Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste5g01494 ATCCATATATGCTGTGTGGGTAAAATAGATCAATCTCCTTTACACACAGAAAAAAAAAAAAGTATAACAAAAAGCAACCCAATTTCGTATCAAATTTCCAATTTCTTTGAATTTATATTTCAGGAGATTAATCATGCTTGTGCTGGGGGACTATGGGCAGAACTTGTTAGCAATAGAGGGTTTGAAGCTGGAGGCCCTAATAACAAGAAGTTAAATATTTATCCCTGGACAATTTTTGGAAATGAATCATCAATTTCTGTATCAATTCACCATACCTCATGCTTTGAACGAAATAAAGCTGCATTACAAATGGAAGTGCATTGTGGTGGTCATAACCATTGCCCATCTGGTGGCGTTGGTATCTCTAACCCTGGTTATTGGGGCATGAATATTGAGCAAGGGAAGAGGTATAAAGTGGTGTACCATGTTAAAACAGCAGGAAAGTTTGATTTTCAACTTTCATTCATGGGTGTTGATGTTATAAATGTGGCATCAAATATCACGAATATTTCTGGAGATGGAAAATGGAAAAGGGTGGAGACAATAGTGGAAGCAAAAGCTACTAATCACAATTCAAGCCTTCAAATAACCACAATTAGTGAAGGGACTTACTTGTTAGATCAGGTGTCAGCTATGCCATTGGACACTCACAAGGGTCATGGCTTCCGAAAAGACATTTATCAAATGGTGGCAGATTTGAAACCAAAATTTCTCAGATTTCCAGGTGGTACTTATGTTGAAGGAAAGCATCTGACAAATCAATACCATTGGAAAGAAACTACTGGATCATGGGAAGATAGACCTGGGCACTTTAATGATATTTGGAACTATTGGAGTGATGATGGAATTGGTTATTTTGAATATCTCCAACTAGCAGAGGACCTTGGTGCGTTACCAATATGGGTGTTTAATGCAGGCATTAGTGTTCGTAATGAAATTAATACATCAGCAATAGCACCTTATCTGATGGACGCCCTGGATGGCATTGAATTTGCAAGAGGGTCTCATAAATCAAAATGGGGTTCTGTTAGAGCTGCCATGGGACATCCTAAACCATTTGACTTGAGATATGTTGCTGTTGGAAATGAAGATTGTCATCATGCTAATTATCAAGGAAATTACCTTATGTTTCATCAAGCTATAAAATTTGCCTACCCAGATATTAAAATTATCTCAAATTGTGATGCTTCTAAGAAACCATTAAATCACCCTGCTGATTTGTTCGATTTTCATATTTATACAAACTCCATTGGAATGTTTTCTAGCTCTGCTCGGTTCGACCTGACATCACGATCTGGTCCAAAGGTTTTTGTTAGTGAATATGCAGTGTGGAGAACTGATGCTGCAAATGGAAGTCTTTTGGCTGCTATATCTGAAGCTGCATTTCTTATTGGACTAGAAAAGAACAGATTTGATTATGGTAAATTATTTGCCACATATAACATGAGGTTTTGTAAAATGTGTCATTACATATGGATTCCTGATGCAATTGTGTTCGACTCATATCAACTTTATGGAACTCCTAGTTATTGGGCAGTAAACTTTGGAACAACCACTGAGAGCCTTAATATTTCTATAAATGGATTGAACCCTGATGTGTTACAACATGATTCTGTTAACACAGTGCTTACATCAAGTAATGTAATGCATGGGAATTCCTTTTTAGAACCACGAAAGGTGGTGCCACAAACAGGTTCACTAGTGAACATTGACAAGGATATTAATGATATTCTCTCTCCTTATACATTTTCATTAATCATGGCGTTTTGTTCTTCCAAGTTTTCATTGGGTGCTATGTTATATTCTTTAATGATTTATTTTCTTGCTTCTGAATATTGGTTTGTTGATGCAAACTCAACGCTAATTGTAAATTCTACACATACGGATTCTGCAAAGCCAATTTCTAACACTTTTCTTGGAGTATTCCTTGAGGAGATTAATCATGCTTGTGCTGGGGGACTGTGGGCAGAACTTGTTAGCAATAGAGGCTTTGAAGCTGGAGGCCCCAACAATACCTTAAATATTTATCCATGGACAGTTATTGGAAATGGATCATCAATTTCTGTATCAATTCACCATATATCTTGCTTTCACCATAATAAAGCTGCATTAAAAATGAAAGTTCGTTGTGGTGGTAAAAATAGTTGCCCTGGTGGCGTTGGTATCTCCAACCCTGGTTATTGGGGCATGAATATTGAGCAAGGGAAGAAGTATAAAGTGGTGTACCATGTTAAAACAAAAGGAAAGATTGATTTTCAACTTTCATTCGCGGGTGTTCATGTTATAAAGGGTGCATCAAATATCACTCACATCAATACTAAAGAGCCCATAAAATTATTTGTTATGATGGTTCTTGACAGGAAAATTTCTAGAGATGAAAAATGGAAAAGGGTGGAGACAATAGTGGAAGCAAAAGCTACTAATCACAATTCAAGCCTTCAAATAACCACAACTACTAAAGGGACTTACTTGTTAGATCAGGTTTCAGTTATGCCATTGGACACTCACATGGGTCATGGCTTCCGAAAGGACCTTTATCAAATGGTTGCTGACTTGAAACCAAAATTTCTCAGATTTCCGGGTGGTACTTATGTTGAAGGGGATTATCTGAAAAATCAATATCGGTGGAAAGAAACCATTGGATCATGGGAAGAGAGACCTGGTCACTTTAATGATATTTGGAATTATTGGAGTGATGATGCAATTGGTTATTTTGACTATCTCCAACTAGCAGAAGACCTTGGTACATTGCCTATATGGGATGCCCTTGATGGCATTGAGTTTGCAAGAGGCTCTCCCACATCAAAGTGGGGTTCTATTAGAGCTGCAATGGGACATCCTAAACCGTTTGACTTGAGATATGTTGCCGTTGGAAATGAAGATTGTAACTATGCTAATTATCAAGGAAATTACCTTAAGTTCCACGCTGCTATAAGATTTGCCTATCCACATATCAAAATTATCTCGAATTGTGATGCATCTAACAAACCATTAAATCACCCTGCTGATTTGTTCGAATATCATGTAATAATAATGTTCTCATATTACTTCTTGAACTTTCATTTTACATATACAAACTCCAGTGACTTGTTTTCTCAGTCTACTCAGTTCAATCATACGTCCCGATCTGGTCCAAAGGCTTTTGTTAGTGAATATGCTGTGTGGAGAGAGGATGCTGCAAATGGAAGTCTTCTGGCTGCTGTGGCCGAAGCTGCATTTCTTATTGGACTAGAAAAGAATAGTGATATTGTGGAAATGGTTTCTTATGCTCCACTTTTCTCAAATATAAACGACAGGAAATGGGTTCCGGATGCAATTGTGTTTGACTCATATAAAGTGTATGGAACTCCTAGCTACTGGGTGCAGAAACTTTTCATTGAGTCTAGTGGAGCAACATTGCTTGACTCAACACTCAATACAAATTCATCTAATAAACTTATTGCATCTGCAATTATTTGGAAAAATTCTACCGAGAAGAAAAATTACCTAAAAATAAAGGTAGTAAACTTTGGAAACACCATTGAGAACCTTAACATTTCTATAAATGGGTTGAACCCCAATGTTCTACAATTTGATTCTATAAGCACAGTCCTCACATCACCCAACGCAATGGATGAGAATTCCTTCTTAGAACCGAATAAGGTGGTGCCTAAAACAAGTCCACCATTGAAGGTTTACAAGGACATGAATGTGATTCTCTCATCCTATTCGCATCTGTCCCCAAAGTTCAGTTTGTCCCTTAAAGCTGATATTTTGAGACACGAAGAAAATCTCAATCTTATATCTGTACTTTCTCCTTCATTTTCACCTCTGGTGAAAAAATGCAAGAAAAATGGGACCCCTTCCCCTGCCTCTCTTGAACAATTTTGCATATATGCATGGTGGGTTCTTGGTGCAGAAAAAACTAGCAAATGTAGCCCTTCTCTTTCTCATAAATTTTGCTGCCTACAATGGTCAGACCAAATCACATGCATAAAAGAGCTGAACTTACTTGGATGTCTAAGCTTGTTAGCACAAGCATCTATCAAACCTGTGGTACTGTCTATTGCCAGTGACCAGAGCATTTGTCTCTTGTCAGTGTTGGAAAGATTTACAATAGAGATGAGAATGATGCAATTTGGTGAGGAGAGTCCTCAACCCAATACATTTCATCTAATGAAAAAGCTAGTGTTGCTAGGTTATGTGCTGCTGAATTGCAAATTCTGTTTGTACACATTAGTGAGAAAGATGCCATTGTCAGTGACAACTCCTTTTTATCTATTGCCATATCAATTTGAAGTGGTATTTTCCTTGAAAAGTACTATTGTAGTACATCAGATATTGCAGCTGTTTTGTTCACTCAAGGCTTCCATTGGTGTCATACTCTATTCCTTGGTGATTCGTTTTCTTGCGTTTCAATGTTGCTGTGCTGATGCAAACTCAACACTAGTTGTTAGTGCTTCCAATGCCAGGCAAATTTCTAACACTTTTCATGGAGTATTCGTTGAGGAAATTAACCATGCTGGTGCTGGGGGACTGTGGGCAGAACTTGTTAGCAACAGAGGCTTTGAAGCTGGAGGCCAAGACAATACTTCAAATATTTATCCTTGGTCAGTTATAGGAAATGAATCATCAATTTCAGTATCAATAGACCGTACCTCTTGTTTCGAGCGTAACAAAGCTGCATTGCATATGGAGGTGTATTGTGGTGGTCAAAAACCTTGTCCATATGGTGGTGTTGGTATCTCTAACCCTGGTTATTGGGGCATGAATATTGAACAAGGAAAGAGGTATAAGGTGGTCTATCATGTTAGATCAGAAAGAAAGTTTGATTTTCAACTTTCATTCACGGGTATTGACATTATAAAAGTGGCATCATATCGAAGGCATGTTTTTGGAGATAGAAAATGGAAAAGGGTGGAGACAATAGTAGAGGCACAAGCTACTAATCACAAATCAAGCCTTCAGATAACCACAATCAGGGAAGGGAGTTACTTGTTAGACCAGGTCTCAGTTATGCCATTGGACACTTACATGGGTCATGGCTTTCGAAAGGACCTTTTTCAAATGGTGGCAGATTTGAAACCAAAATTTCTCAGATTTCCAGGGGGTTGTTATGTTGAAGGAGATTATCTGAAAAATCAATTTCAATGGAAGGATACCGTTGGATCATGGGAGGATAGACCTGGCCACTATGATATTTGGAACTATTGGAGTGACGATGGATTTGGTTTTTTAGAGTATCTTCAACTGGCAGAGGACCTTGGAGCAATGCCGATATGGGTGTTTAATGCTGGGATCAGCCTTTCTGATGCAGTTAATCTATCAGCCTTATCAACTTATGTTCAAGACGCTCTAGATGGCATTGAATTTGCAAGTGGCTCTCATACATCAGCATGGGGTTCTCTTAGAGCTGCAATGGGACATCCTGAACCATTTGACTTGAGATATGTTGCAGTTGGAAATGAAAATTGTGGTAGTGTTAATTATCAAGAAAATTACCTTAAGTTCTATGAGGCTATAAGATCTGCCTACCCGGATATTCAAATTATATCAAATTGTGATGCTTCTAGCGGACCATTAAATCATCCAGCTGATTTGTTCGATTTTCATACATATACAAGCTCAGATGGTATGTTTTCTCTGTCTACTAAGTTCGACCACACATCACGATCTGGACCAAAGGCTTTTGTTAGTGAATATGCTGTGTGGAGAAAAGATGCTGCAAATGGAAGTCTTTTAGCTGCCGTGGCTGAAGCTGCATTTATTATTGGACTAGAAAAGAACAGATGGATTCCAGATGCAATTGTGTTTGACTCTTATCAGCTTTATGGAACTCCTAGCTATTGGGTGCAGAAATTTTTTATTGAGTCCAGTGGAGCAACATTTCTTGATTCAACACTCACTACAACTTCATCTAATAAACTTATAGCATCGGCAATCATTTGGCAAAATTCAGCAGAGAAGAAAAATTATCTAAGAATAAAGGTAGTAAACTTTGGAACAACCACTGAAAGCCTTAACATCTATATAAACGGGTTGAACTCAGATGTGCACCAATATGGATCTACAAAGACAGTGCTTACATCAACCAATGTAATGGATGAGAATTCCTTCTTAGAACCGAAGAAGGTGGTGCCACAAACAAGTTCACTAGAGAAGGATGACAAGGAGATGAATGTTATACTCTCTCCATATTCAGTGACATCATTGGATTTGTTAATATGATAAAGCCAGTTACAATATAGGAATAATGTAGCTAAAATAAAAATGAAGACAAATATAAAGGAGATGGTGACTTTTTTATATCATCAAGAAAGGTAATATATATCGTGAGTGGATAAAAGACTAGCAAATGTAGCACTTGTTTCTCCCAAATTGTGCAGCTTATAATGACAAGACCAACTCACCTGCATAGAAAAGCTTAACTAGTGAAAGCTATGTGGGGTATTTGACAGAAATTATTGTTATTTTTTCTCATTGTGGTTCATTCTTGGAAGCCAAAAAATTTGTCAGTCTGTAGAAAATACATATAGATAACAAGTGAGAGTAGAGCCTGATAGTGTCAATTTCATTGATGCTTGATTGGAAAGGATGTACCATTAGAAGAATCATGATGTAATGAATGTCATGAGATATATTTCTGCCACAAGGATTTCTGAAGCCTTTGATACTCTATATTGGTTAGAGAACATTTCAGTATATGCAAC 6689 0.376 IHICCVGKIDQSPLHTEKKKSITKSNPISYQISNFFEFIFQEINHACAGGLWAELVSNRGFEAGGPNNKKLNIYPWTIFGNESSISVSIHHTSCFERNKAALQMEVHCGGHNHCPSGGVGISNPGYWGMNIEQGKRYKVVYHVKTAGKFDFQLSFMGVDVINVASNITNISGDGKWKRVETIVEAKATNHNSSLQITTISEGTYLLDQVSAMPLDTHKGHGFRKDIYQMVADLKPKFLRFPGGTYVEGKHLTNQYHWKETTGSWEDRPGHFNDIWNYWSDDGIGYFEYLQLAEDLGALPIWVFNAGISVRNEINTSAIAPYLMDALDGIEFARGSHKSKWGSVRAAMGHPKPFDLRYVAVGNEDCHHANYQGNYLMFHQAIKFAYPDIKIISNCDASKKPLNHPADLFDFHIYTNSIGMFSSSARFDLTSRSGPKVFVSEYAVWRTDAANGSLLAAISEAAFLIGLEKNRFDYGKLFATYNMRFCKMCHYIWIPDAIVFDSYQLYGTPSYWAVNFGTTTESLNISINGLNPDVLQHDSVNTVLTSSNVMHGNSFLEPRKVVPQTGSLVNIDKDINDILSPYTFSLIMAFCSSKFSLGAMLYSLMIYFLASEYWFVDANSTLIVNSTHTDSAKPISNTFLGVFLEEINHACAGGLWAELVSNRGFEAGGPNNTLNIYPWTVIGNGSSISVSIHHISCFHHNKAALKMKVRCGGKNSCPGGVGISNPGYWGMNIEQGKKYKVVYHVKTKGKIDFQLSFAGVHVIKGASNITHINTKEPIKLFVMMVLDRKISRDEKWKRVETIVEAKATNHNSSLQITTTTKGTYLLDQVSVMPLDTHMGHGFRKDLYQMVADLKPKFLRFPGGTYVEGDYLKNQYRWKETIGSWEERPGHFNDIWNYWSDDAIGYFDYLQLAEDLGTLPIWDALDGIEFARGSPTSKWGSIRAAMGHPKPFDLRYVAVGNEDCNYANYQGNYLKFHAAIRFAYPHIKIISNCDASNKPLNHPADLFEYHVIIMFSYYFLNFHFTYTNSSDLFSQSTQFNHTSRSGPKAFVSEYAVWREDAANGSLLAAVAEAAFLIGLEKNSDIVEMVSYAPLFSNINDRKWVPDAIVFDSYKVYGTPSYWVQKLFIESSGATLLDSTLNTNSSNKLIASAIIWKNSTEKKNYLKIKVVNFGNTIENLNISINGLNPNVLQFDSISTVLTSPNAMDENSFLEPNKVVPKTSPPLKVYKDMNVILSSYSHLSPKFSLSLKADILRHEENLNLISVLSPSFSPLVKKCKKNGTPSPASLEQFCIYAWWVLGAEKTSKCSPSLSHKFCCLQWSDQITCIKELNLLGCLSLLAQASIKPVVLSIASDQSICLLSVLERFTIEMRMMQFGEESPQPNTFHLMKKLVLLGYVLLNCKFCLYTLVRKMPLSVTTPFYLLPYQFEVVFSLKSTIVVHQILQLFCSLKASIGVILYSLVIRFLAFQCCCADANSTLVVSASNARQISNTFHGVFVEEINHAGAGGLWAELVSNRGFEAGGQDNTSNIYPWSVIGNESSISVSIDRTSCFERNKAALHMEVYCGGQKPCPYGGVGISNPGYWGMNIEQGKRYKVVYHVRSERKFDFQLSFTGIDIIKVASYRRHVFGDRKWKRVETIVEAQATNHKSSLQITTIREGSYLLDQVSVMPLDTYMGHGFRKDLFQMVADLKPKFLRFPGGCYVEGDYLKNQFQWKDTVGSWEDRPGHYDIWNYWSDDGFGFLEYLQLAEDLGAMPIWVFNAGISLSDAVNLSALSTYVQDALDGIEFASGSHTSAWGSLRAAMGHPEPFDLRYVAVGNENCGSVNYQENYLKFYEAIRSAYPDIQIISNCDASSGPLNHPADLFDFHTYTSSDGMFSLSTKFDHTSRSGPKAFVSEYAVWRKDAANGSLLAAVAEAAFIIGLEKNRWIPDAIVFDSYQLYGTPSYWVQKFFIESSGATFLDSTLTTTSSNKLIASAIIWQNSAEKKNYLRIKVVNFGTTTESLNIYINGLNSDVHQYGSTKTVLTSTNVMDENSFLEPKKVVPQTSSLEKDDKEMNVILSPYSVTSLDLLI 2068
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste5g01494 2068 Gene3D Glycosidases 827 1125 - -
Pste5g01494 2068 PANTHER ALPHA-L-ARABINOFURANOSIDASE 1 1454 2067 - -
Pste5g01494 2068 FunFam Alpha-L-arabinofuranosidase 1 1663 1949 - -
Pste5g01494 2068 Gene3D Glycosidases 1655 1949 - -
Pste5g01494 2068 Gene3D - 1950 2066 IPR013780 -
Pste5g01494 2068 Gene3D - 1126 1240 IPR013780 -
Pste5g01494 2068 Pfam Alpha-L-arabinofuranosidase C-terminal domain 440 513 IPR010720 GO:0046373|GO:0046556
Pste5g01494 2068 Pfam Alpha-L-arabinofuranosidase C-terminal domain 1923 2060 IPR010720 GO:0046373|GO:0046556
Pste5g01494 2068 Gene3D - 661 826 - -
Pste5g01494 2068 Gene3D - 56 207 - -
Pste5g01494 2068 SUPERFAMILY (Trans)glycosidases 811 1133 IPR017853 -
Pste5g01494 2068 SUPERFAMILY (Trans)glycosidases 1653 1956 IPR017853 -
Pste5g01494 2068 Gene3D Glycosidases 208 517 - -
Pste5g01494 2068 FunFam Alpha-L-arabinofuranosidase 1 1949 2067 - -
Pste5g01494 2068 FunFam Alpha-L-arabinofuranosidase 1 209 516 - -
Pste5g01494 2068 SUPERFAMILY (Trans)glycosidases 200 512 IPR017853 -
Pste5g01494 2068 Pfam Alpha-L-arabinofuranosidase C-terminal domain 1051 1236 IPR010720 GO:0046373|GO:0046556
Pste5g01494 2068 SMART alpha_l_af_c 439 582 IPR010720 GO:0046373|GO:0046556
Pste5g01494 2068 SMART alpha_l_af_c 1050 1237 IPR010720 GO:0046373|GO:0046556
Pste5g01494 2068 SMART alpha_l_af_c 1892 2060 IPR010720 GO:0046373|GO:0046556
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste5g01494 Pste-Chr5 9549544 9577550 Proximal
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pste5g01494 35 584 Glycoside Hydrolase AT3G10740 52.764 0.0 641