LGRPv2

Gene search

Sequence information

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	Pste8g00528	TTTCTTTTCCTTCTGTCATGCACTTTGCCACACACACTCTTCCCCAAAAGTGCTTTTTTCTTCTCTCTCTTTCTCTCGCTTCTCTTAGTTAGGGTTTCTCACTTTCTCTCTCATTTGAACCACAGATTCAGATTCTCTCTTCTTCTTCCATTTCTATTTCCAGTTTCCAACTCGCCCGAGTCCACTCGCTTCCTCTCACAGCCCTAACTCTCTCCGACTCGTCCAAACGCGGTGCTTCGATGATTCCGAGATGGAAATGGAAGATTCTAGAGTGGAGAATTTGATTAGGGCTAAGAAATCGTTGAAGCAGAGCTTAGAGAAATCGAACTCGGTAGGGTTAGCGTTGAAGAGGGCGGGTCCGAGGTTGGAGGAGATTAGGCAGCGTTTGCCGTCGCTCGAATCGGCGGTGCGGCCGATTCGGGCGGAGAAGGACGCCCTCGGTGCGGTTGGCGGCCACATCAACCGCGCCGTGGGCCGCGGCGGCGGTGCTGAAGAAAAATCGCTCCTTTCGGACCCCAGGACCGACTTGGCCGGTTACCTGTCGGTGCTGAAGCGCCTCCAGGAGGCGTTGAGGTTTTTGGGGGATAATTGTGGGCTGGCCATACAGTGGCTGGAGGATATAGTTGAGTATTTGGAGGATAATTGTGTTGCTGATAGGGTTTATTTGAAGAATTTGAAGAAGGAATTGAAGAATCTTAGGGAATTGCAGCATGGGGAGCTTGATGGGGGGTTGTTGGATGCTGCATTGTGTAAGTTGGAGGATGAGTTTAGGTTGTTGTTGACTGAGAATAGTGTGCCTTTGCCTATGCTGGCTGGTGGTGATCTGGCCTGCATTGCGCCGTCGCTGCTGCCGGTGTCGGTTATTCACAAGTTGCAGGCCATTCTTGGGAGGTTGGTTGCTAATGATAGGTTGGAGAGGTGTGTGGAGATTTATGTTGAGGTTAGGAGTGAGAATGTGAGGAAGAGTTTGAGGGCCTTGAATTTGGATTACTTAGAGGTTTCTGTGACAGAGTTTAATGATGTGCAGAGCATTGAGGGGTATATTGGTCAGTGGGGGAAGCATTTGGAGTTTGCCGTGAAGCATTTGTTTGAGGCTGAGTATAAGCTTTGCAATGATGTGTTTGAGAGGATTGGGTTGGATGTTTGGATGGGTTGCTTTTCAAAGATTGCTGCCCAGGCAGGTATAGTTGCGTTTCTTCAGTTTGGGAAGACAGTCACTGATAGTAAGAAGGATCCTATTAAACTTTTGAAGTTGTTGGATATTTTTGCGTCATTGAATAAGTTGAGATTGGATTTCAATCGGCTTTTTGGTGGTGCTCCATGTGTTGAGATACAGAATTTGACGAGGGATCTTATTAAGAGGGTGATTGATGGGGCTGCGGAGATTTTCTGGGAGCTTTTAGTTCAGGTGGAGTTGCAGAGGCCGAATCCGCCCCCGATGGATGGTAATGTCCCGAGATTGGTGAGCTTTATCACTGATTACTGCAACAAGTTGCTAGGGGACGACTATAAGCCAATATTGACTCAGGTTCTGATCATTCACAGAAGTTGGAAGCGTCAAAGCTTTCAGGAGAAGCTCCTTGTTACTGAGATTTTGAACATAGTTAAGGCTGTTGAGCAGAATGTGGAGACTTGGATCAAGGCTTATGATGATCCTATATTGTATTTGAAGGGGACAAAGCTTGGGGAGCTCTTGGGAGATTCTTGGTTGAGGGAGCATGAACAGTACAAGGACTATTACTCCACAATCTTCTTGAGGGACAGTTGGGGAAAGCTTCCTGGACATTTGAGTAGGGAAGGGCTAATTCTTTTCTCTGGAGGGCGAGCCACTGCCCGTGACCTGGTCAAACAAAGGTTGAAGAAGTTCAATGAAGTATTCGATGAGATGTTTACAAAGCAGTCGAGTTGGATCATGCCAGAACGAGATTTGAGAGAGAAGACATGTCAACTTATAGTACAAGCAGTGGTGCCTGTTTACCGCAGTTACATGCAGAATTATGGTCCTTTGGTTGAGCAAGATGCAAGCTCCACAAAATATGCAAAGTATACAGTGCAGAAGCTTGAAGAAATGCTTTTGTGTCTTTATCGGCCAAAGCCGGTAAGACATGCCAGCTTGAGAAGTCCAACATTTAATGCAAAATACAGCAATGGAGTACCCGATCTTCGCAGAACAGCATCTGCAGTTTTTAGTTTCTCTTCTGAGATGAAAAACTGGTTACTATCTCCCTTGCTCAGAGGTTTCTTCAAAAGCTATGCCATCTGTAAAACA	2269	0.465	MEMEDSRVENLIRAKKSLKQSLEKSNSVGLALKRAGPRLEEIRQRLPSLESAVRPIRAEKDALGAVGGHINRAVGRGGGAEEKSLLSDPRTDLAGYLSVLKRLQEALRFLGDNCGLAIQWLEDIVEYLEDNCVADRVYLKNLKKELKNLRELQHGELDGGLLDAALCKLEDEFRLLLTENSVPLPMLAGGDLACIAPSLLPVSVIHKLQAILGRLVANDRLERCVEIYVEVRSENVRKSLRALNLDYLEVSVTEFNDVQSIEGYIGQWGKHLEFAVKHLFEAEYKLCNDVFERIGLDVWMGCFSKIAAQAGIVAFLQFGKTVTDSKKDPIKLLKLLDIFASLNKLRLDFNRLFGGAPCVEIQNLTRDLIKRVIDGAAEIFWELLVQVELQRPNPPPMDGNVPRLVSFITDYCNKLLGDDYKPILTQVLIIHRSWKRQSFQEKLLVTEILNIVKAVEQNVETWIKAYDDPILYLKGTKLGELLGDSWLREHEQYKDYYSTIFLRDSWGKLPGHLSREGLILFSGGRATARDLVKQRLKKFNEVFDEMFTKQSSWIMPERDLREKTCQLIVQAVVPVYRSYMQNYGPLVEQDASSTKYAKYTVQKLEEMLLCLYRPKPVRHASLRSPTFNAKYSNGVPDLRRTASAVFSFSSEMKNWLLSPLLRGFFKSYAICKT	673

Annotation information

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	Pste8g00528	673	PANTHER	EXOCYST COMPLEX PROTEIN EXO70	39	608	IPR004140	GO:0000145\|GO:0006887
	Pste8g00528	673	Gene3D	Exocyst complex component Exo70	122	620	-	-
	Pste8g00528	673	SUPERFAMILY	Cullin repeat-like	81	612	IPR016159	-
	Pste8g00528	673	Pfam	Exo70 exocyst complex subunit	267	608	IPR046364	GO:0000145\|GO:0005546\|GO:0006887

Duplication type information

Select	Gene	Chromosome	Start	End	Duplicated_type
	Pste8g00528	Pste-Chr8	2720952	2723659	Dispersed

Functional genes information

Select	Gene	Gene_start	Gene_end	Function	Ath_gene	Identity(%)	E-value	Score
	Pste8g00528	5	645	EXO70 exocyst subunit family	AT4G31540	68.189	0.0	940