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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Seca7g08482 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1901
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Seca7g08482 1900 Gene3D - 34 191 IPR023175 -
Seca7g08482 1900 SMART FKS1_dom1_2 336 448 IPR026899 -
Seca7g08482 1900 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 1025 1713 IPR003440 GO:0000148|GO:0003843|GO:0006075|GO:0016020
Seca7g08482 1900 Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 338 445 IPR026899 -
Seca7g08482 1900 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 153 1893 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Seca7g08482 Seca-Chr7 189545423 189608724 Dispersed/Tandem
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Seca7g08482 1 1900 Cell Wall Biosynthesis AT3G07160 77.370 0.0 3082
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Seca7g08482 K11000 - gmx:100787540 3485.66