Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste5g01714 ATGGGGTTCAGGTTCAGTCTCAGTTTCACCTTGTTTTCGAACACCTCGTTTCTTATGATTGTGTTTTGTGTTTCTCTTGTTCACTCCCACTCTTCAGATCATGGTGTTCTGAGGAGCAACCGGATTGGTTTTAGGGGTGAACAAGATTGCAAGAGTTTCCACAATTTGAGGGACTCAAAAGCAAAGTGCTTGTACTTGAAATCCAATCATCCATGTGTCTCTCAGGGCTATGTAGACTACCTTTACCTTTTCTATTGCAAATTTGGGGGGTTCCCTTTATTGGGTCAAGGTCTTTTGTTTCTTTGGCTTTTGGTTCTGTTCTACCTATTGGCCAATACTGCCTCTGAGTACTTTTGTCCTTCTCTTGAGAACTTGTCCAAATTTCTGAGGTTATCCCCCACAATTGCTGGGGTGACTCTTCTCTCACTTGGCAATGGTGCTAATGATGTTTTTGCCACCCTTGTCTCTTTCAAGGGTAGTGGGACCCGGGACATTGGCTTTAACACTGTGCTTGGGGGTGCTTCTTTCGTCTCCTGCGTTGTGGTTGGAATAGTGAGCATTTCAATACGGCATAGGGGGGTTCGGGTTAAGAAGTGGGACTTGGTTAGAGATGTTTGTTTTCTCCTCTTGGTTCTTCTGTGCTTGTTAACCATTTTGATCGCTGGTGAGATCAATGTTCCTGGGGCAATTGCGTTTTTCTTGATGTATGTGGTGTATGTGGTGGGTGTATATGTCTCATCTATCCGAGGGAATAAGGGTGTGTGTGGAGATGGTGAAATTGATGACGACTTGAGTCTTGGTGGCGGCAGTGATTTAGGGGCCCCTTTGCTCAGTGGGATGGAGAAAGGGCTTGCAAATGAAGGAAGGGAATGTGACATAAAAATTGAGAGGAAATGTTGCTGTTTGCAATCTTCTGTTTGTAGAATTTTACTTTTTGTCTTGGAGATGCCACTTTACTTACCTAGGAGGCTTACAATTCCGGTTCTTTGTGAAGCTAGATGGTCCAAAGTTTATGCAGTTTGTTCAGCTATGCTAGCACCACTTCTGTTGTCTTCGTTGTGTATGCCAAGCAAAGAAAACAGCTTCAATACAAGCATTATTGTTTATGGAATTGGATTGTTGGTTGGGATTATACTAGGTGTAGTTGCATTTTTCACTACCAATGTGTCAAGCCCTCCAAGGAAATACTTGTTTCCTTGGCTTGCAGGAGGGTTTGTGATGAGTGTGGCTTGGAGTTACATATCAGCTCAGGAATTGGTGGGATTGTTGGTTTCACTTGGTTACATATGTGGAGTTAGTCCTTCAATTCTGGGTCTAACAGTCCTTGCCTGGGGGAATTCACTTGGGGACTTGGTGACAAATTTGACAATGGCTTTGAATGGTGGATCACAGGGTGCTCAAATAGCAATATCAGGTTGTTATGCTGGCCCTATCTTCAATATAGTGGTTGGATTGGGCTTATCGCTTGTGAGCTCTACTTGGTCTGAGTATCCTTTATCTGTTGTGATCCCTAGAGATCCATATCTGTGGGAGACATTGGCACTTTTGGCTGTTGCATTGATTTGGGCACTTGTTGTGTTGATTAGAAGAGACATGAAGCTTGATGCACTATTGGGAGGAGGGCTTTTGGTTATTTACTTCATTTCTCTGTTTCTGAGGCTGATTCAGACATTTGGGACTCTCCAATTTCAGAATTTGTTAGGCCCATTCTTCAAAACATGA 1722 0.4332 MGFRFSLSFTLFSNTSFLMIVFCVSLVHSHSSDHGVLRSNRIGFRGEQDCKSFHNLRDSKAKCLYLKSNHPCVSQGYVDYLYLFYCKFGGFPLLGQGLLFLWLLVLFYLLANTASEYFCPSLENLSKFLRLSPTIAGVTLLSLGNGANDVFATLVSFKGSGTRDIGFNTVLGGASFVSCVVVGIVSISIRHRGVRVKKWDLVRDVCFLLLVLLCLLTILIAGEINVPGAIAFFLMYVVYVVGVYVSSIRGNKGVCGDGEIDDDLSLGGGSDLGAPLLSGMEKGLANEGRECDIKIERKCCCLQSSVCRILLFVLEMPLYLPRRLTIPVLCEARWSKVYAVCSAMLAPLLLSSLCMPSKENSFNTSIIVYGIGLLVGIILGVVAFFTTNVSSPPRKYLFPWLAGGFVMSVAWSYISAQELVGLLVSLGYICGVSPSILGLTVLAWGNSLGDLVTNLTMALNGGSQGAQIAISGCYAGPIFNIVVGLGLSLVSSTWSEYPLSVVIPRDPYLWETLALLAVALIWALVVLIRRDMKLDALLGGGLLVIYFISLFLRLIQTFGTLQFQNLLGPFFKT 573
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste5g01714 573 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 401 553 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Pste5g01714 573 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 100 244 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Pste5g01714 573 Gene3D - 131 256 IPR044880 -
Pste5g01714 573 Gene3D - 335 554 IPR044880 -
Pste5g01714 573 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 305 562 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste5g01714 Pste-Chr5 10860796 10862517 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pste5g01714 1 559 Antiporters AT5G17850 51.494 4.39e-163 474