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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste3g03268 CAGACTTTGCAAGGCACAGAATTTTTTCGATTCTAATTGCAGTTGGGGAAAGCAGAGTCTTCTCCAGGGTTCAGATCTAGAGAAGGATCCATTTTCTCGATGGAGAAAATGGAGCAGTTCATTGATAGCTTGCCACCGATGGATCTGATGCGGTCGGAGAAGATGACATTCGTTCAGCTCATCATACCCGTTGAGTCCGCTCACCGCGCCATCTCCTATTTGGGCGAACTCGGTCTTCTCCAATTCCGTGACCACTGCTTAAAGCAGATTTGTAGGAATCCAGTGCTGCTGCGCGGATTTGTTGACGAGTTAGTTGGGTTGATTCGGATTTGGATCCTTCGTGCTGAACAGTTCTTGCTAACTGATCCAGCGTTATTAAATGCTGATAAAAGTCCCTTCCAGAGAACATTTGTTAATCAGGTAAAGCGATGTGCAGAAATGTCAAGAAAGCTACGATTCTTCAAGGATCAGATCAATAAAGCTGGCCTAATGTCTTCTTCTTGTACTGTACTGCAACCAGATATTGACTTGGAGGATTTAGAGACACAACTTGCTGAACATGAACACGAACTTATTGAAATGAACTCTAATGGTGACAAACTTCAGCAATCATATAATGAACTATTGGAATTCAAGATTGTATTACAGAAGGCATGTGGTTTTCTTATTTCCAGTCACAGCCTTGTGGTTTCAGATGAAAGAGAACTTCAAGAAAATGTATATTCAACTGATGCCTATGCTGAGACAACATCTTTGCTTGAACAGGAAATGAGGCCTCAATCATCAAACTCGTCTGGCTTAAGATTTATCAGTGGGATAATTTGTAAATCCAAGGTTCTTAGGTTTGAAAGGATGTTGTTTCGTGCTACGAGAGGCAATATGCTTTTCAATCAGGCACCGGCTGACGAACGAATCATGGATCCTGTTTCAACTGAGATGATTGAGAAAACAGTGTTCGTTGTGTTCTTCTCTGGAGAACAGGCAAGAACAAAGATTCTGAAAATTTGTGAGGCATTTGGTGCAAATTGTTATCCTGTTCCAGAAGATATTAGCAAGCAGAGTCAAATAACTAGAGAGGTTTCATCACGTCTAACGGACTTAGAGGCAACTTTGGAAGCTGGGATTAGGCACCGGAACAAGGCTCTAGCATCTGTTGCTGACCATCTTGGAAAATGGATGAACATGGTAAGAAGAGAGAAGGCTGTGTATGATACATTGAACATGTTAAACTTTGATGTCACAAAAAAATGTCTTGTTGGAGAGGGCTGGTGCCCTATGTTTGCAAAAACACAGATGCAAGAGGCACTGCAACGAGCAACTTTTGATAGCAATTCTCAAGTTGGCATAATTTTCCATCCAATGGATGCAGTGGAATCACCACCTACATATTTTAGGACCAACACTTTCACAAATTCATATCAAGAAATTGTTGATGCATACGGTGTTGCAAGATACCAAGAAGCAAATCCTGCAGTTTACACAACTATTTTATTCCCTTTCCTATTTGCTTTGATGTTTGGGGACTGGGGTCATGGACTTTGCCTGTTGGTAGGAGCATTGACTCTTATAGCACGTGAAAACAAGCTCAACACACAGAAACTTGGCAGCTTTATGGAGATGCTATTTAGTGGGCGCTATGTGCTTCTTCAAATGGCTCTATTTTCAATCTATTGTGGCTTAATCTACAACGAGTTCTTTTCTGTTCCTTTTCACATATTTGGTGCATCCGCTTACAAATGTCGCGATACATCATGCAGGGATGCACATACTATTGGTTTAGTCAAGTACCAAGATCCGTACCCATTTGGTGTGGATCCCAGCTGGCGTGGAAGTCGTTCAGAATTGTCTTTCCTGAACTCTATGAAGATGAAGATGTCCATTCTGTTTGGTGTGACTCATATGAACTTAGGAATTATATTGAGCTATTTTAATGCCCGTTTCTTTGGAAATTCGCTGGATATAAGGTACCAGTTTGTGCCACAGATGATTTTCCTTAACAGTCTATTTGGGTATCTTTCATTTCTCATTGTTATTAAGTGGTGCACTGGCTCTCAAGCAGACCTTTATCATGTAATGATATACATGTTTTTAAGCCCCACGGACAATCTTGGCGAGAATCAGTTGTTCTGGGGGCAAAGACCACTTCAAATTGTGTTATTGCTTTTGGCTGTAATTGCAGTTCCGTGGATGCTCTTTCCCAAACCTTTTATTCTAAAGAAGCTTCATACCGAGAGATTTCATGGTCGTAGTTATGATATACTGAATACCTCTGAGGTGGATCTCGAGGCTGAGCCTGATTCTGCCAGACAACATCACCATGAAGAATTCAATTTCAGTGAGGTCTTTGTTCACCAAATGATCCACTCCATTGAATTTGTTCTAGGTTCAGTTTCTAATACAGCATCATATCTTCGTCTTTGGGCATTAAGTTTGGCTCACTCAGAACTTTCTACTGTTTTCTATGAGAAAGTCCTGCTTCTTGCTTGGGGGTATGACAATCTTGTCATTCGGTTGGTGGGACTAACCGTTTTTGCCTTTGCAACTGCCTTTATACTATTAATGATGGAGAGTCTTAGCGCTTTTCTTCATGCCCTGCGGCTTCACTGGGTAGAATTTCAAAGTAAATTCTATCATGGTGATGGCTACAAGTTCAGGCCTTTTTCATTTGCCTCCTTAACAGAGGATGAGGAGTGATTGATTCATGTATGCGGTTTATATAGAAAGGACATCTACACCAGTCAAGGGAGCACAAAATGAAAATTTGTAGTGACGGAAACAAATTTGGCAGCTATGGTTGTTAGGTATGCTTGATGATATTCTACTTGATATTGAACTAGCAACAAAAAATTCCTGCTCATTTTCCTGTGGCTATGGGGTTGTAACAAGATTGCACTGCCTATGGTCATGGAAGGAATCTCTAACAGAATATATTTGTTTTATAGTTTTTTTATAATTTTCTTTTGCTTAGAATAGGAAACTGAAGAGCTAAAAGGAGGGGACTGTTTAGAGTAACTTTTGTAAAAAGGAGTTGGGATCCATCAGACAGTAGCTATTGGATTTTGGTGTTTTGGGGTTACATACATATATACATGTAGGGCAGGTTTTGCTGGGAAATAACCAATTTTTCTGAAATTTTCTTGTATTGACAGATGACTAGTTATACTGTTATAGAACCCCCTTTTATTTGTAAGGATTGGTCAAAGTAAAATACAGAAATTCAATGTTGAATAATGCCATCTGCACTGAGCTTGTGTAATGCCAAGTGGGCAACTTACAATTTGAAATGTTACTTCCACCATCTGCCAAGTTGAATAAAATGTAGAGGG 3326 0.4011 MEKMEQFIDSLPPMDLMRSEKMTFVQLIIPVESAHRAISYLGELGLLQFRDHCLKQICRNPVLLRGFVDELVGLIRIWILRAEQFLLTDPALLNADKSPFQRTFVNQVKRCAEMSRKLRFFKDQINKAGLMSSSCTVLQPDIDLEDLETQLAEHEHELIEMNSNGDKLQQSYNELLEFKIVLQKACGFLISSHSLVVSDERELQENVYSTDAYAETTSLLEQEMRPQSSNSSGLRFISGIICKSKVLRFERMLFRATRGNMLFNQAPADERIMDPVSTEMIEKTVFVVFFSGEQARTKILKICEAFGANCYPVPEDISKQSQITREVSSRLTDLEATLEAGIRHRNKALASVADHLGKWMNMVRREKAVYDTLNMLNFDVTKKCLVGEGWCPMFAKTQMQEALQRATFDSNSQVGIIFHPMDAVESPPTYFRTNTFTNSYQEIVDAYGVARYQEANPAVYTTILFPFLFALMFGDWGHGLCLLVGALTLIARENKLNTQKLGSFMEMLFSGRYVLLQMALFSIYCGLIYNEFFSVPFHIFGASAYKCRDTSCRDAHTIGLVKYQDPYPFGVDPSWRGSRSELSFLNSMKMKMSILFGVTHMNLGIILSYFNARFFGNSLDIRYQFVPQMIFLNSLFGYLSFLIVIKWCTGSQADLYHVMIYMFLSPTDNLGENQLFWGQRPLQIVLLLLAVIAVPWMLFPKPFILKKLHTERFHGRSYDILNTSEVDLEAEPDSARQHHHEEFNFSEVFVHQMIHSIEFVLGSVSNTASYLRLWALSLAHSELSTVFYEKVLLLAWGYDNLVIRLVGLTVFAFATAFILLMMESLSAFLHALRLHWVEFQSKFYHGDGYKFRPFSFASLTEDEE 864
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste3g03268 864 PIRSF ATP6V0A1 87 864 IPR026028 GO:0000220|GO:0046961
Pste3g03268 864 PIRSF ATP6V0A1 12 71 IPR026028 GO:0000220|GO:0046961
Pste3g03268 864 PANTHER VACUOLAR PROTON ATPASES 16 52 IPR002490 GO:0033179|GO:0046961|GO:1902600
Pste3g03268 864 Pfam V-type ATPase 116kDa subunit family 93 856 IPR002490 GO:0033179|GO:0046961|GO:1902600
Pste3g03268 864 Coils Coil 144 171 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste3g03268 Pste-Chr3 25270006 25284367 Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pste3g03268 4 857 Primary Pumps ATPases(2) AT2G28520 75.935 0.0 1333
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pste3g03268 3 25270006 25284367 Pste3g03268 3 25270006 25284367 ECH
Pste3g03268 3 25270006 25284367 Pste1g02504 1 9296805 9308215 PCT