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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste5g01864 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGTGTGTAAAAATCAGCTGCCCCAGCTTTCTATAACAAGTTTATTTGATTTATCATGGTTTCTTAAAAGTAACAAATTTTGTTAGGCTTCTCTGCTTTCCATGAGGGAGCTAGGTTTTGATTATTTTGAATTGCTTTGGACAAAATAGCGATTTTTATTTTCAATTGAATATGATATAAATTAATGCTAGAGTTTATACTTCTGCCAATATAATATTCTCTTCTATGATATTTCTTGTTGGTAAAAATGGGTTCTAGTACTAAAAAGTTTTTTTCAGACTGTGTTATATGCTTTCCTCTACCTTTTCTGCTAAGGTATTAATTTTGTTCTTCAAGCCAATTTGTCTCTAAAATTCTTTGTACTTTTTCCCAACAAAAGAAGTTGGGGAGTAAAGTATTATGTTCTTTTTGGGCTCCTAGGATTTACTTAATTTTTTATGTTTCTTTTATCTTGTTTCGATTACTGATTAGAGAGCACATATAGGAGTATTTCCCCCTATGTGCTCACTGCCTGTGCATAGTTGATTATTATTTTCAAGTGCAGGAAAAGATTAGAAAAAGTTAACACCTTCTAACACTTGCTAAACGTCGACCAGGTAATATCTGATACGTTAGTCATCCTGTTTTCCAATCCTTCCTCTTTTTATTAAGTCAATCCTAACTCTTGCTGCCATTCATGAGAAGCTAGAGTGAGGAACCATCATCTAATTTAAATCTCAGTGATGCCGTATTTTTCTTCCTTGTGTTTATTTTTTTCCGTCCTCTTTGTTTTCTTGCCTCAGACTAGAAGGTGCTGTTTCTGTATCAGTGGATAGAGGCATGGGTAAATGGCTTCAAGTGAGTGGACTTATTTGGGGAAGTTGGTAATTTATTACGGTTAAGGAGACCATTAGTGCCTAGTATTCAGTGTTTACAGGCTAGTTTTTTAGATTGATTATGAATTCCTTCCCTCATGAAATAATCACTGATGGTTTTTCTCCTCTCTAGCCAAATTAGCATGGCCATTATTTATGCTTCAATTTTCATGCATGCCTTTTGATGGCATTGTAACTTACCAAGCTTAAAACCTTCATCTTTGTGCGATTTTTTGCAGTGTCAATGGATTGGTATCACGATATTGGTAAATGTCCTCTTAGCTGATTAGACACATCATCTTGAATCTTGATATCAAATAAGCATATATAATAATCCTGGTATTTGTTTACTCAAGAAAATTTAGAAGTCCAGTTGGGGGTTATTTTGTAGGCTTAGAGATTATTGAATGGAAAATGGAGAAACCTGATGAATGATATATAAGAAATAGGCAGATTTTTTTTTATGGTGTGGAAGTGATAATGATGGATGTATTTTTGTGTGTTCTGGAGGTGGAAAAGGAAATTTTGGTTAGATGTAATTCTAGAGTAGTACTCTTTCTGTTACAAGGGTTGAGGAGGGACGTAGTCTAATCACATACATCTTACATCATCTCTAGGTATTGTTCTCCAGCTGTACTTTTCATTAGTTACTCTACCAAGTCATGTTGTCCTTGACATGCTACTTGCAGTTCTAATAATGAAAACTATTAACTTAAAAAGAAAAACAGAAAACCTGTGGTAGTTGTGACATCTGAGTTATGATCCTACTCTATTTCACATATTTGTATGCATATGTATCTTTAATGTCTTTCCCCTTTCCCTGTGAAAATATATCAGAATTTATGAGAATGTTAAGAAAAGATCTTAAACATGGTGCAATCATGTTTGACACAATTTCAGGAAAAAATTTGTTTTTTCTCTCAAACGTAGTTTTGACTCCTTGAATGCAGAAGGAACTATTGTTACTTCTGCATTAGGCAGAAAAAATTTTGATATGTTTTTACAAAAATAGATTTACAATTTAGTATTATAGTATCCCATTATTAATTTATTATAATATTCACATTTTTTTTGTAATTACAAATTCCAAAGTGATTTTGATTTATATCATCCTGAAAACATTCATTTTGTCAAATTCACATGAGATAAAAGTATCTAAAGTCTAAACATAAATCATGTTTTCCAAGCACAATTCTGACCAAATTAAAACTTGCTAACTCTAATCCAAATGTATACTGATAAATTAATTAGGTTCATTTTTCAACTGTGCTTGACTCAACTAATCTTCTTTTTGTTACGGTTCTAGTTCTACATGCAATATATGGGTTGTCACTGGAAATGTCTGCTTTGAATTTAGCATCTAGGCAAGTCTTTAGGTGTTATGCCTTGGAATTTTATGTAATTATTGAGTAGGTTTGCGAGTGATATGTATTGTACTTGTTAAATGAAAATGAGATGCTCTACAAGCTCAATTGAGCATGTTTTAACCAGATGCCACTGAGTATTTAATAGCAAATATATTTTTGTTTTAATGTTATTGCAAATGTTGTTGTGGATTGGAAGCAGCTTTGCTTGATTGTTAATTTTATTTTTAAGTTTGGCAGTGAATTTCTTCAGTTCAAATGCTCTTTTTCCTTGCAGGTTGTGAATTATATTTGCAGATCTGACTCAACTACAGTGTCTATTTTGACACCCAAAGATTGCTAGTGTCAGTTATGGGGCATAGGCACTTATATAACACATCTCCTATATTTGAGGGTGAGCCTGACCAGAACTGGAATCATATGCATCCTGATCAGCACTATGTGCACCTAGGTAGGACTAGCACTTCAGAGAATGGTTCTTTTATTTATCCTGCAGAAAACATGTCTGTAGATAGCATTTCTTTCCCCTCTCATTGGAGCTCTTCCACAAGGTCAAACGGATATGCTTCCTCAAGTCACAACAATGATGTGCCTCCTCATCAGTCAGATCCATCAGGCACTTTGAATGATCATTTGGTGCATTCATCTAGTGCTGGGGCATTCTATACAGTTTCAGAAAATTATGTACACCAGCCTTCTTCCAATTATGACAGGCAAACATTTCATGTTGATGGTGGTTTTATTGATCTTACAATGGGAAGTGGACAAGGGCCTCACAAGCGAAAGAGCCCTGGAAATTCTTCAGTCTATGAGAGAGGCAGTACTAGTAGATACTTTAATGCTGGGAGTTCAACTGATCTTCCTATATGTTCAGAATTATGGCAGGAGAAGCCAAATATTGATTCTCAATATATGCCCTGGGATCATTTTACTATGACACCCACATTCAGAGGTACTGGCCTTTCAATAAAGGGTGAGGGTTCTTTGCGGAATGTGAGGAGCCGTCCTACACTTGATTTGGATTCCAACCTTGCTAGGACCCATTTGTCAAGTAACTATCCGCTCAATTCCTACCCCTCTGTCCCACCAGTTGACCATTCTAGCATGTTGGGTCCTTCTGGTCAGACTTCTGCTACATTGACAAGGGATTGGAGTCATATGAACATTTCTCCAACTAATGGAAGGGTGTTATTATCAGATACAAGTGCTTTTGGTGTTGAGACTAGTCATTTCCTTGTTGGAAGTGGTGCTACTTCTAGCAATGCTTCTATAGATGTTGGAGGCTTCCATCATGAATTTGGTACAAGCAGAAATTCTAACCCTCCTCAAACATTTCACAATAATCAAACTCAGACTGGAAGGGGAATTCGAAGCAACTATTCTCAGAGATCTACTCCAACTTTTAGAGCTTCTTCAAGCTTGCGCTTGGGACATGTGACATCTTTGGATGATGGTATGGCAGCTGGAAGTTACCCTTCTAGACATCCAAGGCCATTGAGCATCATTGGCTGGCGGAATGGTGATAGAAATGGGAGGTCAAGAATTTCTAGTGAAAGATATCGATCATTGACTGAGGAGAGTGGTGTCCATGATCGAATTTCCTCTGAGGGTTTCATGGTTGTTGAGCGTGAAGCAGTGTATGGTTCCAGGAATATGCTTGATCAGCACCGAGAAATGAGGATGGACATAGATAACATGAGTTATGAGGAACTACTTGCACTTGGTGAGCGGATTGGCTATGTGAATACGGGGCTCTCTGAGGATTTGTTTTCCAAATGTTTGACGGAAACAATATATTGTTCATCTGAACAGAGTCAAGACGAAGGAAACTGTGTAATATGTCTGGAAGAGTACAAGAACATGGACGATGTTGGAACACTTAAAACTTGTGGACATGACTACCATGTGAGCTGCGTTAAAAAGTGGTTATCTATGAAGAAATTATGTCCTATTTGCAAAGCATCTGTTTTGCCTGAGGATACGAAGGATAAATAACTTCTGCTGTAGTATAATTAAATCTCATTCTGTGTGTATATTTGGACATCCCTCAAAATGGAGGAAACAAAACTTGCTTTCGAAAATGTTGTAACAGAAATGCTACTTTATGTCAATGTATTTGTTTACGGCTTCGATCTCAATTATGCGAAGCCTTGAAATTATGTGATTTTTCAA 