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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Seca1g03375 ATGGCTTCAACTACAACAACCATAGTGTCTCTGTTCAAACGCATGGGTTTCACTTTGTTCTTGAACGCCTCGTTCCTCATGGTGTTTTGTGCTTTGGTTATTGTTCATTTTCACTCTTCTTCAGAACATGTTGTTTTGAGGAGGAATAATCAAATTTCCTTTGGTGGTAGTGATGAGCAGGATTGTAAGAGCTTTCACAGCCTGAGTGATTACAAAGCTAAGTGCTTGTACCTGAAATCCAACAACCCATGTGTCTCTCAAGGCTATATTGATTACCTTTACCTTTTCTATTGCAAATTTGGGGGATTCCCTCTATTGGGTCACAGTCTTTTGTTTCTTTGGCTCTTGGTTCTGTTCTACCTGCTGGCAAACACAGCTTCTGATTACTTTTGTCCTTCCCTTGAAAACCTGTCTAAATTGCTGAGGCTATCCCCTACAGTTGCTGGAGTGACTCTTCTCTCTCTTGGTAATGGTGCCTGTGATGTTTTTGCCACACTTGTCTCTTTTAAGGGTAGTGGGACACGTGGCATTGGCTTTAACACCGTGCTTGGTGGTGCTTCCTTTGTGTCATGTGTTGTGGTGGGAATAATAAGCATTTCAATTCGACATAGAGGAATTCAGGTTAAAAAGTCTGCTTTGATAAGAGATGTTTGTTTTCTTCTCTTGGTTCTTCTGTCCTTGTTCACTATTTTGATCAGTGGTGAGATCAATCTACTTGGGGCAATTGGTTTTTGTTTGATGTATGTGGTGTATGTGATTGTTGTTTGTGTCTCATCTGCCCGAAGGAAAGGTGTATGTGAAGATGCTGAAAGTGATTTTGATGGCAATTCAAGTCATGGAAATGGTTTAGGTGACCCTCTTCTCAGTGGGATGGAGAAAGGACTAGTTGATTTTGCTACAAATGGAACTCAGGGATGTGACTTGAAAATTGAGAAGAAATGTTGCTGGAAGAAATCATCAATGTTTGGAATGTTTCTTTATGTCTTGGAGATGCCACTTTACTTGCCTAGAAGATTGACAATTCCTGTTGTTTGTGAAGAGAGATGGTCCAAGCCTTTTGCAGTTTCTTCAGCTATGCTAGCACCACTTCTATTGTCTTCCTTGTGGACCCCAGATAACAAGGGAACCAGTTTCTTCAACTCAAGCCTTATAGTTTATGGAATTGGATTATTGATTGGAATTATATTAGGGGTGATTGCATTTTTCACAACTGAGGTGTCAAACCCACCAAGAAAATACTTGTTTCCTTGGCTTGTAGGAGGGTTTGTGATGAGTGTGGCATGGAGCTATATTTCAGCTCAGGAATTAGTGGGGTTGTTGGTTTCACTTGGTTACATATGTGGAGTAAGTCCTTCAATACTGGGGTTAACAATTCTTGCCTGGGGAAATTCTATTGGAGATTTAGTGACTAATTTGACAATGGCTTTAAATGGTGGACCAGAAGGTACTCAAATAGCAATATCAGGTTGTTATGCTGGTCCTATCTTCAATACAGTTATTGGATTGGGGTTATCTCTTGTAAGCTCTACTTGGTCTGAATATCCATCATCTATTGTGATCCCTAGAGATCCATATCTGTGGGAGACATTGGCACTTTTGGTGGTTGGATTGGTTTGGGCACTTGTAGTTTTGATTAGAAGAGACATGAGGCTTGATGCAGTCCTAGGAGGAGGGCTATTAGTTGTTTACTTCATTTCTCTGTTTCTGAGGCTCATTCAGACACTTGGATCTCTTCAATTTCAGGATATGCTAGTCTTTATCTTCCAAAGATGA 1773 0.4061 MASTTTTIVSLFKRMGFTLFLNASFLMVFCALVIVHFHSSSEHVVLRRNNQISFGGSDEQDCKSFHSLSDYKAKCLYLKSNNPCVSQGYIDYLYLFYCKFGGFPLLGHSLLFLWLLVLFYLLANTASDYFCPSLENLSKLLRLSPTVAGVTLLSLGNGACDVFATLVSFKGSGTRGIGFNTVLGGASFVSCVVVGIISISIRHRGIQVKKSALIRDVCFLLLVLLSLFTILISGEINLLGAIGFCLMYVVYVIVVCVSSARRKGVCEDAESDFDGNSSHGNGLGDPLLSGMEKGLVDFATNGTQGCDLKIEKKCCWKKSSMFGMFLYVLEMPLYLPRRLTIPVVCEERWSKPFAVSSAMLAPLLLSSLWTPDNKGTSFFNSSLIVYGIGLLIGIILGVIAFFTTEVSNPPRKYLFPWLVGGFVMSVAWSYISAQELVGLLVSLGYICGVSPSILGLTILAWGNSIGDLVTNLTMALNGGPEGTQIAISGCYAGPIFNTVIGLGLSLVSSTWSEYPSSIVIPRDPYLWETLALLVVGLVWALVVLIRRDMRLDAVLGGGLLVVYFISLFLRLIQTLGSLQFQDMLVFIFQR. 591
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Seca1g03375 590 Gene3D - 143 269 IPR044880 -
Seca1g03375 590 Gene3D - 357 571 IPR044880 -
Seca1g03375 590 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 315 579 - -
Seca1g03375 590 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 418 570 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Seca1g03375 590 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 112 255 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Seca1g03375 Seca-Chr1 97108950 97110722 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Seca1g03375 15 579 Antiporters AT5G17850 53.979 3.73e-178 514
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Seca1g03375 K13754 - gmx:100787016 809.675