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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Seca5g04416 ATGGGTGATTTCCCTATACCTGCATGTTATCCAGTATCTATTCTTAATCCCAATAGAATATGGAAAACTGATAATGTCATGAAAACTGAGCTCCCTATTCTCTCATTTCAAATTGTCTTCACCATATTGTTGTCTCGTTTATTCTTCTTTGTCTATAAGCCCTTCCATCAACCTCGTCTTATTTCACAAATATCAGTTGGTTTCCTATTAACACCGCCGTTATTAGGGAGATTCACAGCTATATTTGAGTTTGTTTTTCCTGTAAATGGGGTTCTTAATATTGAAGTTCTGGCACACATTGGTCTCATCTACTATGCATTTCTCAGTGGTTTGGAGATGAACATAAACACCATCTTACAAGTGAAAAAGAAGGCTGGAACAATTGCCATTGCTGGGATCATATTTCCTATGGTGTTGGGACCAGCATTCTATGCTTTACATAGAATATATTATGTTACTAGTCCTACAACTAGACTTGAAGAATGCACAATTAATGCTTTTTTACTTTGGACTTTAATTCTCACTGTAACTGGTTTTCCTGTTCTAGCTCACATCCTTTCTGAGCTCAAGCTTCTTTATACTAATCTTGGCAAAACAGCTTTAACAGCAGCCATGATCAGTGACACCTATGGTTGGGTTCTTTTTACATTATTGGTTCCATTTTCAATTAATGGTCAAAGAGCTGTGTACTCAGTGCTGAGTACCATGATATTCATTATTGTTCTTGTCTTTGTGGTACGTCCTATCCTTGTAAAGTACATTGATCGCAAGACAGAGAAGGATGAGTGGGATGATAACAAATTACTCTTTGTGGTGATGGGGGTTTTAGCTTGTTCATTCATTACAGATGTTCTTGGAACACATGGCATTGTTGGGGCTTTTGTGTATGGATTGATTTTACCTCATGGGAAATTTGCTGACTATGTGATGTCAGTTTCAGATGATTTTGGTGGTGGCTTTCTGGCACCCCTTTTCTTTAGTGGTAGTGGAATGAGACTTATGTTGGCCTCCATTTTCCAACAGTCACATTGGCCTTTAACAGTGCTGGTTATGCTCTTGTTATGTGTTACAAAGATTTTGAGCACTTTATTTGCCACTTTCTTCTTTGGTTTGCGCACAAGAGATGGTTTAGCCTTAGGCTTGCTTATGAATACCAAGGGTGCCATGGCACTGATAATGCTAAACATTGCTTGGGATAGATCGATCTTTTCTGTATCAACCTATGCTGTTAATGCTTCTGCTGTCCTTCTAATGACTGTAATAGTGTCTCCCATAATCAATGCCATGTACAGGCCAAGAAAAAGATTTGAGCAGAACAAGCTAAAAACTATACAGAAGCTAAGAGTTGATGCAGAGCTTCGAATTCTGGCATGTGTCCACAACAATCGCCAAGCCACAGGCATGATCAGCATCATTGAATCTTTTAATGCCACAAGACTTTCCCCAATACATGTTTTTGCCCTTTACCTTGTTGAACTCACTGGACGTGCTGCTGCACTTGTTGCTGCCCATTTGGAGAAGCCTAGTAACCAACCAGGAGCACAAAATCAAAATCTAACAAGATCACAAGCAGAATTAGAGAGCATTAACAATACCTTTGAAGCATTTGTAGAGGTATATGATGCTGTCAGAGTGCAGACCTTAAATGTTGTGTCAGCATATGCAACCATTCATGAGGACATATATAATGCAGCAAATGAGAAACGCACAAGCTTAATTCTCCTTCCATTCCACAAACACATGAGCTCAGAAGGTACTCTTGAAACAACCAGTGTTGTATACAAAGATATAAACCAAAATGTAATGCAAGATGCACCTTGTTCCGTGGGAATCTTTGTTGATCGTGATCTTGGGTCATTACCAAAAATGAACTTCCGGATTCTTATGATCTTTGTTGGAGGACCTGATGATCGTGAAGCCTTAGCTGTTGCATGGAGAATGGCAGGGCATCCAGGAATAAGGCTATCAGTGGTTAGGATTCTTTTGTTTGATGAAGCTGCAGAAGTAGATACTTCAACTCATGGTGAAGCACATGGGATATTATCTGCTGTAATGGATAGTGAGAAGCAGAAAGAGTTAGATGATGAGTATGTGAATTCATTTAGACTCACGGCAGTGAACAATGATGATTCTATAACCTACACAGAGGTTGATGTTCATACTGGTGAAGATATTCCTGCAGTCCTCAATGAGCTAGAAAAGATTGGTTGTGATTTATATATAGTTGGACAAGGGAATTGTAGGGGCTCTCGGGTCTTCTCTAATTTATTGGAATGGTGTGATTGCACAGAACTTGGAGTTATAGGGGATATTTTGGCGTCAAACAATTTTGGTTCAAGCTCATCTGTGCTAGTGGTGCAACAGTATGGGTATGGAGGAATGGTTTTTGGAAAGCCTTCCAATGTGGCCACTAATAATGATGGCTTTGAGTCACTTGTTGTGAAGACAGAATAA 2454 0.3941 MGDFPIPACYPVSILNPNRIWKTDNVMKTELPILSFQIVFTILLSRLFFFVYKPFHQPRLISQISVGFLLTPPLLGRFTAIFEFVFPVNGVLNIEVLAHIGLIYYAFLSGLEMNINTILQVKKKAGTIAIAGIIFPMVLGPAFYALHRIYYVTSPTTRLEECTINAFLLWTLILTVTGFPVLAHILSELKLLYTNLGKTALTAAMISDTYGWVLFTLLVPFSINGQRAVYSVLSTMIFIIVLVFVVRPILVKYIDRKTEKDEWDDNKLLFVVMGVLACSFITDVLGTHGIVGAFVYGLILPHGKFADYVMSVSDDFGGGFLAPLFFSGSGMRLMLASIFQQSHWPLTVLVMLLLCVTKILSTLFATFFFGLRTRDGLALGLLMNTKGAMALIMLNIAWDRSIFSVSTYAVNASAVLLMTVIVSPIINAMYRPRKRFEQNKLKTIQKLRVDAELRILACVHNNRQATGMISIIESFNATRLSPIHVFALYLVELTGRAAALVAAHLEKPSNQPGAQNQNLTRSQAELESINNTFEAFVEVYDAVRVQTLNVVSAYATIHEDIYNAANEKRTSLILLPFHKHMSSEGTLETTSVVYKDINQNVMQDAPCSVGIFVDRDLGSLPKMNFRILMIFVGGPDDREALAVAWRMAGHPGIRLSVVRILLFDEAAEVDTSTHGEAHGILSAVMDSEKQKELDDEYVNSFRLTAVNNDDSITYTEVDVHTGEDIPAVLNELEKIGCDLYIVGQGNCRGSRVFSNLLEWCDCTELGVIGDILASNNFGSSSSVLVVQQYGYGGMVFGKPSNVATNNDGFESLVVKTE. 818
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Seca5g04416 817 Gene3D - 34 440 IPR038770 -
Seca5g04416 817 Gene3D - 455 758 - -
Seca5g04416 817 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 38 426 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
Seca5g04416 817 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 9 789 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Seca5g04416 Seca-Chr5 101714672 101717546 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Seca5g04416 9 789 Antiporter Super Family AT2G13620 38.938 0.0 577
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Seca5g04416 - - gmx:100804266 1305.04