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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste5g01708 ATGGCCATGTTGAACAACTCTAATACCACAACACAACCACAGATCATCCAAATCCAAGCACAAGCTCCACAGCACATGCTTCCATTCACAGTTCCCATCAAGACACAAGTTTCAAGCTTTCCCAATAGAACAACAGTGGCGGGTCAAACCTCAAGAAGGGTCTTCCAGATTCTCTTCTACTTGCATTTGTTCCTAGTTGCAGTCTTGGTGACTTTCCTTATCATATATGGTCTTGTCTCTGACTCTTACACACACCATTTCCACCCCAAGAAGTGGTACCCCCCACTTCTTTCATCGACAGCATGTGCTGGAATTGTCGGTTTCACATGGCAATGGATCACTGCACACCACTCCACAAGGGTAGTCAGGTTAGCGTTTTGGCTGAGTCCTCTGCTAACATGTGCAATGGGAATTATGTTTGTGTGCATTGGCACTGCAGTGAGTCTGGCCATTGGTGTAATTGCTTTGGTTTGTGCATTAATTCAATCCCTCTATTGTTGTTGGGTCAATCCCAGATTTGGATATGCCACAAGAATCTTGTCAGTTTCGATAGCTTTTCCTCCCAACAAAACACAGGGGCTAACCCTTTATTCAATCCTCATTGGCATCCTTTACTGCTGTTTCCTGGTGGCTGGGATTGGAGGAGCTAGAGCTATTGAAAACAGAACCAAACTAGCAGTCTTTTTCATCTTCTTGATCTTGTTGAGCCTAGGATGGACTATGCAGTTTCTGAAGAATGCAATGTATGTCACTATTTCAAGGGTCAAGTATATGAATTTTGCTGGAGGAGTTGTTGACATGGACACTAGATTGGCATTTTGTGACACAATCAAGCACTTAACTGGAAGTGTTTCCCTAGGCTCCATCCTTGTTCCCATCATTGTTCTTTTCCGGGGTTTTGCACGAACCATGAGTCTGGTTGGAGGAGATACAGATGAGTTCATGTTTTCATGTGTTAGTTGCTATATGGGGATTGCATCTCTTTTTGTGATCCGAGGGAACAGGTGGGGTTTTGTGCACGTTGGAGTTTATAACAAAGGGTTTGTGCAGGCATCTTGTGATACTTGGGAGATGTTCATTAGAGTTGGATTGGAGCAAATTATAGACTTGGATCTCACTGGGGCATTCTGTTTCCTTAGTGGGGTTGGAACCGGTGCTATATGTAGTCTAGTGAGTGGAATTTGGAGTCTTGTAATGCACAAGAGCTATGCCTCAGAAATATCCATTTATGCTTTCCTCATTGGCTATTTCATGTGTCGGGTGGCTATTGCATGGGCACAAGCATGTGTTTCAGCTTACTATGTTGCCTACGCAGAAAATCCACAGAGCACTCAGTTTGACTCCACTATTCCAGTACGCTTGGAGCAGCTTAATAGATCTCAAGTCTTGCAAATATTCAGAGCTAATAATTTCAGCTGAGTCTAAATACTTAAGGGGAACCGAAATGGTAAACCAAACTAGCTACAATATCACCCGAGATTTGGAAGGACATTTTGCATTGTATATAATGATTTAGTTTTGATTTAGTCTTGAATTATGATAAATCTTCACAACGCCAGTTAGCATGAATATAGACAGCTATTTGCAATGAACAACTGCTC 1601 0.4254 MAMLNNSNTTTQPQIIQIQAQAPQHMLPFTVPIKTQVSSFPNRTTVAGQTSRRVFQILFYLHLFLVAVLVTFLIIYGLVSDSYTHHFHPKKWYPPLLSSTACAGIVGFTWQWITAHHSTRVVRLAFWLSPLLTCAMGIMFVCIGTAVSLAIGVIALVCALIQSLYCCWVNPRFGYATRILSVSIAFPPNKTQGLTLYSILIGILYCCFLVAGIGGARAIENRTKLAVFFIFLILLSLGWTMQFLKNAMYVTISRVKYMNFAGGVVDMDTRLAFCDTIKHLTGSVSLGSILVPIIVLFRGFARTMSLVGGDTDEFMFSCVSCYMGIASLFVIRGNRWGFVHVGVYNKGFVQASCDTWEMFIRVGLEQIIDLDLTGAFCFLSGVGTGAICSLVSGIWSLVMHKSYASEISIYAFLIGYFMCRVAIAWAQACVSAYYVAYAENPQSTQFDSTIPVRLEQLNRSQVLQIFRANNFS 472
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste5g01708 472 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 49 460 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Pste5g01708 472 Pfam Plasma-membrane choline transporter 153 441 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste5g01708 Pste-Chr5 10824030 10826036 Dispersed/Wgd