Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pumo3g00061 ATGTCTCGAGCTGAGGAACTTTGGGAGCGGTTAGTCCGTGCTGCATTGAGGAGGGAAAGGACTGGTGATGATGCATATGGGCGACCTGTTGGTGGCATTGCCGGAAATGTACCATCTGCCCTAGCTAAAAATAGGGATATCGATGAAATTTTGAGAGTTGCTGATGAAATTGAAGATGATGATCCCAATATCTCAAGAATATTATGTGAGCATGCATATTCGTTATCTCAAAATTTGGATCCAAACAGTGAAGGCCGAGGTGTTTTACAATTCAAGACTGGTTTGATGTCTGTCATCAAGCAAAAGCTGGCTAAAAGAGAAGCTGGAACCATAGATAGAAGTCAGGACATAGCTCGGTTACAAGAGTTCTACAAGAGTTATAGAGAGAAGCATAATGTGGATAAATTACGCGAGGAAGAAATGAAGTTGAGGGAATCTGGTGCTTTCAGCCGGGATCTTGGCGAGTTGGAGCGCAAGACTGTGAAGAGGAAAAGGGTTTTTGCTACCTTAAAGGTTTTGGGAACAGTACTTGAGCAGCTGAGTGAAGAAATTCCTGATGAGCTGAAGCGGGTCATGGACTCAGATTCTGCATTGACAGAGGATCTTATTGCGTACAACATCATCCCCTTAGATGCTTCCTCTTCAACAAATGCTATTGTTTATTTCCCTGAGGTGCAAGCAGCTGTTTCAGCTTTGAAGTATTTCAATGGCTTGCCGGAGTTGCCTAGGGGCTATTTCATTCAAGCTACAAGGAACGCTAACATGTTCGATTTTTTGCAGTGTACTTTTGGATTTCAGAAAGATAATGTAGCTAATCAGCATGAACACATAGTTCACCTGCTTGCAAATGAGCAATCTCGACTTAGAATTCCAGAAGAAGCTGAACCTAAATTGGATGAAGCTGCCGTGCAGGCAGTATTCCTCAAGTCCCTTCAGAATTACATAAACTGGTGTGACTATTTAGGCATTCAGCCTGTTTGGAGCAGTTTGGAGGCTGTCAGTAAAGAGAAGAAATTACTATATGTTTCTTTGTACTTCCTAATATGGGGTGAAGCCTCAAATATCAGGTTTCTACCAGAATGCTTGTGCTACATATTCCATCATATGGCTAGAGAGATGGATGAGATGTTAAGGCAGCAGATTGCACAGCCAGCTAATAGTTGCACTTATGATTCTAAGGATGGTGTCTCATTTCTTGATAATGTTATCTTTCCTCTCTATGATATTGTTTCCGCAGAAGCTGCAAACAATGATAACGGGAAAGCGCCTCATTCCTCCTGGAGAAATTATGATGATTTTAATGAGTATTTCTGGTCACTCCGTTGCTTTGAGCTTAGTTGGCCTTGGCGCAAAACTTCTCCATTTTTCCAAAAGCCACAACCCAGATCAAAGAAAATGCTTATATCTGGCAGCAGTAGGCATCAGGGAAAAACATCGTTTGTGGAGCATCGAACTTTTTTTCATCTTTATCATAGCTTCCATCGATTGTGGATATTTCTTTTCATGATGTTTCAGGGTCTAACGATCCTTGCATTCAATGATGGAAAGCTTAATGCCAAGACTTTGCGAGAGGTTCTTAGTCTTGGACCTACATTTGTTGTGATGAAATTTTTTGAGAGTGTTCTGGACATTTTCATGATGTATGGTGCATATTCAACAACAAGGCGCTTAGCAGTCTCTCGAATTTTTTTACGTTTTCTTTGGTTCAGCTTTGCTTCAGTTTTCATAACTTTTCTTTATGTAAAAGCACTCCAGGAAGAGAGTAAAAGAAATGGAAACTCGGTTGTCTTCAGATTGTATGTGATTGTCATAGGGATTTATGCCGGTGTCCAATTTTTCATTAGTTTCCTCATGCGGATTCCGGCATGTCATCGTCTAACAAATCAATGTGATCGTTGGCCTTTAATTCGTTTTGTGAAGTGGCTGCGCCAGGAACGACATTATGTTGGACGGGGAATGTATGAAAGGAGTTCAGATTTCATAAAGTATATGCTGTTTTGGCTTGTTATTTTGAGTGGAAAATTTGCGTTTGCTTACTTTCTTCAGATCAGGCCACTGGTGGCCCCAACAAGGGATATTATAGAAGAGGATAATATAAATTACTCTTGGCATGATTTTGTCTCTAAAAATAATCATAATGCTCTGACAGTTGTTAGCGTGTGGGCTCCTGTGGTTGCTATTTATCTTCTAGATATTTATGTGTTTTACACACTTGTATCGGCTGTCTGCGGATTCTTGCTGGGGGCAAGAGATCGACTGGGAGAGATTAGGTCATTGGAAGCGCTGCACAAACTTTTTGAGCAGTTTCCTGGAGCTTTTATGGACACACTTCATGTTCCTCTACCCAACAGGAGTTCCCGTCAGTCTTCTGTTCAGGTTGTGGAGAATAGCAAGGTTGATGCTGCTCGGTTTGCCCCCTTTTGGAATGAGATCATAAGAAATCTAAGGGAGGAGGATTATGTAACTAACTTCGAAATGGAGTTGCTTTTAATGCCTAGGAATTCTGGGGATCTTCCTTTGGTTCAATGGCCACTTTTTCTACTTGCAAGCAAGATATTTTTGGCTAGGGATATTGCTGTTGAGAGTAAAGATACTCAAGATGAGCTTTGGGATAGGATTTCCCGAGATGATTATATGATGTATGCTGTTCAGGAGTGTTACTCTGCTATTAAATTCATTTTGACTGAGATATTAGATGATGTGGGAAGGAAGTGGGTTGAAAGGATATATGATGATATTAATGCTAGTATCACAAAGAAGAGTATTCATCTAGACTTCGAACTAAGTAAGTTGGCTCTTGTGATATCAAGAGTAACTGCATTGATGGGAATCCTGAAAGAGACTGAAACACCTGAACTGGAAAGGGGTGCAGTTAGGGCTGTACAGGATCTGTATGATGTTATGCGACATGATGTCTTTTCTATAAATATGAGGGAGAATTATGACACATGGAGTTTACTGACCAAAGCTAGGGATGAAGGGCATTTGTTTGAAAAGTTGAAATGGCCCAAGAATACAGATTTAAAAATGCAAGTCAAAAGATTGTATTCACTGCTGACTATCAAAGAGTCTGCCTCAAGCATTCCTAAAAATCTTGAGGCCAGGCGACGACTGCAGTTTTTCACAAATTCACTTTTTATGAAGATGCCTCGTGCAAAGCCAGTTCGGGAGATGTTATCCTTTAGTGTTTTCACTCCTTATTATTCTGAGATCGTGCTTTATAGCATGGCTGAACTCCTAAAGAAAAATGAAGATGGCATTTCAATTTTGTTCTACCTTCAGAAGATATATCCAGACGAGTGGAAAAACTTTCTTGCCCGAATTGGCCGTGATGAAAACACACTTGAGAGTGAACTTTATGATAATCCTAGTGATATTCTTGAACTGCGATTTTGGGCTTCATATCGGGGGCAAACATTGGCCAGAACAGTTCGGGGGATGATGTATTATAGGAAAGCTCTTATGCTTCAGGCCTATTTGGAGAGGACAACAGCTGGAGATTTGGAGGCTGCAATAGGTTGTGATGAAGTAACTGATACACATGGCTTTGAATTATCCCCCGAGGCACGTGCCCGGGTGGACCTTAAGTTCACTTATGTTGTAACATGTCAAATTTATGGTAAGCAGAAAGAAGAGCAAAAGCCTGAGGCTGCTGATATTGCTTTACTTATGCAAAGAAATGAAGCTCTTCGGGTCGCTTTCATTGATGTTGTTGAAACTTTAAAAGAGGGAAAAGTGAACACAGAATACTACTCAAAGCTTGTGAAAGCTGATATCAATGGGAAAGACAAGGAGATATACTCGGTGAAGTTACCTGGAAATCCCAAATTGGGTGAAGGGAAGCCCGAGAATCAAAATCATGCAATTATATTTACGCGTGGAAATGCAGTCCAAACAATTGACATGAATCAGGATAACTATTTTGAGGAGGCTTTGAAGATGAGGAACCTTCTTGAAGAATTTCATTCTGATCATGGGCTGCGTCCTCCTAGTATACTTGGTGTTAGAGAACATGTCTTTACCGGCAGTGTCTCATCTTTAGCGTCATTTATGTCCAATCAAGAAACTAGTTTTGTGACTTTGGGGCAGCGAGTTTTAGCAAATCCATTGAAGGTCCGCATGCACTATGGGCATCCTGATGTTTTTGATAGAATATTCCACATAACTCGTGGTGGTATCAGCAAGGCTTCCCGTGTTATCAACATTAGTGAAGATATCTATTCAGGATTCAATTCAACCTTACGTCAAGGAAATATTACACATCATGAATATATTCAGGTTGGTAAGGGAAGAGATGTTGGGCTCAATCAGATTGCACTATTTGAAGGAAAAGTTTCAGGTGGTAACGGTGAACAAGTTCTCAGTCGTGATGTATACAGACTTGGGCAGCTTTTTGATTTCTTCCGGATGCTGTCTTTTTATTTTACAACAGTTGGATACTACTTTTGTACCATGCTAACAGTGCTGACTGTATATGCCTTTCTTTATGGGAAAGCGTATTTGGCACTATCTGGTGTTGGTGAATCCATTGAAGAAAGGGCTAGGATAACTAAGAATACAGCACTGAGTGCTGCTTTGAATACACAATTTCTCTTCCAAATTGGTATCTTCACTGCTGTGCCAATGGTCTTGGGCTTCATTCTTGAGCAAGGTTTTTTGAGGGCCATTGTTAGTTTTGTCACAATGCAGTTCCAGCTCTGCACTGTCTTTTTCACATTTTCCTTGGGTACAAGAACACATTATTTTGGTCGGACCATTCTTCATGGCGGTGCAAGGTATCAAGCAACTGGCCGCGGGTTTGTTGTCCGCCATATCAAATTTTCGGAGAACTACAGACTCTACTCTCGTAGTCATTTTGTTAAAGGGTTGGAGGTTGTGCTTTTGTTGATAGTATATCTTGCTTATGGCTATAATGAAGGTGGTGCACTCTCGTATATTCTTTTGAGTATAAGCAGTTGGTTTATGGCTCTATCCTGGTTGTTTGCTCCATATTTATTCAACCCGTCTGGATTTGAGTGGCAAAAGGTGGTGGAAGATTTTCGAGATTGGACAAATTGGCTACTTTACCGAGGTGGAATTGGTGTCAAGGGAGAAGAAAGCTGGGAAGCTTGGTGGGAAGAAGAACTGGCTCATATCAGGAGCTTGGGTTCAAGGATAGCAGAAACCATTCTGAGTCTTAGATTTTTCATCTTTCAATATGGTATTGTGTACAAGCTTAACGTGAAAGGAACAAGTACTTCACTGACGGTTTATGGATTCTCATGGGTAGTTCTGGCTGGGCTTATAATTCTTTTCAAGGTATTCACCTTTAGCCAGAAGATATCGGTCAATTTCCAGCTTGTTTTGCGCTTTATACAAGGACTCTCCCTTTTGGTGGCACTGGCTGGTATAGTTGTAGCAGTTATATTGACCGACCTGTCTTTACCTGACATATTTGCTTCTATGTTGGCTTTCATTCCTACTGGATGGGGAATTCTGTCGATTGCTTCTGCCTGGAAGCCGGTGATGAAGAGGTTAGGACTATGGAAATCTGTTCGATCAATTGCTCGCCTGTATGATGCTGGTATGGGAATGCTCATCTTTGTACCCATTGCCTTCTTTTCGTGGTTCCCATTTGTATCAACATTCCAAACTCGCCTCATGTTTAACCAGGCTTTTAGCCGAGGGTTAGAAATTTCTCTAATTCTAGCTGGGAACAATCCAAATACTGGGATATAG 5718 0.4099 MSRAEELWERLVRAALRRERTGDDAYGRPVGGIAGNVPSALAKNRDIDEILRVADEIEDDDPNISRILCEHAYSLSQNLDPNSEGRGVLQFKTGLMSVIKQKLAKREAGTIDRSQDIARLQEFYKSYREKHNVDKLREEEMKLRESGAFSRDLGELERKTVKRKRVFATLKVLGTVLEQLSEEIPDELKRVMDSDSALTEDLIAYNIIPLDASSSTNAIVYFPEVQAAVSALKYFNGLPELPRGYFIQATRNANMFDFLQCTFGFQKDNVANQHEHIVHLLANEQSRLRIPEEAEPKLDEAAVQAVFLKSLQNYINWCDYLGIQPVWSSLEAVSKEKKLLYVSLYFLIWGEASNIRFLPECLCYIFHHMAREMDEMLRQQIAQPANSCTYDSKDGVSFLDNVIFPLYDIVSAEAANNDNGKAPHSSWRNYDDFNEYFWSLRCFELSWPWRKTSPFFQKPQPRSKKMLISGSSRHQGKTSFVEHRTFFHLYHSFHRLWIFLFMMFQGLTILAFNDGKLNAKTLREVLSLGPTFVVMKFFESVLDIFMMYGAYSTTRRLAVSRIFLRFLWFSFASVFITFLYVKALQEESKRNGNSVVFRLYVIVIGIYAGVQFFISFLMRIPACHRLTNQCDRWPLIRFVKWLRQERHYVGRGMYERSSDFIKYMLFWLVILSGKFAFAYFLQIRPLVAPTRDIIEEDNINYSWHDFVSKNNHNALTVVSVWAPVVAIYLLDIYVFYTLVSAVCGFLLGARDRLGEIRSLEALHKLFEQFPGAFMDTLHVPLPNRSSRQSSVQVVENSKVDAARFAPFWNEIIRNLREEDYVTNFEMELLLMPRNSGDLPLVQWPLFLLASKIFLARDIAVESKDTQDELWDRISRDDYMMYAVQECYSAIKFILTEILDDVGRKWVERIYDDINASITKKSIHLDFELSKLALVISRVTALMGILKETETPELERGAVRAVQDLYDVMRHDVFSINMRENYDTWSLLTKARDEGHLFEKLKWPKNTDLKMQVKRLYSLLTIKESASSIPKNLEARRRLQFFTNSLFMKMPRAKPVREMLSFSVFTPYYSEIVLYSMAELLKKNEDGISILFYLQKIYPDEWKNFLARIGRDENTLESELYDNPSDILELRFWASYRGQTLARTVRGMMYYRKALMLQAYLERTTAGDLEAAIGCDEVTDTHGFELSPEARARVDLKFTYVVTCQIYGKQKEEQKPEAADIALLMQRNEALRVAFIDVVETLKEGKVNTEYYSKLVKADINGKDKEIYSVKLPGNPKLGEGKPENQNHAIIFTRGNAVQTIDMNQDNYFEEALKMRNLLEEFHSDHGLRPPSILGVREHVFTGSVSSLASFMSNQETSFVTLGQRVLANPLKVRMHYGHPDVFDRIFHITRGGISKASRVINISEDIYSGFNSTLRQGNITHHEYIQVGKGRDVGLNQIALFEGKVSGGNGEQVLSRDVYRLGQLFDFFRMLSFYFTTVGYYFCTMLTVLTVYAFLYGKAYLALSGVGESIEERARITKNTALSAALNTQFLFQIGIFTAVPMVLGFILEQGFLRAIVSFVTMQFQLCTVFFTFSLGTRTHYFGRTILHGGARYQATGRGFVVRHIKFSENYRLYSRSHFVKGLEVVLLLIVYLAYGYNEGGALSYILLSISSWFMALSWLFAPYLFNPSGFEWQKVVEDFRDWTNWLLYRGGIGVKGEESWEAWWEEELAHIRSLGSRIAETILSLRFFIFQYGIVYKLNVKGTSTSLTVYGFSWVVLAGLIILFKVFTFSQKISVNFQLVLRFIQGLSLLVALAGIVVAVILTDLSLPDIFASMLAFIPTGWGILSIASAWKPVMKRLGLWKSVRSIARLYDAGMGMLIFVPIAFFSWFPFVSTFQTRLMFNQAFSRGLEISLILAGNNPNTGI 1905
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pumo3g00061 1905 Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 338 447 IPR026899 -
Pumo3g00061 1905 Gene3D - 34 192 IPR023175 -
Pumo3g00061 1905 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 1028 1718 IPR003440 GO:0000148|GO:0003843|GO:0006075|GO:0016020
Pumo3g00061 1905 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 142 1898 - -
Pumo3g00061 1905 SMART FKS1_dom1_2 336 450 IPR026899 -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pumo3g00061 Pumo-Chr3 877905 924549 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pumo3g00061 1 1905 Cell Wall Biosynthesis AT3G07160 77.330 0.0 3075
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Pumo3g00061 K11000 - gmx:100811473 3662.08