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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Seca9g01521 ATGGAGAGCCAAAGCCAAGTCCAAGTTCCAGAAGGAACCTCCTTTCTGAAAACCTATTTCAATGGACTCAACGCCTTGTTAGGTCTCGGAATACTCTCCTTACCGTATGCCCTATCTCAAGGGGGATGGTTGAGTTTAATGTTGCTCATGTTTGTGGCTATTAGTTGTTGGTACACAGGGTTACTTCTCCAAAGGTGTGTGAATAAGCATACACAAATCAAGTCCTATTCTGACATAGGTAACGTTGCTTTTGGCTACAAAGGAAGAGTTGTGGTAGCTATTTTCATGTATTTAGATCTCTATTTAGTTGCCGTAGAGCTTCTTACACTAGGAGGTGACAGTTTACAATACATGTTTCCAAACTTGAACTTCAAAATTGCTACTCTTAGCATTAAAGGTGATATAGGTTTTATTTTGCTTACTGCTTTGGTAATATTGCCAACAACATGGTTGAGAAGTTTTGGAGCTCTGGCCTACATTTCTGCTAGTGGGGTATTGGTTTGTCTAATTTTGATATGGTGTGTTCTATGGGCGGGTGCAGTTGATGGTGTGGGGTTTCATGAAAAAGGCCAGCTAATGAATTTGAAAGGATTCCCTGCTGCTTTAAGCCTCTTTAATTTCTGTTACAGTGCTCATGCAGTCTTCCCCACTCTCAGCTATTCCATGAGAGATAAGAGACAATTTGATAAGGTTTTACTATATTGCTTTGTAACAAGCACCACAGGCTATGGGTTGATGTCAATTATAGGTTACTTGATGTTTGGAAATTATTCCAAGTCTCAAGTGATCTTAAATCTTCCAATGAATAAAATAAACACCCATATAGCTATTTATACTTCATTATTCGTCCCCTTCACCAAGTATGCAATTATGGTCACTCCTATTGCTATTGCCATTGAGGACAAGTTGCGTTCCAACAGCAGATTTTCTAGTGTTCTCACTAGAACAATGATTGTGGTCAGTACTACGCTTGTGGCAATACTTGTTCCCTATTTTGGGTATGTTATGATGCTTATTGGTGCTTTATCAGGTGTTGCATTGGCATTGTTGTTGCCTTGTTTGTGTTACCTAAAAATAAATGTAGCTGCAAGAAAATTTGGGTTAGAGTTGATGGTCATTGTGGGAATTATATTAGCAGCATCACTCATTTGTGTATTTGGCTCTTATATTTCTATAAGTGAGATAGTGTATCAATGGAAAAAGAGAAAAGATCATTAA 1218 0.3826 MESQSQVQVPEGTSFLKTYFNGLNALLGLGILSLPYALSQGGWLSLMLLMFVAISCWYTGLLLQRCVNKHTQIKSYSDIGNVAFGYKGRVVVAIFMYLDLYLVAVELLTLGGDSLQYMFPNLNFKIATLSIKGDIGFILLTALVILPTTWLRSFGALAYISASGVLVCLILIWCVLWAGAVDGVGFHEKGQLMNLKGFPAALSLFNFCYSAHAVFPTLSYSMRDKRQFDKVLLYCFVTSTTGYGLMSIIGYLMFGNYSKSQVILNLPMNKINTHIAIYTSLFVPFTKYAIMVTPIAIAIEDKLRSNSRFSSVLTRTMIVVSTTLVAILVPYFGYVMMLIGALSGVALALLLPCLCYLKINVAARKFGLELMVIVGIILAASLICVFGSYISISEIVYQWKKRKDH. 406
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Seca9g01521 405 PANTHER OS05G0424000 PROTEIN-RELATED 21 383 - -
Seca9g01521 405 Pfam Transmembrane amino acid transporter protein 12 389 IPR013057 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Seca9g01521 Seca-Chr9 25864206 25867832 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Seca9g01521 2 396 Amino Acid or Auxin Permease AAAP Family AT3G28960 44.500 1.95e-121 356
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Seca9g01521 K15015 - pvy:116132859 481.485