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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Seca5g01859 ATGGAAGACACGGGTAATAGGGTTAATAAGGGTGAAGCTGAATATGCTAATAATTTGAAGTCCCCTGATGAAGAAAATGCTTGTTCTGTTGAGGATGTTACTGATGTATACAAAAGGATTTCTGAGTTAGCTGATGATGACATTAGAATCCTTGAGTTCGATTCTGAACTGGATGGGTATAATTTTTATTCTGAGTATGCTAAATTCAAAGGTTTTGCGGTTAGGAAAGATGATGTTTATCGTGATCGTAATAGGTTAATTACCATGAGGCAATTAGTTTGTAACAGACAGGGGGAAAGGGCTGACAGAATTAGAGAAGCTAAGGCAATTACTCGTACCAATTGTCATGCAAGGCTTCGACTGTATTTTGATAAAAACAGTGGGAAGTGGAAGGTTGGAATTTTTGAGCCAGAACACAATCATGAGCTTACTCCTTCAAATATGGTTCATTTGATGCCTGCATATCGTGGGTTGAGTGCTGCTGATAAGGCACAAGTAAATAGTCTTCACTTATATGGTGTTAGGACTTGTCATATAATGGGTTTAATAATGGGTCAGAAAGGTGGTCACTCAGATTTGGGTTTTTGTAAGAAGGACTTGTACAATCACATTGACAAGGAAAATAGGGCCAAAATACAGGATGAAAATGCTTTTGCTGCTTTGTGCTATCTTCAAGCTAAGTTTGATAATAATCCAATGACATTCGTTAAGTTCACTACTACTGAAGATGATAGGCTTGAAAACTTGTTCTGGGCTGATGTAGGAAGTAGAATTGATTATGCTTGTTTTGGTGATGTAGTCGCATTTGACACAACTTATAAAAAAAACAAGTATAACAGGCCTTTAGTAATTTTTTGTGGTTATAATCATCATGGGGAAACCACAATTTTTGGTTGTGCTCTTGTGTCTGATGAGAAGACAGAAACTTATAAATGGGTACTTGAATCTTTTCTGGAAGCTATGTTTAATAAATTTCCTAAGGCAGTTGTTACAGACGGGGATGGTGCAATGCGTGAAGCTATAAGATCTGTGTTTCCAGATTCTATCCACAGGTTGTGTTCATGGCATCTTCACCAGAATGCTTGTGAGAATGTCAAGAATCCCAAATTTTTGGAAGATTTTAAGAAGTTAATTTATGCCAATTATACTCCTAAGAAATTTGAGCAAGAGTGGGTACAAGTTATTGAGAAACATGGTCTGAGCAACAATAGGTGGGTGTTGAAGGTGTATGACCTCAAGAGAATGTGGGCTACCGCTTTTTTCAGAGATAACTTTTTTGCTGGTGTCCGGACTACCTCCATTTGTGAAGGTATTAATTCTTTTATCAAGAGATATGTACAGAGTAAAAACAGTCTCGTTGATTTTCTACACAATTTTGAAAGAGCTTTGAATGAATATAGGCACAATGAATTAGCTTCTGATTTTAAATCCTCATACACCCAGCCAGTTCTGACAACTGCTTTGGAAAAGTATGAAGTTAATGCGTGTAATGTGTATACCAGGAATAAGTTTTTTGAAATTAGAAAGCAAATTGAGGAAGTTGCTGCTTTGAATATGATTGAAAGGACTGAGGTAGGTAATGTTGTCACATTGAAGATGAATAAATTTGGAAGTCCTGATTCTGTATACCTTGTTTTGTTTGATAAGTCTGTTGGTAAGTTTGTATGTGATTTTCGGTTGTTTGAGTCATGTGGTTTACCATGTTCACATATCTTTTGTGCTATGAAGCATGAGCAAATAGAGTCAATTCCGCCTTCACTCATCTGCAAAAGGTGGACTAAGTTTGCTAAGGTTGATTATATTTCTGCAATTTATGCTGATGAGGGTGATACTACAAAGAAGGAAGTGTTGAGGTCCGGTGCTGTGGGTGCTGCTTGTAATAGGCTTAACAAGGCTGCACATAAAGATCCTCATAATTTTGTGAAAAACATTGAGGCCATCCATCAATTAGCAGACCAGATGGAAAGGCAAGATGGGGTTGATGTCAACATTGCTGACATATCAAGGGTTGTCCGTGATCCAACTATTGTTAAAACCAAAGGTGCACCCCGTAAGAGTAAGAAAATCATGAAAAGAAGAAAATGCTCTTATTGTAAGCGTGTTGGGCATACAATCAGGACTTGTTCCAAGTTCTCAACGCGAGATCAACTGCATACTGTAGAAGAAGAGGAGTCTTTAGTTGAGAGTGATGGAGAATCAAGAGATTTAACGGTAATGCCTTGTGATATTGAATGTTGTGTGAGATTTAGTTTTCTTGTCATAAACTAA 2268 0.3735 MEDTGNRVNKGEAEYANNLKSPDEENACSVEDVTDVYKRISELADDDIRILEFDSELDGYNFYSEYAKFKGFAVRKDDVYRDRNRLITMRQLVCNRQGERADRIREAKAITRTNCHARLRLYFDKNSGKWKVGIFEPEHNHELTPSNMVHLMPAYRGLSAADKAQVNSLHLYGVRTCHIMGLIMGQKGGHSDLGFCKKDLYNHIDKENRAKIQDENAFAALCYLQAKFDNNPMTFVKFTTTEDDRLENLFWADVGSRIDYACFGDVVAFDTTYKKNKYNRPLVIFCGYNHHGETTIFGCALVSDEKTETYKWVLESFLEAMFNKFPKAVVTDGDGAMREAIRSVFPDSIHRLCSWHLHQNACENVKNPKFLEDFKKLIYANYTPKKFEQEWVQVIEKHGLSNNRWVLKVYDLKRMWATAFFRDNFFAGVRTTSICEGINSFIKRYVQSKNSLVDFLHNFERALNEYRHNELASDFKSSYTQPVLTTALEKYEVNACNVYTRNKFFEIRKQIEEVAALNMIERTEVGNVVTLKMNKFGSPDSVYLVLFDKSVGKFVCDFRLFESCGLPCSHIFCAMKHEQIESIPPSLICKRWTKFAKVDYISAIYADEGDTTKKEVLRSGAVGAACNRLNKAAHKDPHNFVKNIEAIHQLADQMERQDGVDVNIADISRVVRDPTIVKTKGAPRKSKKIMKRRKCSYCKRVGHTIRTCSKFSTRDQLHTVEEEESLVESDGESRDLTVMPCDIECCVRFSFLVIN. 756
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Seca5g01859 755 Pfam FAR1 DNA-binding domain 61 144 IPR004330 -
Seca5g01859 755 PANTHER OS01G0519700 PROTEIN 52 704 - -
Seca5g01859 755 Pfam MULE transposase domain 266 360 IPR018289 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Seca5g01859 Seca-Chr5 53811262 53813550 Dispersed/Wgd
       

Transcription factors information

Select Regulatory Factors Family Gene Hmm_acc Hmm_name E_value Clan
TF FAR1 Seca5g01859 MULE 2.9e-28 CL0219
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Seca5g01859 - - tpra:123910662 780.785