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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Sebi995g00016 ATGAATATGAATTCTGAAAATAATGAAGATGGTTTTCGTTTCTTGATGGAGGATGAAGTTGGAGGTGTATTTGTAGTAGATGAAACTTGGGTTGACAAATGTGTAGTTGAAGATGAAGGGGAAAATGATGAAGATGGGGATGTTGTCTTTGTTGATCATGATTGGGAAGATAGCAATGAGGGAGAAGGAAATGAAGATGAATTACAGGGGGAAACAAAATTAATGAACAATGAAGATGATATTCTGAATATGGGGGAGCTCAATTTGTTTAGTCCCCATGAAATTAAGAATTGGGAATTTGGTAATTTGGATGTGGCTTGCAAGTTCTATTTTGAATATGCAAAAGCCAATGGATTTAGTATACGCAAGGGCAGAACATTGAGGAATAGGAAGACCTTGGAGGTGTATCAGAAAGAATTTTTATGCTCCAGAGCCGGTACCCGTGAAGATAGGGGTCTTAGAATGGAAGATAGGGTTCGTGAGCCTAGAGCTGTAACTAGATGTAATTGTTCAGCTAAATTTGTAGTCCATGTGAACAAGTTATCTGGTCGATGGTTTTGTGTTTGCTTTGTTGATGAGCATAACCATGACCGATTAGGGGCAGTTCATTGCAGTATGCTTCCTGTCTATAGAAAAATGGGTGACAGTGATGTGGTACAAATGAACAACATGATTAAGGTTGGTATCAGGCCACCTAATATATTCAGTTCATTTGCTAGTCAGTCAGGAGGGTATGAGAAGATTGGGTTTAGTAAGAAAGACATGTATAACAAGATAAATGAGCAGCGGCGGAAGGTTTGTTCTGATGCTAAAGGCGCTGTCCAATTCCTTGGTGAGCTTCGACTGATTGATACTATGATGTATTTTGAACACACCGTTGATGCAGAAGGTAGGCTTCAACATCTATTTTGGAGTGATGGCATGAGTCAAGTGGATTACAAGATGTATGGGGAAGTGTTGGCATTTGATGCAACCTATGGTAAGAATAAGTACTTTATGCCACTGGTTGTTTTTTGTGGAGTTAATAACCACAATCGGAGCACAATATTTGCTGTTGCCATAATTGCAAACGAGACTGAGGAGACATACGTGTGGATTTTGGAGCAGTTTTCAAAAGCAATGAAAGAGTTCACAAAAGCGTTTGAGGATTGTATGCTTCGTTACTATGATATTGCGACATTTCGGAGAAAATGGAATGAAATTATAACAAAATTTGGTCTTGAAGAGAATCCTTGGGTTGTTGGTTTGTTTGAAAAGAGGACTATGTGGGCTACAGCTCATCTTAGGGGGAAATTCTTTGGTGGATTCAGAACAACTTCTAGGTGTGAGGGCTTGCATTCAGAGTTATCAAAGTTTGTGAGCTCTAGATACAATTTGAGTGATTTCTTACAGCATTTTCATCGTTGCTTAGGTCATATGCGTTTCAAAGAGAAAGAAGATGATTTCACATCAATACATGGGGACCCTGTAATGCAAAGTCAGCTCCAATCACTTGAAAGTTATGCTGCCAGAGTGTACACAAGGAGAGTATTTTTCTTGTTTCGGCGGGTGTTGCATAGGGCGTCACAGTTGGTAGTCACTGGATATACCCAAGTTGTTCGATGCACTATATTCAAAGTGAGAGGCCAATCTGTTCAGTCATATGAATGTCGTGTATCAGTGTATCCGTCCACAAAAGAATTTAAATGTGGTTGTTTAAAAATGGAGTCAAGAGGCTTACCGTGTGAGCATATTGTTGCTGTCTTGGATCACTTGGGGATTGATGAAATACCAGATACATTGGTTCTAAAACGGTGGACGAAGGGTGCTAAAGACGGTATATGTGGAGAAGATGGGGAGAGATATGAAACATGGGATGCTGCTAGGAGTGCTCGGAGGGCAGCACTAAATGGTTGGTACGATCAAGTTAGTTGTTTTAAGGCTGAAACTATAGAAAAATATAATATAGAGCGAGACAGGATACTTATTGACCTCAAAGAATGCAGGGCGGAAAAATCGGCCGAACAAGAAAGATGTGGGTTTTCTGGTAATGTTGCTAATGACACATTGAGGAACCCCGTGCGTGCAGCAACCAAGGGCAGCGGGGTTGCAACATCTTCTTCTGGTATAAGAGTTAGAAGAAAACAAAATTGTTCTATTTGTAAGCTTCCGGGACACAACAAATTGACATGCCCAAGGGGTGCTCAACAATATGAACCAACACAGCAAGGTGGAGCAGCTGGAACCTCTCAGACTGTTGAACATGATGATGTTTTTCATGATTATGAAGAATTTGATCTTGATAATATGGATGCTTCAAGTTCTTTTGGTGGTAATAGCTCCAGCTCAAACAACACGGGGTTCATGGCTAAGACATGCAAGTGCAGCAAGAATGTTGCTATGATAACCTCTTGGACTGAGAATAATCCTGGGAGGAGGTTCTTAGGGTGTGCAAACTACAAGGAATCAACCACGCATTGTGATTATTTTGTTTGGTTTGACCCACCATCATGTGAGAGGTATGTCAAAATTATGAATTCCTTATTGAAGAAGAACAACAATTTACAAACTAAAATTTCAGAGCATAACCATGAAATAGGGGAGTTAAAAACTATAATTGCATCTCAAGAGGGAGACCTCGTGGAACTTAAGATGAAAGTTCTGTCCTTTAGAGGTGACATAAATAGGCTCAAAATGGTTTTATGTTGCATGGTTGGTTTTATTATTGCACTTGTGATTACTTATGTTGTCTGA 2733 0.3985 MNMNSENNEDGFRFLMEDEVGGVFVVDETWVDKCVVEDEGENDEDGDVVFVDHDWEDSNEGEGNEDELQGETKLMNNEDDILNMGELNLFSPHEIKNWEFGNLDVACKFYFEYAKANGFSIRKGRTLRNRKTLEVYQKEFLCSRAGTREDRGLRMEDRVREPRAVTRCNCSAKFVVHVNKLSGRWFCVCFVDEHNHDRLGAVHCSMLPVYRKMGDSDVVQMNNMIKVGIRPPNIFSSFASQSGGYEKIGFSKKDMYNKINEQRRKVCSDAKGAVQFLGELRLIDTMMYFEHTVDAEGRLQHLFWSDGMSQVDYKMYGEVLAFDATYGKNKYFMPLVVFCGVNNHNRSTIFAVAIIANETEETYVWILEQFSKAMKEFTKAFEDCMLRYYDIATFRRKWNEIITKFGLEENPWVVGLFEKRTMWATAHLRGKFFGGFRTTSRCEGLHSELSKFVSSRYNLSDFLQHFHRCLGHMRFKEKEDDFTSIHGDPVMQSQLQSLESYAARVYTRRVFFLFRRVLHRASQLVVTGYTQVVRCTIFKVRGQSVQSYECRVSVYPSTKEFKCGCLKMESRGLPCEHIVAVLDHLGIDEIPDTLVLKRWTKGAKDGICGEDGERYETWDAARSARRAALNGWYDQVSCFKAETIEKYNIERDRILIDLKECRAEKSAEQERCGFSGNVANDTLRNPVRAATKGSGVATSSSGIRVRRKQNCSICKLPGHNKLTCPRGAQQYEPTQQGGAAGTSQTVEHDDVFHDYEEFDLDNMDASSSFGGNSSSSNNTGFMAKTCKCSKNVAMITSWTENNPGRRFLGCANYKESTTHCDYFVWFDPPSCERYVKIMNSLLKKNNNLQTKISEHNHEIGELKTIIASQEGDLVELKMKVLSFRGDINRLKMVLCCMVGFIIALVITYVV 910
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Sebi995g00016 910 Coils Coil 644 664 - -
Sebi995g00016 910 PANTHER OS01G0519700 PROTEIN 97 375 - -
Sebi995g00016 910 Pfam MULE transposase domain 319 378 IPR018289 -
Sebi995g00016 910 ProSiteProfiles Zinc finger GRF-type profile. 786 829 IPR010666 GO:0008270
Sebi995g00016 910 Coils Coil 838 858 - -
Sebi995g00016 910 Pfam SWIM zinc finger 562 585 IPR007527 GO:0008270
Sebi995g00016 910 ProSiteProfiles Zinc finger SWIM-type profile. 548 586 IPR007527 GO:0008270
Sebi995g00016 910 Pfam FAR1 DNA-binding domain 108 197 IPR004330 -
Sebi995g00016 910 SMART 26again6 561 588 IPR006564 GO:0008270
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Sebi995g00016 Sebi-Chr995 169548 173164 Dispersed/Transposed
       

Transcription factors information

Select Regulatory Factors Family Gene Hmm_acc Hmm_name E_value Clan
TF FAR1 Sebi995g00016 FAR1 1.4e-19 CL0274
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Sebi995g00016 - - tpra:123913749 645.58