Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste8g00192 TTCTGCTGGGTCTCATCTTAGCACTCAAAAAAGCTAAGCATCCATCTTTGATTGAAGCTTGTTTTGGTTATTTATTTTTTGTTATTTCATGAGTTGCGATCATCTTCTCTTGACAAAACAAAAAAGCAAGTGAATAACTTGACATTTATTTTCACGTTTTCAATAGTTGTTGTGTTGTGTCCTTGTTTTTTTTATCTTTCATTCATTCTCTTTGAATCACATAGTTATCAAAGAGACCACTAACAGACCATTCAGTTTCCTTCGGCAGTAATCATATATTTATTTTGTTTTCAAACATTGAATTAATCTTCTTTGAAGTTGAAGTTCATCACAGTTATGTTTCTAAGAAACCCTTCTTACACAAACCCAGAACCTTGCCAGCATCTTGCTGAGTACAAGCTCAAGCATGGCTTTAATGGCTACAAAGCCATCCAAAAGCTGCTTGTGATCTCTCCAATTGGGAAAACCAGTGTGAAGAAACCCACCACAAAGGTACCCAGATGCAGTTTCTGCAATGGGTGTGAAGGGAGGTTCTATTTATGCTTGATTTGTTCTTCATTCTCATGTTTGGATCACACCCTTTTCCACTCTCAATCAGAAACTGGTCATGCTGTTTTTGTAGACATTGAAAGGGCTGAACTTTATTGTGGAGTGTGCCGTGATCAATTGTATGACCCTGATTTTGACCAAGTTGTGATGTCTAAGCACTCATTGGGGGTCGGAAGTGGTGCCACTCGGAGTGAAAGCATTGGCCAGAGGTTGATCAAGAGGAGGAAATTGGTTTCTGGGGTTGGATTTGATTTGCAGAAATCTAAGTGTGGAGTTTCCACCAAAGATCTGAGGGCTAAATCATGTTATCCTATGGGGTTGAGGGGGTTGAACAATCTGGGTAGCACGTGCTTCATGAATTCTGTGCTGCAAGTGTTGCTTCATGCTCCTCATTTCAGGGACTATTTCCTGAGTGGTGGACACCGGTTGGAAGCTTGTCATCACAGGAGAACCACGGATCAGATGTGTTTGCTTTGTGATGTTAATGCTATTTTTTCAGCTGTGTATTCGGGGGATCGAAGTCCATATAGTCCTGCTCAGTTTCTCTTCAGGTCTGATAATACTGCTGTCATACTCATACTCTTGCATTTTAGATTTTGTCTCATGAAAATAGTGGCTGGCATTGATCAGATTAGAAAGGTCTAATGATCTGTTTCAGTATGCTTTTTATGGTGCTTTCAAATGCTCCTGATTAAAAAAAATGGCTCATTTGTGAATTGTTTGATTTTGAGTTCTCTAATACTTGTTATGAGATATCTCATGGTCAATAATTGATCCAATCCATGGGATTGTGTCACATAGTAAGATAAGGCTTTCGTTGTTTTTGGTTGTTGCTGCTGCTGTTGTTATTGAGTTTTCTGATATTCAACCAGCTGGAGTTGAATTGTTTGAGTAAGTTTATTAAAGAGGCAGTTCATTGATTCCATGAGCCTGTCAATTATTATGAAAATATGCGATTTGGTCTGACTGAAGCTCCAGGGAACATTTCTGTGACTAAGTATTTTTTGAGTGCTTATGTTATGTGTCTGCTTTAACTCAATCATTTTCCTGATAAGTTGTGTTCATGATAAGTTTGAAGTTGATAATCTGTTTCTATGAATCAAGTTGCAAGTTAGCTGGAGCAGTGCCAATTGAAATAAAAAACATTTATAGCTTTGGATTTGGACCCATTATGTTGCCTTGGTGCTCAAATTCTTGTTTCTTTTGAATGGTGAAACTTTTTCTTTCTGTTTCAAGCTGGTGGCAGCATTCGGCAAATTTAGCGAGTTATGAACAGCAGGATGCTCACGAGTTTTTCATTTCAATCTTAGATGCAATCCATGAGAAAGATGGCAAATTATGGAACAGTTGCAAAGGTAATGGAGATTGTCAATGCATAGCTCATAGGGTATTCTATGGGTTATTAAGATCAGATGTTACCTGTATGACCTGTGGATTCACCTCAACAACCTATGACCCTTGTGTAGACATTTCACTTAACTTGGACACAAATGTTTCTTCGGTAGAAAAGGGTAAAAAGCTTTCCAAACGGAATGAGGACGGCAGTATGTCTACACTTTCAGGTTGTTTAGATTTGTTCACAAGGCCAGAGAAGTTAGGGTCAGACCAGAAACTTTACTGCCAGAATTGTCAGGAAAGGCAGGACTCATTGAAGCAAATGTCCATTAAAAAGCTTCCATTAGTACTTAGTTTACATGTAAAACGATTTGAGCACTCTTTTGTTAAAAATTGTTCAAGAAAAATAGACCGCTACCTACACTTCCCATTTTCCTTAGACATGACTCCATATTTGTCCTCCTCTATCCTCAGAGCAAGATATGGAAATCGAATTTATACTTTTGGCGGTGATGAATCAGATATGTTTTCTGAGTTTGAGATTTTTGCAGTGGTGACACATTCTGGGACGCTCGAGTCTGGCCACTATGTTTCATTCATGCGTTTAAGGAATCAATGGTACAAATGTGATGATGCTTGGATAACTGAGGTTGACGATGCTACAGTCCGAGCATCACAGTGTTACATGATTTTTTATGTACAGAAAACTATGCACAACAAAGCAAATGAAGACCCGAGTCACGTGCCAAATTCCCCACGAAGAGAGCTATTTCTTCCTATTGCTGGATGTTGCTAGAGAGGAAGATTATAAAATGGGTACATGACAATCAAAGAGTGGATTATAATGTGTGTTTTCTGTGACATTGAAAACCAGCTCAATGCTCAGCGAGGGAATTTATTTTCTTCTTATTTTCCCTCAGGTTTGGAGAATCACAGTTCATAGTTTACAAGATGGATTTGCAATATGACCTTAAAAGTTCAGACTGCTAAATCATGGATATGGGAATGATAAGCTAGGTTGCTAATTTGATTCTAACTGAATATTTGCATGTGGTTTTATCATTAGCACATTGAAACAAAGATCAAGGAGCCAGAAGTGACTCAACTCCTTCACAACTTTTCACACTATGCTTACTCAAATTCTTTAATTGCAGGTAGTCATGTACATAACTCTTTTTCAACTGATGCTAACGATAGTTGTAAAAAAACATTATTACTCTTCTGTATCCACCAAGTTTGGAGAAAAAGAAAGCTAAGGGCGAAAACGAGATTATGTGGATGACTGTCCAACAAGGACATTGTAATATGTAATAATACTCATAGTCATAGTCCAATGTGCACATTGCATTATGTCTCCCTTTTATTGAGAGAGTGCAGATTACTTAAATGGGTTGCTTCTTTGGTGCACAATAGGCCAGGGTTTTGTTGAAGGCAAGTTTATTCTTTAAAGGTGTTGTGAGGAATATTATTGCCCTAACTTGAAGTATTGTTTGCTGATTGAGTGAAAAACATGTTGCTATGGATTGGTAATATCTGATATTGAAGTCAAGAAAGTAGTTCTTTGATTATAGGATGACATGATGTCTCTATATAGATGTATGTTTTTACACATTGACATTCAAACATGCAAGATTGTTTGGAACCAAAGGATGAAAATGAATTTCACTATTTCTGAC 3560 0.3767 MVKLFLSVSSWWQHSANLASYEQQDAHEFFISILDAIHEKDGKLWNSCKGNGDCQCIAHRVFYGLLRSDVTCMTCGFTSTTYDPCVDISLNLDTNVSSVEKGKKLSKRNEDGSMSTLSGCLDLFTRPEKLGSDQKLYCQNCQERQDSLKQMSIKKLPLVLSLHVKRFEHSFVKNCSRKIDRYLHFPFSLDMTPYLSSSILRARYGNRIYTFGGDESDMFSEFEIFAVVTHSGTLESGHYVSFMRLRNQWYKCDDAWITEVDDATVRASQCYMIFYVQKTMHNKANEDPSHVPNSPRRELFLPIAGCC 307
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste8g00192 307 Gene3D Cysteine proteinases 3 285 - -
Pste8g00192 307 PANTHER UBIQUITIN CARBOXYL-TERMINAL HYDROLASE 10 277 - -
Pste8g00192 307 Pfam Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13 275 IPR001394 GO:0004843|GO:0016579
Pste8g00192 307 SUPERFAMILY Cysteine proteinases 12 290 IPR038765 -
Pste8g00192 307 ProSiteProfiles Ubiquitin specific protease (USP) domain profile. 1 278 IPR028889 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste8g00192 Pste-Chr8 1052259 1056127 Dispersed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pste8g00192 16 275 Miscellaneous Gene Families AT2G24640 25.468 4.01e-23 97.4