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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Seca2g03619 ATGGCTACAACTACTACAACAACCATAGTGTCTCTGTTCAAACGCATGGGTTTCACTTTGTTCTTGAACGCCTCGTTCCTCATGGTGTTTTGTGCTTTGGTTTTTGTTCATTTTCACTCTTCTTCAGAACATGTTGTTTTGAGGAGGAATAATCACTTTGCCTTTGGTGGTAGTGATGAGCAGGATTGTAAGAGCTTTCACAGCCTGAGTGATTACAAAGCTAAGTGCTTGTACCTGAAATCCAACAACCCATGTGTCTCTCAAGGCTATATTGATTACCTTTACCTTTTCTATTGCAAATTTGGGGGATTCCCTCTATTGGGTCACAGTCTTTTGTTTCTTTGGCTCTTGGTTCTATTCTACCTGCTGGCAAACACAGCTTCTGATTACTTTTGTCCTTCCCTTGAAAACCTGTCTAAATTGCTGAGGCTATCCCCTACAATTGCTGGAGTGACTCTTCTCTCTCTTGGTAATGGTGCCTGTGATGTTTTTGCCACACTTGTCTCTTTCAAGGGTAGTGGGACACGTGGCATTGGCCTTAACACCGTGCTTGGGGGTGCTTCCTTTGTGTCCTGTGTTGTGGTGGGAATAATAAGCATTTCAATTCGTCATAGAGGAAGTCAGGTTAAAAAGTCTGCTTTGATAAGAGATGTTTGTTTTCTTCTCTTGGTTCTTCTGTCCTTGTTCACTATTTTGATCAGTGGTGAGATCAATCTACTTGGGGCAATTGGTTTTTGTTTGATGTATGTGGTGTATGTGATTGTTGTTTGTGTCTCATCTGCCCGGAGGAAGGGTGTATGTGAAGATGCTGAAAGTGATTTTGATGGCAATTCAAGTCATGGCAATGGTTTAGGTGACCCTCTTCTCAGTGGGATGGAGAAGGGACTAGTTGATTTTGCTACAAATGGAGCTCAGGAATGTGACTTGAAAATTGAGAAGAAATGTTGCTGGAAGAAATCATCAATGTTTGGAATGTTACTTTATGTCTTGGAGATGCCCCTTTACTTGCCTAGGAGATTGACAATTCCTGTTGTTTGTGAAGAGAGATGGTCCAAGCCTTTTGCAGTTTCTTCAGCTATGCTAGCACCACTTCTATTGTCTTCCTTGTGGACCCCAGATAACAAGGGAACCAGTTTCTTCAACTCAAGCCTTATAGTTTATGGAATTGGATTCTTGGTTGGAATTATATTAGGGGTGATTGCATTTTTCACAACTGAGGTGTCAAGCCCACCAAGAAAATACTTGTTTCCTTGGCTTGTAGGAGGGTTTGTGATGAGTGTGGCATGGAGCTATATTTCAGCTCAGGAATTGGTAGGATTGTTGGTTTCACTTGGTTACATATGTGGAGTAAGTCCTTCAATACTGGGGTTAACAATTCTTGCCTGGGGAAATTCTATTGGAGATTTAGTGACTAATTTGACAATGGCTTTAAATGGTGGACCAGAAGGTACTCAAATAGCAATATCAGGTTGTTATGCTGGTCCTATCTTCAATACAGTTATTGGATTGGGGTTATCTCTTGTAAGCTCTACTTGGTCTGAATATCCATCATCTGTTTTGATCCCCAGAGATCCATATCTGTGGGAGACATTGACACTTTTGGTGGTTGCATTGGTTTGGGCACTTGTAGTTTTGATTAGAAGAGATATGAGGCTTGATGCAGTCCTAGGAGGAGGGCTATTAGTTGTTTACTTCATTTCTCTGTTTCTGAGGCTTATTCAGACACTTGGATCTCTCCAATTTCATGATATGTTAGTCTTTATCTTCCAAAGATGA 1776 0.4116 MATTTTTTIVSLFKRMGFTLFLNASFLMVFCALVFVHFHSSSEHVVLRRNNHFAFGGSDEQDCKSFHSLSDYKAKCLYLKSNNPCVSQGYIDYLYLFYCKFGGFPLLGHSLLFLWLLVLFYLLANTASDYFCPSLENLSKLLRLSPTIAGVTLLSLGNGACDVFATLVSFKGSGTRGIGLNTVLGGASFVSCVVVGIISISIRHRGSQVKKSALIRDVCFLLLVLLSLFTILISGEINLLGAIGFCLMYVVYVIVVCVSSARRKGVCEDAESDFDGNSSHGNGLGDPLLSGMEKGLVDFATNGAQECDLKIEKKCCWKKSSMFGMLLYVLEMPLYLPRRLTIPVVCEERWSKPFAVSSAMLAPLLLSSLWTPDNKGTSFFNSSLIVYGIGFLVGIILGVIAFFTTEVSSPPRKYLFPWLVGGFVMSVAWSYISAQELVGLLVSLGYICGVSPSILGLTILAWGNSIGDLVTNLTMALNGGPEGTQIAISGCYAGPIFNTVIGLGLSLVSSTWSEYPSSVLIPRDPYLWETLTLLVVALVWALVVLIRRDMRLDAVLGGGLLVVYFISLFLRLIQTLGSLQFHDMLVFIFQR. 592
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Seca2g03619 591 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 315 580 - -
Seca2g03619 591 Gene3D - 359 572 IPR044880 -
Seca2g03619 591 Gene3D - 144 270 IPR044880 -
Seca2g03619 591 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 113 256 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Seca2g03619 591 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 419 571 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Seca2g03619 Seca-Chr2 111924134 111925909 Dispersed/Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Seca2g03619 16 580 Antiporters AT5G17850 53.287 1.37e-176 509
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Seca2g03619 K13754 - gmx:100787016 803.127