Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste7g01980 AATCAGTCCTCATTTGAAAGCTGAATCAAAACCGTAGATGCTTTTGATCTCTATGAAATCATAGAATTCTACGAATTTAGAATCAGAGGGGAAGAAAACTGAGAAGACGGAGTAGAAGAGGAAAGTCCACACTCTCTGCGCTGCACATGCACCTTTCTCACTAGGGTTTATTCATCCATGGCGCTAACCGCTATCTCTATCTTCTTCCTCCTCTTCATCTTCCACCACCCGTCATGCTTATCAGGACAATCGAGCTCCATGGAATCAGTGCCTGATCTTCTGAACATTATGTACGCTTCCATCGATGGTTATCCTTGCGTGCGGCTGATGAATCTTTCGGGAACCATCGGTTGTTCAACCGGCGAGTTTTTCTTTGCTTTTATTGTTTACGAATTCTTAGATCCTGGACGAGATAAGGTTGTGGCTCCAATCGTAAGGTTCGAAAATGTTGACAAAATATCTCAACCATCTGCTATATTGGTGTCACTGGACGAGTTTCCAACTCTCATTACTAGAATATCAGACGACTCTAGCTTTGGAAGTAAAGTTGGCGGAGTACTTGTTGAGCCAAGAACTGATTTGCAGAATAAGTTGGAGGGATTCTCTCCCGATCAAAAGTTTCCACAAGCTCAATTCGTTCCTTACCGTAATACCAGCTATGAATGGAATCCAATTGGTTCTGGTATTATGTGGAAATCTTACAGTTTTCCTGTGTTTTTACTCACTGAAAGTGGCTCAAAGTCTCTTCAAGAGTTTGTAACAAAGAATGAAGACAAAAAGAAAGCTTATACTTCTAATGTGGCTGAGTTTGATCTGGTGATGCAGACAGTAAAATCTGGAACACATGATTCAGAGTCTTGTTTACAAGAAGCAACTTGCCTTCCTTTAGGTGGATACAGTGTCTGGTCGTCTCTTCCTCCGATCAACATTTCATCCTTACAACGGTCTAAACCCATTTTATTGACAGTGGCATCTATGGATTCTGCTTCATTTTTTCGAGACAAAAGCCTTGGTGCAGACTCCCCTATTTCTGGTTTAATTGCATTACTAGCTGCTGTTGATGCGCTGTCTCATTTGGAGGGTCTTGGTGATCTTAGTAAACAGCTTGTTTTTGCAGTTTTCACTGGAGAGGCGTGGGGTTACCTTGGAAGTAGGAGATTTTTGGTAGAACTTGACATGCACTCAGATTCTGTTCGTGGCCTTAATCATACATTAATTGAAATGGTCATTGAAATAGGTGCTGTTGGAAAGGGTTTCAGTCAAGGTGTTAGCAACTTTTTTGCTCATACAGAAGGGGATTCTTCTGCCAGAAATCAGACAGTGGTTGCCTTGAAACGTGCGCAAGAGTCACTGCTTTCTGAAAACATAAAGATAGCATCTGCAAGTGCTTCAAATCCAGGGATTCCTCCATCCTCTCTAATGACATTTTTGGAAAAGAATCCTGCAATCTCTGCTGTTGTCCTAGAAGATTTTGACTCTGTCTTTGTCAACAAGTTCTACCATAGTCATCTTGATGATTTATCAAATATAAATTCCTCAGCTGTAGTTGCTGCTGCTTCTCTCATTGCACGCTCCCTTTACATTCTTGCTAGTGAAAATGAAGATGTACCGGATTCAACTTTGGCCACTATAAATGTTAATGTCTCACTTGTTGAACAACTCATGGGTTGCTTGTTGGACTGTGATCCTGGTCTTTCTTGTGAATTGGTGAAGAAATATATTTTACCCTTGTCAACCTGTCCAAGCCATTATGTTGGTGTTATCTTGGACGAACCTTCATCTACACCATTTACAGGATACATCAATGATGTTCCCAGGTTTGTCTGGAATTTTCTGGCTGACAGAACTTCTATCACAAGGGAGAATAATAGCTCAGGTTGTCAACAAGGTTGTGGTAAAGATGAAGTTTGCATCAAAGCAGAGACTGATGGCAAGGGTGTTTGTGTTCTCTCTACAACGAGGTATGTCCCAGCATATTCAACACGGCTAAAATTTGAATCAGGAGTGTGGAATGTTTTACCCCCTAATTCCTCTGACAAAATGGGGATTGTGGACCCTGTCTGGACGGAGAGCAACTGGAATACAATAGGTATGCGGGTCTACACAATCCAAAGTGCTGCTTATGATCGTCTTGTTCTGTTTGGGGGCATCACTTTGACTGTCTTTTCGTACCTTGCAATAGCAACCGCAAGAGCCTTTTTCTCCAAAGCAATGAAGAGGGATTGACATTTTACTTCCGGAGCCTGCATGACTAGTAAATTTTGTGAATCTAGGGTGAAATTATAGAGGGATTAGGATCCTTTGATAGGCAAATTCTCAGTTTCTGAAGAATTTCCAAGGATGTGCATGTGTAAGGAAATATGATGAAAATAGTTAAAATTAGCATGTGGTGTAAATGCCTAGTCATTGACTACACGATTTTTATTTGGCCAATTGTTTTCACCTCTATTCTTGTTCTTGTTAATTGATGGTTTTAATTTATTCGCTGTCATTAGATTTATCTTATGGGTTTTAACTGTTTAATGGGCGGATGTTGAAACGTTCCTTTCTTATTGACAAACAAGGC 2566 0.4069 MALTAISIFFLLFIFHHPSCLSGQSSSMESVPDLLNIMYASIDGYPCVRLMNLSGTIGCSTGEFFFAFIVYEFLDPGRDKVVAPIVRFENVDKISQPSAILVSLDEFPTLITRISDDSSFGSKVGGVLVEPRTDLQNKLEGFSPDQKFPQAQFVPYRNTSYEWNPIGSGIMWKSYSFPVFLLTESGSKSLQEFVTKNEDKKKAYTSNVAEFDLVMQTVKSGTHDSESCLQEATCLPLGGYSVWSSLPPINISSLQRSKPILLTVASMDSASFFRDKSLGADSPISGLIALLAAVDALSHLEGLGDLSKQLVFAVFTGEAWGYLGSRRFLVELDMHSDSVRGLNHTLIEMVIEIGAVGKGFSQGVSNFFAHTEGDSSARNQTVVALKRAQESLLSENIKIASASASNPGIPPSSLMTFLEKNPAISAVVLEDFDSVFVNKFYHSHLDDLSNINSSAVVAAASLIARSLYILASENEDVPDSTLATINVNVSLVEQLMGCLLDCDPGLSCELVKKYILPLSTCPSHYVGVILDEPSSTPFTGYINDVPRFVWNFLADRTSITRENNSSGCQQGCGKDEVCIKAETDGKGVCVLSTTRYVPAYSTRLKFESGVWNVLPPNSSDKMGIVDPVWTESNWNTIGMRVYTIQSAAYDRLVLFGGITLTVFSYLAIATARAFFSKAMKRD 682
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste7g01980 682 Pfam Nicastrin 259 468 - -
Pste7g01980 682 Gene3D Zn peptidases 188 485 - -
Pste7g01980 682 PANTHER NICASTRIN 9 681 IPR008710 GO:0016020|GO:0016485
Pste7g01980 682 SUPERFAMILY Zn-dependent exopeptidases 233 469 - -
Pste7g01980 682 FunFam Nicastrin 187 483 - -
Pste7g01980 682 Pfam Nicastrin small lobe 46 217 IPR041084 -
Pste7g01980 682 CDD M28_Nicastrin 40 635 - -