Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Rops5g01202 ATGTGGATGTTGATGCTTGTGACAGCTATTAACTGGATCGCGTGGTTCCCTTACTTCTTGTTCGACACTGATTGGATGGGTCGTGAGGTTTATGGTGGTGAGACTGGTGATGATGCTTATGCAACTGGTGTCCATAATGGTTCCTTAGGACTCATGCTTAACTCGGTTGTTCTTGGTGTGATGTCTTTGGCTGTTGAGCCTTTGGCACGTTTGCTTGGTGGTGTGAAGAGGTTGTGGGGTATTGTTAACTTTATTCTTGCTATTTGCTTGGCAATGACTGTGTTGATTACCAAGATGGCTGAGCATGAGCGACAACTCAACCCTGCTGCTGTTGGGCACCCTTCCAATGGTGTCAAGGCTGGTGCCTTGAGTTTCTTCACCGTTCTGGGAGTTCCTCTTGCGTGTCCCATTCGCTCTCGCATCAATCTATTCCGCCGCTTAAGGGGCTGGTCAAGGTTTGTCTTTGGGAGTATTGAATCTTGCAATTGTGATTCCACAGATGGTGGTGTCGGCATTAAGTGGACCTTGGGACGATTTGTTTGGTGGTGGCAACTTGCCAGCTTTCGTGGTGGGTGCAGTGATGGCTGCCATTAG 594 0.4865 MWMLMLVTAINWIAWFPYFLFDTDWMGREVYGGETGDDAYATGVHNGSLGLMLNSVVLGVMSLAVEPLARLLGGVKRLWGIVNFILAICLAMTVLITKMAEHERQLNPAAVGHPSNGVKAGALSFFTVLGVPLACPIRSRINLFRRLRGWSRFVFGSIESCNCDSTDGGVGIKWTLGRFVWWWQLASFRGGCSDGCH* 198
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Rops5g01202 197 PANTHER SUGAR TRANSPORTER 1 135 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Rops5g01202 Rops-Chr5 25784878 25786551 Proximal
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Rops5g01202 1 175 Sucrose Transporter Gene Family AT1G66570 54.144 3.49e-60 192
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Rops5g01202 K15378 - gmx:100785899 223.402