LGRPv2

Gene search

Sequence information

Select	Gene	Cds	Cds_length	GC_content	Pep	Pep_length
	Pumo147g00107	ATGCAAAATACTGCAAAAAAAGCCACCTTGCCTGTAATTACCCTTGCAGCGCTTGGGGTTGTATTCGGAGACATTGGCACCAGCCCATTGTATGCCCTGAAAGAGTCATTCCATGCCGCGCATGGATTAGGAATTACGACAGCTAATGTATTGGGTATTTTATCAATCATATTTTGGACAATGATGCTGGTCATTACCCTCAAATATGTTGCTATTGTGATGCGTGCCGATAACAACGGCGAGGGCGGTATTATGGCGCTCCTTGCATTGAATCTACGCAATGCAGAATTTAGTGATCGCAAAAAACTATTGTTAATTGCCATCGGGTTTATTGGTGCATCCCTGTTTTTTGGGGATGGTATTATTACACCTGCCATCTCTGTTTTATCTGCAGTAGAAGGTCTGTCTATCGCAACACATGCTTTAGATCCTTATATTGTTCCAATTGCCATCACCATTGTGAGCATACTTTTCGTAATGCAAAAGTATGGGACTGCTTTTGTCGGGAAGTTCTTTGGACCATTAACCATGTTGTGGTTCATTTCTTTAGGTGTATTGGGAATTTCCAGTATTCTGCAAACCCCAGTGGTGCTTGGAATGTTTAGTCCACACTGGGCGTTCCATTTCATCTATACCCATCCCATGATGACTTTCTTTATTATGGGGGCTGTGGTGTTAACCGTGACGGGTGGTGAGGCATTGTATGCCGATATGGGGCACTTTGGTCCTGTTCCTATTCGCTTGGCATGGTTCTTTGTGGTGTTGCCGTGCTTGGTCTTGAATTATGCAGGTCAAGGTGCATTGTTACTACGAGATCCAACGGCAGTTAAAAATCCATTTTACTTCTTAGTTCCAGAATGGGCGCTTTATCCTATGATTTTCTTGGCGACAATGGCAGCAGTCATTGCGTCTCAAGCGGTCATTTCGGGCGTGTTTTCACTGGCGCGTCAAGCCATTCAACTGGGCTATTTACCACGTTTAACCATTAAACATACCTCCGATTCAGAACAAGGGCAGATTTATGTGCCGCTTCTGAATTGGGTACTGTTGGCATCTATTATTGTTCTGATTTTAATTTTCCAAACCAGCTCGCGGTTAGCCAATGCTTACGGTTTGGCTGTCACGTTGACGATGCTATGCGATACCTTATTAATTGCCGTATTTATTCGTTATACATGGAAATGGAATTTGCCAAAACTGGTGTTGTTGATCATTCCTTTCCTTGTTTTGGATATTGTGTTGGTCAGCGCAACATCGTTAAAAGTGCTTTCTGGAGGTTGGGTTCCATTATTAATTGGTGGGATTGCATTCTTATTGTTAATGACATGGAAGCAAGGTCGCGAACTGACCTTTGCCAAGTTGCAACAAGATACCTTGCCACTTGAATTGTTTGTCCAAAGTATTGGTGAGCAAGCCAATTGGGTAGATGGTGAAGCGGTCTTTTTGACAGGAACGCCGACTGTTGTGCCACATGCTATGTTGCATAATATGAAGCATAACAAAGTTTTACATCAGAAAAATATTATTCTGACGGTAAAAATTCAGGATGTTCCTTATGTGGATGATGAACAGCGTTTCAAAGTTGAAGATTTAAATCCGCATTTTTATCGGGTTGAATTGTATTACGGTTTCAAAGATGAAATGAATATTCCTCACGCACTTGAAGGCGTATATCGCGCCATCGATTTGGAATATAACCTGATGCAAATTAGTTTCTTTGTTTCGCGTGAACGTATTATCAGTACTGTAGGGGACGGCATGGCATCATGGCGTGAAAAACTCTTTATTTCGATGCAACGAAATACCAGTCCTGTGAGTGATTTTTATCAAATTCCACCGAACCGTGTGGTTGAGCTTGGCAGTCAGATCGAAATCTAG	1878	0.4223	MQNTAKKATLPVITLAALGVVFGDIGTSPLYALKESFHAAHGLGITTANVLGILSIIFWTMMLVITLKYVAIVMRADNNGEGGIMALLALNLRNAEFSDRKKLLLIAIGFIGASLFFGDGIITPAISVLSAVEGLSIATHALDPYIVPIAITIVSILFVMQKYGTAFVGKFFGPLTMLWFISLGVLGISSILQTPVVLGMFSPHWAFHFIYTHPMMTFFIMGAVVLTVTGGEALYADMGHFGPVPIRLAWFFVVLPCLVLNYAGQGALLLRDPTAVKNPFYFLVPEWALYPMIFLATMAAVIASQAVISGVFSLARQAIQLGYLPRLTIKHTSDSEQGQIYVPLLNWVLLASIIVLILIFQTSSRLANAYGLAVTLTMLCDTLLIAVFIRYTWKWNLPKLVLLIIPFLVLDIVLVSATSLKVLSGGWVPLLIGGIAFLLLMTWKQGRELTFAKLQQDTLPLELFVQSIGEQANWVDGEAVFLTGTPTVVPHAMLHNMKHNKVLHQKNIILTVKIQDVPYVDDEQRFKVEDLNPHFYRVELYYGFKDEMNIPHALEGVYRAIDLEYNLMQISFFVSRERIISTVGDGMASWREKLFISMQRNTSPVSDFYQIPPNRVVELGSQIEI	625

Annotation information

Select	Seq ID	Length	Analysis	Description	Start	End	IPR	GO
	Pumo147g00107	625	PANTHER	OSMOTIC STRESS POTASSIUM TRANSPORTER	10	98	IPR003855	GO:0015079\|GO:0016020\|GO:0071805
	Pumo147g00107	625	Hamap	Low affinity potassium transport system protein Kup [kup].	6	625	IPR023051	-
	Pumo147g00107	625	Pfam	K+ potassium transporter	15	546	IPR003855	GO:0015079\|GO:0016020\|GO:0071805

Functional genes information

Select	Gene	Gene_start	Gene_end	Function	Ath_gene	Identity(%)	E-value	Score
	Pumo147g00107	2	546	Inorganic Solute Cotransporters	AT5G14880	32.833	3.74e-96	310

Pathway information

Select	Query	KO	Definition	Second KO	KEGG Genes ID	GHOSTX Score
	Pumo147g00107	K03549		-	acb:A1S_3254	1003.05