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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste5g00610 GCAGAGTTTGTTGACTTTTATGAAACGGATCTGGTTTTAGAATGTGTGGATAACAGTTATACTGCCCCTGCCTTTTATTATCTAATGATATGCCTCTACAAAAGTTGCTCTTGACTATCAAGTCAACGCATAATGTGCTTATAGAACAGCTATGCTAAAAAATTTTGAAGCAAGAAAAATGGGCTTTCCTCTGTTAACCGAAGCTACTCCTTGTATTTTGTTCTTGGTTCTGCTGTCTTGTACTTGCTTCACTTCAACAGATGCTTATGATCCGCTTGACCCAAATGGGAATATCACGATCAAATGGGATATTATATCCTGGACCCCTGATGGATATGTAGCTGTTGTTACAATGAACAACTTCGAAACATTTCATCACATCCCTTCACCTGGCTGGTCACTAGGATGGAGATGGGCCAAAAATGAGATAATATGGAGCATGGTGGGAGGGCAGACAACCGAACAAGGGGATTGTTCAAAATTTAAGGGATATATTCCGCATTCTTGTAAGAAAAATCCAACAGTTGTAGATTTGCTTCCTGGAACACCTTACAATCAACAAATTGCAAATTGCTGCAAAGGTGGAGTGCTCAGTACATGGGTGCAGGATCCAACCAAAACAGCTGCATCATTTCAAGTCAGTGTTGGTAATGCTGGAACCACAAACATAACTGTCAAAGTCCCAACAAACTTCACCTTGAAAGCACCAGGACCAGGTTATGCTTGTGGATCAACTAGGATTGTGAGACCCACTATATTCATTACGCCAGACAAAACGAGAGTGACCCAAGCACTGATGACATGGAAGGTGGTATGCACATACTCACAATTTCTCGCTCATGAAGTTCCCACTTGCTGCGTCTCACTTTCAGCTTTCCACAATAATACTAGTGTGCCCTGCCCAACTTGTTCATGTGGCTGCCAAAGTAACTCATCTCAGTCAGGGAGATGTGTAAAGCCAGGCACACCACATTTGGCTTCAGTTGTTTCTGGCTCTAGAAAGAATAAAATTTCACCTGTGGTTCAATGTACTAGTCATATGTGTCCAATTCGAGTGCACTGGCATGTTAAGCTTAACTCTAACAAGTACTGGCGTGTGAAGGTTACTATTATTAATTTAAATCACAGGATGAATTATTCTGACTGGAACTTAGCTGTTCAACACCCAAACTTTGACAATCGGACTCAAGTGTTCGGTTTCAACTACAAATTATTGACCCCTTATGCTTCAATAAGTAAGAGTGATGTGATCCTAACTTGTTTGTTTCAAATTTCTGGAGCTACTAATTTTCTTAAATGCTGTGAAGATGATACGGCAATGATATGGGGAATTAAGTCCCATCATAATGAATTTCTCTACCAAGCTGGTCCTAATGGCAAGGTTCAAGCAGAGCTACTCTTCCGAAAGGATAAAGCAACTTTTACTTCTGATAAGGGTTGGGCTTTTCCTAAGAGGATCCTCTTCAATGGTGACAGCTGTATAATGCCACCACATGCTTATGATCCGCTTGATCCAAATGGGAATATAACAATCAAATGGGATATTATAAGCTGGACCCCTGATGGATATGTAGCTGTTGTTACAATGAACAACTTCCAACAATATCGTCATATCCCTTCACCTGGCTGGACATTAGGATGGACATGGGCAAAAAAGGAGGTAATATGGAGCATGATGGGAGGGCAGACAACTGAACAAGGGGATTGTTCAAAATTTAAGGGAAATGTTCCACATTGCTGTAAGAAAGACCCAACGGTTGTAGATTTGCTTCCTGGAACACCTTACAATCAACAAATTGCTAATTGCTGCAAAGGTGGGGTGCTCAGTTCATGGGTGCAGGATCCAACCAGTGCAGTTGCCTCTTTCCAAGTCAGTGTTGGTAGAGGTGGTACCACCAACAGAACTGTCAAAGTCCCAAAAAACTTCACCTTGAAAGCACCAGGACCAGGTTATACTTGTGGGCCAGCTAAGATTGTGAGACCCACTCAATTCAGTACCCCAGACAAAAGGAGAGTGACCCAAGCGCTGATGACATGGAATGTGACATGCACATACTCACAATTTCTAGCTCAGAAAACTCCCTCTTGCTGTGTCTCACTTTCATCTTTCTATAATGATACTATTGTGCCCTGTCCAACATGTGCATGTGGCTGCCAAAGTAACTCGTCTCGGTCAGGGACCTGTGTAGATCCAGATACGCCACATTTGGCATCAGTTGTTTCTGGCTCTGGGAAGAATAACCTTTCTCCGTTGGTTCAATGTACTAGTCATATGTGCCCAATCCGAATCCACTGGCATGTTAAGCTTAACTACAAGGAATACTGGCGTGTAAAGGTTACTGTTACTAATTTTAATTACAGGATGAATTATTCTGAGTGGAACTTGGTTGTTCAACACCCAAACTTTGACAATCTGACTCAACTGTTCAGTTTCAACTACAAGTCATTGACTCCTTATGGTTCAATAAATGATACAGCAATGCTATGGGGACTTAAGTTTTATAATGATTTTCTTAACCAAGCTGGCGCTAATGGAAATGTTCAATCAGAGCTACTCTTCCGAAAGGATAGGGCAACTTTTACTTTTGAAAAGGGCTGGGCTTTTCCTCGAAGGATCTACTTTAATGGCGACAACTGTGTGATGCCGCCACCTGATGCTTATCCATGGTTACCTAATACTTGTTCTCGGCAAAAGGTTTCCCTGTTTGCTTTGGTGTTAGCGTCTTTCGTATCCTTTGTATTTTATGCGCATGCATAAATTTCCAAGGTTTGATACACTTAGGCTTGTAATAGAAAATTTTCAGCCAGACCAGTTTTGACTCATATGTGTGATGTCAAATTGGCATTCGGAGCAAATGAGAGGAATGAGGATGACATGAGGCTCAGCTCATTGGTGGTAGACTTGTTTTCGTGTTTGTTGTAATTCAATGATGTATGTATCGTTATTATAATTGTAACTGTAATTATAATAAATATACACAGAAACATGTCATAAGAAAATATAGACTTGATGAGTCATATGTGGATTTGAAATGGCAACGGTCTTTAAACTTGTAGTTTCCTACATGGAATAAGATTTTTTTTGTATTATGCTAAATGGTCTAAGGTCATTTTGGTATTTTATTAAGGTTAATTAAAATATCATAAAAAAAAAGGTTTTGATTACGGTGGAGAAGTTAAGTTTTTCTGAAACGAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAAAA 3217 0.4007 MLKNFEARKMGFPLLTEATPCILFLVLLSCTCFTSTDAYDPLDPNGNITIKWDIISWTPDGYVAVVTMNNFETFHHIPSPGWSLGWRWAKNEIIWSMVGGQTTEQGDCSKFKGYIPHSCKKNPTVVDLLPGTPYNQQIANCCKGGVLSTWVQDPTKTAASFQVSVGNAGTTNITVKVPTNFTLKAPGPGYACGSTRIVRPTIFITPDKTRVTQALMTWKVVCTYSQFLAHEVPTCCVSLSAFHNNTSVPCPTCSCGCQSNSSQSGRCVKPGTPHLASVVSGSRKNKISPVVQCTSHMCPIRVHWHVKLNSNKYWRVKVTIINLNHRMNYSDWNLAVQHPNFDNRTQVFGFNYKLLTPYASISKSDVILTCLFQISGATNFLKCCEDDTAMIWGIKSHHNEFLYQAGPNGKVQAELLFRKDKATFTSDKGWAFPKRILFNGDSCIMPPHAYDPLDPNGNITIKWDIISWTPDGYVAVVTMNNFQQYRHIPSPGWTLGWTWAKKEVIWSMMGGQTTEQGDCSKFKGNVPHCCKKDPTVVDLLPGTPYNQQIANCCKGGVLSSWVQDPTSAVASFQVSVGRGGTTNRTVKVPKNFTLKAPGPGYTCGPAKIVRPTQFSTPDKRRVTQALMTWNVTCTYSQFLAQKTPSCCVSLSSFYNDTIVPCPTCACGCQSNSSRSGTCVDPDTPHLASVVSGSGKNNLSPLVQCTSHMCPIRIHWHVKLNYKEYWRVKVTVTNFNYRMNYSEWNLVVQHPNFDNLTQLFSFNYKSLTPYGSINDTAMLWGLKFYNDFLNQAGANGNVQSELLFRKDRATFTFEKGWAFPRRIYFNGDNCVMPPPDAYPWLPNTCSRQKVSLFALVLASFVSFVFYAHA 868
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste5g00610 868 ProSiteProfiles Prokaryotic membrane lipoprotein lipid attachment site profile. 1 30 - -
Pste5g00610 868 PANTHER PROTEIN COBRA 448 857 IPR006918 GO:0010215|GO:0016020
Pste5g00610 868 Pfam COBRA-like protein 62 225 IPR006918 GO:0010215|GO:0016020
Pste5g00610 868 Pfam COBRA-like protein 473 636 IPR006918 GO:0010215|GO:0016020
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste5g00610 Pste-Chr5 3958030 3979459 Dispersed/Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pste5g00610 436 863 COBRA Gene Family AT3G02210 75.349 0.0 692
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pste5g00610 5 3958030 3979459 Pste5g00610 5 3958030 3979459 ECH
Pste9g00185 9 735143 737813 Pste5g00610 5 3958030 3979459 PCT
Pste5g00610 5 3958030 3979459 Pste9g00183 9 729879 734577 PCT