Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Sebi45g00025 ATGTCAACTCAAGATATGGAGAAAATGGTACTAAACCAAACAATTTACCGTAATGCAGTGCTAAACTATAAATTGACAGACCCAGATCACAGATTTTTAGTATTTAATGTTTGCATTGATGTGCCACCCAATATAGTATCTGATGGCTTATGGGGTGAGCCAATTCGTGGCGCATTACAACCTTCAAGGTCAACATTGCCACTATTTGAGATGCAAATTCTCACCATTTTCATGATCACACAATGCTTTCATTTGATACTCAAGCGCCTAGGAATCCCCTATTTCGTTTCACAAGTAATGGCCGGGTTTGTTCTAGGCCCTTCTTTCAAGATTTCAGATTCATGGATGGAATTCAAACACTTTTTGTTTCCTTATGGGAGTGAAGATATGTTGTCCATGATATCATTATTTGGCTATGCATTCTTCCTGTTTCTGAATGGTGTGCAAATGGATTTTAGCATGATAACAAGAACTGGTGTGAAAGCTTGGACAATTGCATTTTCTTCCCTTGTGATTCCCACAGTTTTAGGCCTTATCGTTAGCTACAATTACATGGAGAATTGGCAATTATCCCTTGGAGAGTTTGATGCAAAAAATCTCCCTGTGGTTGTGATTGGTCACACTGGCTGTTCCTTTGCAGTGATAGCTTCTTTGCTATCTGATCTTGAGATTCTCAATTCTGAACTTGGACGCCTTGCACTATCAGCAGGTTTGGTGATGGATGTGATCACTACTGTTGGGTCAGGAGTAGGCACTGCTATTATTAGCAGCATCAAAACTGATTCTCATGATGATGTACAAGGAAAAGGAACCAAACTTGCTCTTTTTAGTTCCTCAGTATATTTGGCTTTTATTATCCTCATTCCTCTCTTTGCCCGTCCTATAATGAGGTTGTTTGTGAGATACACTCCAGAGGGAAGACCTGTGAGGAAGATATACACCTATATGGTGGTCCTTATGGCCCTTGGTGTAGGTCTGTTGGGAATGTTTTCCCGCCAGAGTGCCTTAGCTGGGATATTAATAGTTGGTCTTGTAGTCCCGGAAGGTCCTCCACTAGGATCTGAATTGATTAAGCAATTTGAGTTGTTCTCCACATGGTTCCTTTTACCACTCTTTATCACAAGTTGTACCATGAAGGTGGACATTACCCTGCACATAAATAACAAGTTGGTTATTACTATGGTGGGCATCATCATTGCTGTCCATTTGCTCAAGATGCTTATAACAGTTGGAATTTGTAGGTATTGCCACATGCCTAAAACAGATGGTTTATGCCTTGCTCTCATGTTGAGCTGCAAAGGTGTTGTGGATTTTTGCACCAATGTGTTCATGCATGATGCAATGCTACTGAGCAATGAAGCATTTGCCATTATGACTATATCTGTGTTGTTGTTGGGAACCATGTCACATGTTGCTGTGAAGCTCTTGTATGACCCTTCAAGGAAATATGCAGGGTATCAGAAGAGGAACATCTTGAACTTGAAACCAAACTCAGAGCTTCGGATTGTTTCATGTATCCACAAACCAAGTCACATAATTCCCATCAAGAATGTTCTTGACATGTGCTGTCCTACATCAAGCAATCCATTGGTAGTGCATGTCTTGCATCTGATGGAGCTTGTTGGAAGATCTTCCCCCATTTTTATTGCTCACCGCCTTCAAGAGAAGATTGGTTCAGGTCATCACAACTTCTCTGAGGATATCATTGTTACCTTTGACCTTTTTGAACAAGACAATGCAGGCACTGCATCAGTGAGTTCCTACACAGCTATATCACCATTGCGCTTCATGCATGATGATATATGCTATCTTGCATTGGACAAACTTGCATCCATCATCATTCTTCCATTTCATGTGAGATGGGCAGATAATGGTTCTGTTGAGTCAGAGGATGACAACATAAGGTCTTTGAATTCTAGGGTCCTTGAAAGGGCACCATGCTCAGTGGGGATCCTTGTGAATAGAGGGTCATCTTCTAACCACACTAATTCAAAGCAAATAGCCATGATTTTCTTAGGGGGTGCAGATGATAGAGAAGCATTGTGCTTGGCTAAAAGAACAATCAAAGAATGCGCTTATAGCTTGGTAGTGTACCACTTGGTTTCAAACAATGAAGACTTCACAAACTGGGATGTTATGCTAGATGATGAGCTACTAAAGGGTCTTAAGGGAGCTTATGGTAGTGTAGAGAATGTGACATATGAAAAAGTCACTATTGAGAACCCTTCAGAAACCACAGCTTTTGTCTCAGATGTGGCAAATCATTATGATTTCATTATAGCTGGGAGAAGAAATGGGGTCAAATCTCCTCAGACAGCAGCACTTGAAAATTGGATGGAGTATTCTGAATTAGGTGTTATTGGAGATTTGCTTGCTTCCCCAGATACCAATACTAAAGCTTCTATTTTAGTTGTACAGCAACAACTAATGCCCAAGTCATGA 2442 0.4066 MSTQDMEKMVLNQTIYRNAVLNYKLTDPDHRFLVFNVCIDVPPNIVSDGLWGEPIRGALQPSRSTLPLFEMQILTIFMITQCFHLILKRLGIPYFVSQVMAGFVLGPSFKISDSWMEFKHFLFPYGSEDMLSMISLFGYAFFLFLNGVQMDFSMITRTGVKAWTIAFSSLVIPTVLGLIVSYNYMENWQLSLGEFDAKNLPVVVIGHTGCSFAVIASLLSDLEILNSELGRLALSAGLVMDVITTVGSGVGTAIISSIKTDSHDDVQGKGTKLALFSSSVYLAFIILIPLFARPIMRLFVRYTPEGRPVRKIYTYMVVLMALGVGLLGMFSRQSALAGILIVGLVVPEGPPLGSELIKQFELFSTWFLLPLFITSCTMKVDITLHINNKLVITMVGIIIAVHLLKMLITVGICRYCHMPKTDGLCLALMLSCKGVVDFCTNVFMHDAMLLSNEAFAIMTISVLLLGTMSHVAVKLLYDPSRKYAGYQKRNILNLKPNSELRIVSCIHKPSHIIPIKNVLDMCCPTSSNPLVVHVLHLMELVGRSSPIFIAHRLQEKIGSGHHNFSEDIIVTFDLFEQDNAGTASVSSYTAISPLRFMHDDICYLALDKLASIIILPFHVRWADNGSVESEDDNIRSLNSRVLERAPCSVGILVNRGSSSNHTNSKQIAMIFLGGADDREALCLAKRTIKECAYSLVVYHLVSNNEDFTNWDVMLDDELLKGLKGAYGSVENVTYEKVTIENPSETTAFVSDVANHYDFIIAGRRNGVKSPQTAALENWMEYSELGVIGDLLASPDTNTKASILVVQQQLMPKS 813
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Sebi45g00025 813 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 50 808 - -
Sebi45g00025 813 Gene3D - 69 484 IPR038770 -
Sebi45g00025 813 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 76 464 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Sebi45g00025 Sebi-Chr45 680189 682982 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Sebi45g00025 37 805 Antiporter Super Family AT3G44900 35.705 2.65e-160 485
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Sebi45g00025 K26731 - gmx:100778180 1100.89