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Sequence information
| Select | Gene | Cds | Cds_length | GC_content | Pep | Pep_length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Seca5g02359 | 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GTTGCTTCGGTCTGGCTCAGAGAGCACGGTTATTGGTGCATTAAATGCTCTTCTTGTGTTAGAATGTGATGATGGAACTAGTGCAGAAGCAATGGCTGAAAGCGGTGCCATAGAGGCTCTCTTGGAGCTCCTAAGATCTCATCAGTGCGAGGATACTGCTGCAAGACTCTTAGAAGTATTGCTGAACAATGTAAAGATCAGAGAAACAAAAGTTACTAAATCAGCCATCTTACCATTATCCCAGTACCTCTTGGACCCCCAAACCCAAGTACAACAAGCAAGGTTATTAGCAACTTTGGCCCTTGGTGATCTATTCCAGAATGAGGGTCTTGCTCGGACACCTGATGCAGTTTCAGCTTGCCGTGCTTTAGTGAATGTGCTTGAAGACCAACCAACTGAAGAAATGAAAGTTGTAGCCATATGTGCTCTGCAAAACCTTGTGATGTACAGTCGATCAAATAAAAGAGCAGTTGCAGAGGCTGGTGGTGTTCAGGTTGTACTGGATCTGATAGCTGCTATTGAAAAGGATTTATGGGCTACTGGAACTGTGAATGATGAGTATCTTAAAGCCTTAAATTCTCTATTTAGCAACTTCCCACGGCTGAGAGCAACTGAACCAGCAACACTTACCATTCCACATTTGGTTACGTCCTTGAAGACAGGTTCAGAGGCTACTCAGGAAGCTGCCTTGGATACACTTTTTCTGCTCAGGCAAGCTTGGTCAGCATGCCCAGCAGAAGTTTCAAGAGCCCAGTCCATAACAGCTGCAGATGCTATTCCTTTGTTACAGTACTTAATCCAGTCTGGCCCACCTCGGTTTCAGGAGAAGGCAGAGTTTTTATTGCAGTGTTTGCCAGGGACATTGGTGGTGATCATCAAACGTGGTAATAATATGAAGCAATCAGTTGGAAACCCGAGTGTTTATTGTAAGCTTACACTTGGAAACACTCCTCCAAGGCAAACGAAGGTGGTCTCGACTGGCCCAAATCCAGAATGGGATGAGAGTTTTTCATGGTCCTTTGAGAGTCCTCCAAAAGGCCAGAAACTTCACATTTCTTGCAAAAATAAGAGCAAAATGGGAAAGAGTTCATTTGGGAAAGTGACGATCCAGATTGATCGGGTGGTGATGCTGGGAGCAGTATCTGGAGAGTACACTCTGTTGCCGGAAAGTAAAAGTGGCCCCTCAAGGAATTTAGAAATAGAATTTCAGTGGTCTAACAAGTGA | 6225 | 0.4307 | 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| 2075 |
Showing 1 to 1 of 1 entries
Annotation information
| Select | Seq ID | Length | Analysis | Description | Start | End | IPR | GO |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Seca5g02359 | 2074 | FunFam | Protein CELLULOSE SYNTHASE INTERACTIVE 1 | 1340 | 1574 | - | - | |
| Seca5g02359 | 2074 | SUPERFAMILY | ARM repeat | 985 | 1118 | IPR016024 | - | |
| Seca5g02359 | 2074 | SMART | C2_3c | 1954 | 2050 | IPR000008 | - | |
| Seca5g02359 | 2074 | SUPERFAMILY | ARM repeat | 1325 | 1612 | IPR016024 | - | |
| Seca5g02359 | 2074 | SUPERFAMILY | ARM repeat | 1154 | 1357 | IPR016024 | - | |
| Seca5g02359 | 2074 | Pfam | Armadillo/beta-catenin-like repeat | 62 | 92 | IPR000225 | GO:0005515 | |
| Seca5g02359 | 2074 | Pfam | Armadillo/beta-catenin-like repeat | 483 | 523 | IPR000225 | GO:0005515 | |
| Seca5g02359 | 2074 | Gene3D | - | 1490 | 1952 | IPR011989 | - | |
| Seca5g02359 | 2074 | Coils | Coil | 255 | 275 | - | - | |
| Seca5g02359 | 2074 | Gene3D | C2 domain | 1953 | 2074 | IPR035892 | - |
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Duplication type information
Functional genes information
Pathway information
| Select | Query | KO | Definition | Second KO | KEGG Genes ID | GHOSTX Score |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Seca5g02359 | - | - | gmx:100816765 | 3649.37 |
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