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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Sebi46g00020 ATGGGTGATTTGAATTTGGGTTGTGATAATAATGTGGTAGTTAATGAAACAGAATCAATTGAGAATAGTAGTTTTCCTTGTTATTTGGAAGATGATGACGGAGGTGTATGTGTAGTAGATGAGAATTGGGGAAATAATAGTGATGTTTATGGTGATGAAGATAATGGTGGAAGTCCTTCTTCGAAGAATAGTGATTCTTTGGGAGGTGCTTTCTTTTGTGGTGATGAGAATGGGGTTGCTTTCTTGGTGGGAGAAGATTGGGAAGATAGTAATGATAACGGTCAGGGTGATAATTGTGGTGATGATAAAATTGTAATTGAAACAAATGATGATGTTATTAACATAAGAGATTTGGCTTTGTTTAGTCCACATGAGATTGAGAGTTATGAATTTGGTAGTATTGAGGTAGCATACAAGTTCTATCATGAATATGGGTTTGCTAATGGTTTTGGAATAAGAAGGGGGAGAACTTTAAAGAGCAAAAAACATTGGAGGCGTATCAAAAAGAGTTTATGTGTTGTAGAGCTGGAAAGCGTGAAGATCGTGGTCAAAAAAAAGGAAGAGAGAGTCCGTGAGCAGAAGGCAGAAACTAGGTGTGAATGTAAGGCGAGATTTCATATTCATGTGAATAAGTTATCTGGTAGGTGGTATTGTGTTTGCTTTGAAGATGAACACAACCATGGTCGGTTAGGTGAAGTGCATTTTAGTGTGTTACCAAGTTATAGAAGAATGTCTGACAGTGACATTGTACAAATGAATAACATGATGAAGGTTGGGATTAGGCCACCTAATATATTTAACACATTTGCTAGTCAGTCGGGTGGTTATGAGAAGATAGGTTTTAGAAAGAAAGACATGTATGACAAGATAGGTGAGCAGAGGCGAAATTTATGTTCTAATGCTAAAGGAGCCATTGAATACCTTGGTTTGCTTGGTCTAAATGATCGTATGATGTATTATGAGCACACTGTTGATGAACATGGTAGGTTGCAACATCTTTTTTGGAGTGATGGATATAGCCAAGTGGATTACAACATTTTTGGGGAAGTGCTAGCATTTGATGCAACATATGGCAAGAATAAGTATTTAATGCCGCTAGTTGTATTCTCTGGTGTTAATAGTCATAATCGTTCCACTATATTTGCAGCTGCTATTATTGCCAATGAGACCGAGGAGACATATGTTTGGCTTTTGGAGCAGTTTTCAAAATGTATGAAGGGTAAGTTGCCTAGTGTTGTAATCACTGATGGTGATGTAGCTATGAAAAATGCTATTGAAAGGGTATTTCCAAATGCTTATCACAGGTTATGTGCATGGCACCTCATGAGGAATGCCACTTCTAATATAAAAAATGAAGATTTCACAAAAGCATTTGAGGATTGTATGCTTGGCTATTATGATGTGGGGACATTTAGAAATAAATGGTTAGAATTGGTTGTAAAATTTGGGCTTGAAGAGAACCCATGCGTGGCTGCTTTATATGAGAAGAGGAGTATGTGGGCAACAACTTATTTGCGGGGTAAATTTTTTGCTGGCTTTAGAACCACCTCTAGGTGTGAGGGATTGCATTCTGAGTTGGGAAAGTTTGTAAATTCACGGTATAATTTGAGTGACTTCTTGCAACATTTTCAGTGTTGCCTCAATCATATGCGTTTCAAAGAGAAGGAGGATGACTATACTTCAATTCATGGGGAGTCAGTGATACAAACTCAGTTTGAAGCACTTGAAAGATCAGCTGCTAAAGTGTATACAAGGAGGGTTTTCTTCCTATTTAGGCGAGTGCTGTTTAGGGCTTCAGAGTTGATAGTTACTGATATAGCAAAGGCAGTTCGATGTGTTATTTTTCGAGTGATCAACCAAACGGGAATGAATTGGGAATGTCGTGTTTCGTTGTATGACTCCACCAATGAATTAAAATGTGCCTGCCTTAGAATGGAGTCTAGAGGGCTACCTTGTGAGCACATAGTTACTGTGTTGAATCATTTAGGGATTGATGAGCAGCCAGAAAGTTTTGTCCTTAACAGGTTGAGCAAGGCTGCGAAGGATGGTTTGGGTGGTACAGAGTTTGAGACTAATCATAGTTTGGATGCTGGTTTCAGTGCTCGTAGGGCAGCACTGAATGGTTTCTATAATCATATTAGTGAGGCTGACGGTGGAATTGTTCAGGATGTGGGAGCATCAGCTGGAAATGGTAGGAATGGCATTCTGAGGGACCCTGTACGTGCAGCGACAAAAGGCAGCGGTGGTGCATCAACATCTTCAGGCATTAGAGTTAGGAAAAAAAACTGTTCTATCTGTAAACTTCCAGGACACAACAAAGTCACTTGTCCATCTGTTGGCCAACAATCTTCTGCGCGTAATCAGTTCAATGTTGATGGATCTTCACAATTTGATGGTGATGAATTTGATAGGAACAAAGAATATGAGCAGTTTGACCCTGAAATGTGGATGTGA 2454 0.3912 MGDLNLGCDNNVVVNETESIENSSFPCYLEDDDGGVCVVDENWGNNSDVYGDEDNGGSPSSKNSDSLGGAFFCGDENGVAFLVGEDWEDSNDNGQGDNCGDDKIVIETNDDVINIRDLALFSPHEIESYEFGSIEVAYKFYHEYGFANGFGIRRGRTLKSKKHWRRIKKSLCVVELESVKIVVKKKEERVREQKAETRCECKARFHIHVNKLSGRWYCVCFEDEHNHGRLGEVHFSVLPSYRRMSDSDIVQMNNMMKVGIRPPNIFNTFASQSGGYEKIGFRKKDMYDKIGEQRRNLCSNAKGAIEYLGLLGLNDRMMYYEHTVDEHGRLQHLFWSDGYSQVDYNIFGEVLAFDATYGKNKYLMPLVVFSGVNSHNRSTIFAAAIIANETEETYVWLLEQFSKCMKGKLPSVVITDGDVAMKNAIERVFPNAYHRLCAWHLMRNATSNIKNEDFTKAFEDCMLGYYDVGTFRNKWLELVVKFGLEENPCVAALYEKRSMWATTYLRGKFFAGFRTTSRCEGLHSELGKFVNSRYNLSDFLQHFQCCLNHMRFKEKEDDYTSIHGESVIQTQFEALERSAAKVYTRRVFFLFRRVLFRASELIVTDIAKAVRCVIFRVINQTGMNWECRVSLYDSTNELKCACLRMESRGLPCEHIVTVLNHLGIDEQPESFVLNRLSKAAKDGLGGTEFETNHSLDAGFSARRAALNGFYNHISEADGGIVQDVGASAGNGRNGILRDPVRAATKGSGGASTSSGIRVRKKNCSICKLPGHNKVTCPSVGQQSSARNQFNVDGSSQFDGDEFDRNKEYEQFDPEMWM 817
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Sebi46g00020 817 ProSiteProfiles Zinc finger SWIM-type profile. 625 663 IPR007527 GO:0008270
Sebi46g00020 817 PANTHER PROTEIN FAR1-RELATED SEQUENCE 10-RELATED 126 684 IPR031052 GO:0006355
Sebi46g00020 817 Coils Coil 176 196 - -
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Sebi46g00020 817 Pfam FAR1 DNA-binding domain 139 227 IPR004330 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Sebi46g00020 Sebi-Chr46 795690 798321 Dispersed/Transposed
       

Transcription factors information

Select Regulatory Factors Family Gene Hmm_acc Hmm_name E_value Clan
TF FAR1 Sebi46g00020 MULE 3.4e-30 CL0219
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Sebi46g00020 - - tpra:123913749 651.358