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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste6g00192 AATCTCTCTTCCCCTCATCTTTTGTTTCTATACAGAAAAGTGCTTTGTGTACTTTCTGAGTTTCAAAGGTTCCATGGATGTTATTTCTTCTCCTAATGCTTGTTCAGTCACAACTGGTGGAAATCTCTGGCGGAATAAACATTCCACCAAGAATATTTATCATGCAAGTTTTGGTGTATTAAAAGCATCACAACATAAAAGAACAAGCCAAATGAGATATAACCTTTTGAGGTTACAACAGTCAAGCTCAAACGACCATTACAAATATATTGAAGACAAGTCTACATATAAAAAATGCAATAAAAAATATGTTGTAAAAGCAGTTTCTAAACCATCTTTTGATCTTGAACCTCCTGCTTCTAATCCTGCAAACATTCTAGTCTCTGTAAAAAATTTCTTAATCGCTGCCTTTTGGTTTTGCTATCCTTACTCACTGATTGCCCAAGGGTTAAGCGTAATTTCTTCATCTTTCCTTGCAGTGGAGAATCTATCAAATGTATCTCCATTATTTTTTACTGGCATGTTGCAAGCTATCATACCTCAATTATTGATGAGTGTTTATATGAATGGTGTGAATCAATTGTATGACCTGGAAATAGACAAGATGAATAAACCATATCTTCCATTGGCATCTGGAAAACTATCCTATACAGCTGGTGTCTTTATTGTTGCATCATGTTTAACTTTGAGTCTTTGGATTGGTTGGAAGACAGGTTCTTGGCCATTAATTTGGAATCTTGTATTGAATACTTTTGTATGGTCTGCTTATTCGATCGACGTGCCTCTATTGAGATGGAAGAAATACCCCTTACTTGCAGCAATGTGCATTGTTATTACTATGGCATATATATTTCCAATCACATTATTCCTCCATATACAGACCTTTGTGTTCAAGAGACCAGTTATTTTTTCAAGATCGTTGATTGTCACTGTAATATTCATGAGCTTATACTCAATTGGTATATCCTTGTTCAAGGATATACCCGATATTGAAGGAGATAAAGCATTTGGTGTTGATTCTTTGGCAACACGTTTAGGTCAAAAACGGGTATTCTGGATTTGTATTTCTATTTTGGAATCAGCTTTTGGAATTGCCTTCTTAGCAGGAATAACATCTTCTTATCTTTGGATTAAAATTGTTACGGGTTTGGGACATGCTATTCTTGCTTCAATTCTTTGGCATCAAACCAAATTTGTGGATCTGAGAAGTAAATCTTCCATCATATCCTTTTATATGTTAATTTGGAAGTTGATGTATGGAGCATATTTTCTCTTGCCTCTGATTAGATAAGGACGTCATTTAAGGTTAAAGCTAGCAACGCTCGCAACACATACAGAGAAATATAAAATTATATATTGTGAATCTAAATGTATTAAAATAGTAAAAACTATACATGTTCTCC 1403 0.3428 MDVISSPNACSVTTGGNLWRNKHSTKNIYHASFGVLKASQHKRTSQMRYNLLRLQQSSSNDHYKYIEDKSTYKKCNKKYVVKAVSKPSFDLEPPASNPANILVSVKNFLIAAFWFCYPYSLIAQGLSVISSSFLAVENLSNVSPLFFTGMLQAIIPQLLMSVYMNGVNQLYDLEIDKMNKPYLPLASGKLSYTAGVFIVASCLTLSLWIGWKTGSWPLIWNLVLNTFVWSAYSIDVPLLRWKKYPLLAAMCIVITMAYIFPITLFLHIQTFVFKRPVIFSRSLIVTVIFMSLYSIGISLFKDIPDIEGDKAFGVDSLATRLGQKRVFWICISILESAFGIAFLAGITSSYLWIKIVTGLGHAILASILWHQTKFVDLRSKSSIISFYMLIWKLMYGAYFLLPLIR 405
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste6g00192 405 Gene3D UbiA prenyltransferase 102 270 IPR044878 -
Pste6g00192 405 Gene3D UbiA prenyltransferase 283 404 - -
Pste6g00192 405 PANTHER HOMOGENTISATE SOLANESYLTRANSFERASE, CHLOROPLASTIC 42 404 - -
Pste6g00192 405 CDD PT_UbiA_HPT1 113 402 IPR044502 GO:0004659
Pste6g00192 405 Pfam UbiA prenyltransferase family 134 393 IPR000537 GO:0016020|GO:0016765
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste6g00192 Pste-Chr6 622868 630940 Dispersed