Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pumo5g02369 ATGTCCTCTACCATGGTTTCTCTCTCCAAACGCATGGGGTTCACCTTGTTCTTGAACACCTCCTTCCTCGTGATTGTGTTTTGTGTTTCTCTTGTTGTTCCCTTCCAATCTTCAGAACATGATATTGTTCTGAGGAGCAACAACCGCTTTGCCTTTAGGGATGAACACGATTGCAAGAGTTTCCACAGTTTGAGGGACTCCAAAGCCAAGTGCTTGTACTTGAAATCCAATGATCCATGTGTCTCTCAGGGCTATGTTGACTACCTTTACCTTTTCTATTGCAAATTTGGGGGGTTCCCTCTGTTGGGTCACAGTCTTTTGTTTCTTTGGCTTTTGGTTCTGTTCTATATGTTGGCCAATACTGCCTCTGAGTACTTTTGTCCCTCTCTTGAGAACTTGTCCAAATTGCTGAGGCTCTCTCCCACAATTGCTGGGGTGACTCTTCTCTCTCTTGGCAATGGTGCTTGTGATGTTTTTGCCACCCTTGTCTCTTTCAAGGGTAGTGGGACCCGTGACATTGGTTTCAACACTGTGCTTGGGGGTGCTTCCTTTGTGTCCTGTGTGGTGGTTGGAATAGTGAGCATTGCAATAAGGCATAGGGGGATTCGGGTTAAGAAGTGGGCCTTGGTGAGAGATGTTTGTTTTCTCCTCTTGGTTCTTCTGTGCTTGTTAATCATCTTGATCGCTGGTGAGATCAATGTTCCTGGGGCAATTGGCTTTTGCTTGATGTATGTGGTTTATGTGGTGGTTGTTTATGTCTCATCTACCCGAGGGAACAAGGGTGTGTGTGGAGAAGCTGATATTGATGGTGATTTGAATCATGCTGGTGGCAGTGATTTATCTGTCCCTTTGCTCAGTGGAATGGAGAAAGGACTTGCAAATGGAACTCAGAAATGTGACATGAAAATTGAGAGGAAACGTTGCTGTTTACAATCTTCAATGTGTAAAACGTTACGTTTTGTCTTGGAGATGCCACTTTATTTGCCTAGGAGATTGACGATTCCTGTTGTTTGTGAAGACAGATGGTCCAAAGTTTATGCAGTTTGTTCAGCTATGCTAGCACCACTTCTATTGTCTTCCTTGTGGATACCAAACAAGGGAAACAGCCTCAACTCAAGCCTTATTGCTTATGGAATTGGATTGTTGGTTGGGATTATATTAGGGGTAACTGCATTTTTCACAACCAATGTGTCAAACCCTCCAAGGAAGTACTTGCTTCCTTGGCTTGCAGGAGGGTTTGTGATGAGTGTGACTTGGAGCTACATTTCAGCTCAGGAATTGGTGGGGTTGTTGGTTTCACTTGGTTACATATGTGGAGTTAGTCCTTCAATACTAGGGCTAACAGTTCTTGCTTGGGGGAATTCACTTGGGGATTTGGTGACAAATTTGACAATGGCTTTGAATGGTGGGTCAGAAGGTGCTCAAATAGCAATATCAGGTTGTTATGCTGGGCCTATCTTCAATATAGTGGTTGGATTGGGCTTATCTCTTGTGAGCTCTTCTTGGTCTGAGTACCCTGTTGTGATCACTAGAGATCCATATCTGTGGGAGACATTGGCACTTTTGGCAGTTGGATTGGTTTGGGCACTTGTTGTGTTGATTAGAAGAGACATGAAGCTTGATGCACTATTGGGAGGAGGGCTTTTGGTTATTTACTTCATTTCTCTGTTTCTGAGGCTGATTCAGACACTCGGGTCTCTCCAATTTCAGGATATGTTGTTAGGCTAA 1728 0.4398 MSSTMVSLSKRMGFTLFLNTSFLVIVFCVSLVVPFQSSEHDIVLRSNNRFAFRDEHDCKSFHSLRDSKAKCLYLKSNDPCVSQGYVDYLYLFYCKFGGFPLLGHSLLFLWLLVLFYMLANTASEYFCPSLENLSKLLRLSPTIAGVTLLSLGNGACDVFATLVSFKGSGTRDIGFNTVLGGASFVSCVVVGIVSIAIRHRGIRVKKWALVRDVCFLLLVLLCLLIILIAGEINVPGAIGFCLMYVVYVVVVYVSSTRGNKGVCGEADIDGDLNHAGGSDLSVPLLSGMEKGLANGTQKCDMKIERKRCCLQSSMCKTLRFVLEMPLYLPRRLTIPVVCEDRWSKVYAVCSAMLAPLLLSSLWIPNKGNSLNSSLIAYGIGLLVGIILGVTAFFTTNVSNPPRKYLLPWLAGGFVMSVTWSYISAQELVGLLVSLGYICGVSPSILGLTVLAWGNSLGDLVTNLTMALNGGSEGAQIAISGCYAGPIFNIVVGLGLSLVSSSWSEYPVVITRDPYLWETLALLAVGLVWALVVLIRRDMKLDALLGGGLLVIYFISLFLRLIQTLGSLQFQDMLLG 575
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pumo5g02369 575 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 108 252 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Pumo5g02369 575 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 409 559 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Pumo5g02369 575 Gene3D - 346 560 IPR044880 -
Pumo5g02369 575 Gene3D - 139 264 IPR044880 -
Pumo5g02369 575 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 312 568 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pumo5g02369 Pumo-Chr5 66033587 66036080 Dispersed/Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pumo5g02369 9 568 Antiporters AT5G17850 52.622 4.24e-170 493
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Pumo5g02369 K13754 - gmx:100787016 914.064