAGCAAATTGTGTCTCTATCCTTCGTGCTAATAATGCTGCTAATGGGAACGAGAGCAATGTGCTATATCTGCAAGATTCATGGACTGATGTCTCTGCCTCGATGATTGTGTATTCACCAATGACTATGCAATCCTTGAAGTTGGTGATGGCTGGTAGTGATTCTTCATTTGTTTTTCTCTTGCCTTATCGGTTTGCTATTCTTCCAGATGGTCATTCAAGTGGTGTTGGAACTTCAAGTGATGGCAGTGGCAGTAGCGGCGGCGGCGATGACGGTGGTGGAAGTGTTATTACAGTTGGGTTACAAATGCTGCTGAGTAACCTCCCAACAGCTAAGCTGACAATGGAGTCAGTTGAAACTGTTAATGGACTCATCTCATGCACCATTCAAAAGATCAAAGATGCACTTGGAGTTGCATGA 1881 0.4397 MILRQKNDKLRAENSVMKKDLANPMCNTCGGPPIPGQILLEENQIRIENARLKDELNMICALANRFLGRPLSSLASPMPLPTPNSGLELGIGRNGAGSGNFSMSLPMGLDVGDGVMGTPPPTLLGIRSSMGLIGNEVQLERSMLIDVAVAAMDEFLKMTQPDSPLWIRSSGGSKEVLNHEEYSRVCSYIRPKPTGYVTEASRETGLVIINSLALVDLLMDADRWSEMFPYMIARVVTLDVISSGMGGTRNGALQVMHAEVQLPYPLVPVRQLSFLRFCKQHAEGVWAVVDVSVDIGHNATNGIQFMNCRRLPSGCVVQDMPNGFSKYDESVVHQLYRLLVNSEIGFGAHRWIATLQRQCECFAILMSPSIQPEDPTATSQAGKRSIMKLAQRMTDYFWSGIFVSSACKLDIIHIGGNNDMRIMSRKHVDESSESQGIVLSAATSIWIPVSRQRVFDFLRDGRLRGEWDVLSSGGGMQEMFHIPKAQGRANCVSILRANNAANGNESNVLYLQDSWTDVSASMIVYSPMTMQSLKLVMAGSDSSFVFLLPYRFAILPDGHSSGVGTSSDGSGSSGGGDDGGGSVITVGLQMLLSNLPTAKLTMESVETVNGLISCTIQKIKDALGVA. 627
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Seca9g04934 626 Pfam START domain 147 361 IPR002913 GO:0008289
Seca9g04934 626 CDD START_ArGLABRA2_like 141 360 - -
Seca9g04934 626 SUPERFAMILY Bet v1-like 414 620 - -
Seca9g04934 626 PANTHER HOMEOBOX-LEUCINE ZIPPER PROTEIN MERISTEM L1 2 623 IPR042160 -
Seca9g04934 626 SMART START_1 146 361 IPR002913 GO:0008289
Seca9g04934 626 SUPERFAMILY Bet v1-like 139 362 - -
Seca9g04934 626 ProSiteProfiles START domain profile. 137 364 IPR002913 GO:0008289
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Seca9g04934 Seca-Chr9 143264122 143267473 Dispersed/Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Seca9g04934 2 623 Homeobox Transcription Factor Family AT3G61150 48.494 0.0 597
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Seca9g04934 K09338 - gmx:100794400 834.328