4412 0.3595 MGHRHLYNTSPIFEGEPDQNWNHMHPDQHYVHLGRTSTSENGSFIYPAENMSVDSISFPSHWSSSTRSNGYASSSHNNDVPPHQSDPSGTLNDHLVHSSSAGAFYTVSENYVHQPSSNYDRQTFHVDGGFIDLTMGSGQGPHKRKSPGNSSVYERGSTSRYFNAGSSTDLPICSELWQEKPNIDSQYMPWDHFTMTPTFRGTGLSIKGEGSLRNVRSRPTLDLDSNLARTHLSSNYPLNSYPSVPPVDHSSMLGPSGQTSATLTRDWSHMNISPTNGRVLLSDTSAFGVETSHFLVGSGATSSNASIDVGGFHHEFGTSRNSNPPQTFHNNQTQTGRGIRSNYSQRSTPTFRASSSLRLGHVTSLDDGMAAGSYPSRHPRPLSIIGWRNGDRNGRSRISSERYRSLTEESGVHDRISSEGFMVVEREAVYGSRNMLDQHREMRMDIDNMSYEELLALGERIGYVNTGLSEDLFSKCLTETIYCSSEQSQDEGNCVICLEEYKNMDDVGTLKTCGHDYHVSCVKKWLSMKKLCPICKASVLPEDTKDK 547
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste5g01864 547 SMART ring_2 494 535 IPR001841 -
Pste5g01864 547 Gene3D Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger) 461 541 IPR013083 -
Pste5g01864 547 FunFam E3 ubiquitin-protein ligase MBR2 isoform A 459 540 - -
Pste5g01864 547 PANTHER E3 UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE RNF165 60 540 IPR045191 GO:0061630
Pste5g01864 547 MobiDBLite consensus disorder prediction 316 355 - -
Pste5g01864 547 SUPERFAMILY RING/U-box 484 541 - -
Pste5g01864 547 ProSiteProfiles Zinc finger RING-type profile. 494 536 IPR001841 -
Pste5g01864 547 Pfam Ring finger domain 493 536 IPR001841 -
Pste5g01864 547 MobiDBLite consensus disorder prediction 64 95 - -
Pste5g01864 547 CDD RING-H2_RNF24-like 494 539 - -
Pste5g01864 547 MobiDBLite consensus disorder prediction 370 391 - -
Pste5g01864 547 MobiDBLite consensus disorder prediction 135 156 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste5g01864 Pste-Chr5 11770608 11775651 Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pste5g01864 1 546 C3H Transcription Factor Family AT2G37150 42.986 7.82e-118 357
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pste5g01864 5 11770608 11775651 Pste5g01864 5 11770608 11775651 ECH
Pste5g01864 5 11770608 11775651 Pste4g01945 4 14458015 14460757 PCT