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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Rops6g03580 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6150 0.4093 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2050
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Rops6g03580 2049 Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 483 592 IPR026899 -
Rops6g03580 2049 Gene3D - 180 338 IPR023175 -
Rops6g03580 2049 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 335 2042 - -
Rops6g03580 2049 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 1173 1862 IPR003440 GO:0000148|GO:0003843|GO:0006075|GO:0016020
Rops6g03580 2049 SMART FKS1_dom1_2 481 595 IPR026899 -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Rops6g03580 Rops-Chr6 60736056 60796532 Dispersed/Tandem
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Rops6g03580 147 2047 Cell Wall Biosynthesis AT3G07160 76.310 0.0 3026
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Rops6g03580 K11000 - gmx:100811473 3434.81
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Rops6g03580 6 60736056 60796532 Rops6g03580 6 60736056 60796532 ECH