Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Seca9g04933 ATGATTCTTAGGCAGGAAAATGACAAGCTCAGAGCTGAGAACAGTGTGATGAAGGAAGCTTTAGCAAATCCAATGTGTAACACCTGTGGTGGACCAGCAATTCCTGGCCAAATTTCATTGCAGGAGCACCAAATTAGAATTGAAAATGCTCGATTAAAGGATGAACTAAACAGGATTTGTGCCTTGGCAAACAGGTTCTTGGGTAGGCCACTTTCATCCTTGGCCAGTCCCATGCCTTTGCCAACCCCAAATTCTGGTCTTGAACTTGGTATTGGAAGAAATGGGGCTGGTTCAGGCAATTTTAGCATGTCCTTGCCAATGGGACTTGATGTTAGAGATGGTGTTATGGGTACTCCACCACCTACACTACTTGGGATAAGATCGTCAATGGGGTTGATTGGAAATGAAGTCCAGCTTGAGAGATCTATGCTTATAGATGTTGCAGTAGCTGCTATGGATGAATTGCTTAAGATGACTCAACCAGATAGCCCTCTTTGGATTAGGAGTTCAGGTGGAAGCAGGGAAGTGCTGAACCATGAGGAGCATTTAAGGGCGTGTTCTTATATCAGGCCAAAACCCATTGGTTATGTAACTGAAGCTACAAGAGAAACTGGGTTAGTCATAATCAATAGTTTGGCCCTTGTGGACCTATTGATGGATGCGGATCGATGGTCAGAGATGTTACCATATATGATTGCTAGAGCTGTCACTTTGGATGTAATTTCTAGTGGAATGGGTGGAACCAGAAATAGAGCTTTGCAAGTGATGCATGCTGAGGTTCAATTGCCTTCTCCACTAGTCCCTGTTCGTCAATTGAGTTTCCTTAGGTTTTGCAAGCAGCATGCAGAAGGTGTGTGGGTTGTGGTTGATGTTTCAGTTGACATTGGTCATAATGCTACCAATGGAATCCAATTTATGAACTGTAGGAGGCTTCCTTCTGGCTGTGTTGTTCAGGATATGCCCAATAGTTTCTCCAAGATTACTTGGGTTGATCACTCCCAGTATGATGAGAGTGTTGTCCACCAACTCTATCACCCATTGGTTAATTCTGGAATTGGATTTCGTGCTCATAGATGGATTGCAACTCTCCAAAGGCAGAGTGAATGCTTTGCAATCCTCATGTCCCCTTCCATACAACCTAAGGACCCCACAGCCATAAGCCAAGCTAGTAAGAGAAGCATAATGAAGCTTGCACAACGCATGACTGACTACTTCTGGTCTGGGATTTGTGTTTCATCGGCTTGTAAGTGGGACATCATTCACATTGGTGGTAACAATGATATGAGAATCATGTCCAGGAAACATGTGGATGAATCTGGTGAGTCTCAGGGTATTGTGCTGAGTGCTGCAACTTCTATATGGATACCAGTGTCAAGGCAGAGGGTGTTTGATTTCTTGCGTGATGGAAGGCTTAGAGGTGAGTGGGATGTCTTGTCTAGTGGTGGAGAAATGCAGGAGATGTTCCATATTCCTAAAGCACAAGGACAAGGAAATTGTGTCTCTATCCTTCGTGTTAATAATGCTGCTAATGGGAACGAGAGCAATGTGCTATTTCTGCAAGATTCATGGACTGATGTCTCTGCCTCGATGATTGTGTATTCACCAATGACTATGCAATCCTTGAACTTGGTGATGGCTGGTAGTGATTCTTCATTTGTTTTTCTCTTGCCTTATGGGTTTGCTATTCTTCCAGATGGTCATTCAAGTGGTGTTGGAACTTCAAGTGATGGCAGTGGCAGTAGCGGCGGCGGTGGTGACGGTGGTGGAAGTGTTGTTACAGTTGGGTTACAAATGCTGCTAAGTAACCTCCCAACAGCTAAGCTGACAATGGAGTCAGTTGAAACTGTTAATGGACTCATTTCATGCACCATTCAGAAGATCAAAGATGCACTTGGAGTTGCATGA 1905 0.4409 MILRQENDKLRAENSVMKEALANPMCNTCGGPAIPGQISLQEHQIRIENARLKDELNRICALANRFLGRPLSSLASPMPLPTPNSGLELGIGRNGAGSGNFSMSLPMGLDVRDGVMGTPPPTLLGIRSSMGLIGNEVQLERSMLIDVAVAAMDELLKMTQPDSPLWIRSSGGSREVLNHEEHLRACSYIRPKPIGYVTEATRETGLVIINSLALVDLLMDADRWSEMLPYMIARAVTLDVISSGMGGTRNRALQVMHAEVQLPSPLVPVRQLSFLRFCKQHAEGVWVVVDVSVDIGHNATNGIQFMNCRRLPSGCVVQDMPNSFSKITWVDHSQYDESVVHQLYHPLVNSGIGFRAHRWIATLQRQSECFAILMSPSIQPKDPTAISQASKRSIMKLAQRMTDYFWSGICVSSACKWDIIHIGGNNDMRIMSRKHVDESGESQGIVLSAATSIWIPVSRQRVFDFLRDGRLRGEWDVLSSGGEMQEMFHIPKAQGQGNCVSILRVNNAANGNESNVLFLQDSWTDVSASMIVYSPMTMQSLNLVMAGSDSSFVFLLPYGFAILPDGHSSGVGTSSDGSGSSGGGGDGGGSVVTVGLQMLLSNLPTAKLTMESVETVNGLISCTIQKIKDALGVA. 635
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Seca9g04933 634 ProSiteProfiles START domain profile. 137 372 IPR002913 GO:0008289
Seca9g04933 634 Pfam START domain 147 368 IPR002913 GO:0008289
Seca9g04933 634 Coils Coil 3 23 - -
Seca9g04933 634 SUPERFAMILY Bet v1-like 139 369 - -
Seca9g04933 634 SMART START_1 146 369 IPR002913 GO:0008289
Seca9g04933 634 SUPERFAMILY Bet v1-like 395 628 - -
Seca9g04933 634 CDD START_ArGLABRA2_like 141 368 - -
Seca9g04933 634 PANTHER HOMEOBOX-LEUCINE ZIPPER PROTEIN MERISTEM L1 2 631 IPR042160 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Seca9g04933 Seca-Chr9 143256303 143260601 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Seca9g04933 2 631 Homeobox Transcription Factor Family AT3G61150 49.398 0.0 629
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Seca9g04933 K09338 - gmx:100794400 859.751