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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste3g03250 GAAACCCGGTATAAATTGTGGGAAAGAAGAGGAAGGTGCAGCAAGAAAGAAAAGCAGAAAGGGCATTGTGTCGATTGAAAACATATAGACGTGAGAGTGTTGAAACCTAGCTCGGACGTATTCACATTCAGAAAATCAGATTGGATATAGGCGATAGGTCCGAAGTTCGAGGTGTAAATTTGCTTGTGTCTGTGCCTCAAAACGAAACACACTCCAAGGTCCAAGATTGATCACTGCTCGGAGCACCATGCGCTAGCTTCCAGGGCTTTGCTCGTTGATTGCACTGCTGAAGATTCTCCGCGAAATGGATTTGGTAGCCACTTGCAAGGAAAAATTGCAATATTTTCGTATAAAAGAGCTCAAAGATGTGCTCGCACAGTTGGGACTTTCTAAACAGGGAAAGAAGCAGGATCTTGTTGATAGGATATTATCTATTCTCTCAGAGGACCAAGTTTCGAAATTGTGGATCAAGAAGAATGCTGTTGGAAAACAACAGGTGGCCAAATTAGTGGATGACACATATAGAAAATTGCAGGTATCTGGGGCCATTGATCTAGCATCAAAGGGGCAGGGTGCTTCAGATAGCAGTAATGTGAAAATTAAAGGTGAAATTGATGATTCCTTTCAATCAGATACGACGGTTCGCTGTCTCTGTGGAAACATATTGGAGGCAGAGCCATTGGTCAAGTGTGAAGATACAAGATGCCATGTGTCACAGCACATCAATTGTGTTATTATTCAAGAGAAACCTATGGATGGAATCCCACCTGTTCCTGACAAATTCTACTGTGAAATATGTCGACTTGATCGGGCAGACCCGTTTTATGTTTCAGTGACACACCTTTTGTTTCCGGTGAAGTTGACCACAACCAATATTGTCACTGATGGAGCCAACCCAGTTCAGAGTGTGGAAAGTACGTTTCAACTCACAAAAGCAAACAAGGATTTAGTATCAAAATCAGAATATGATGTTCAGGCTTGGTGTATGCTTTTGAATGACAAGGTTTCATTCAGGATGCAATGGCCACAATATACAGATCTGAAGGTCAATGGTCTTCCTGTTCGTACAATTAACAGACCTGGTTCACAGTTGCTTGGAGCTAATGGTCGTGACACTGGTCCAGTTCTCACGCCATACACAAAGGACGGAGTTAATAAGATTTCCTTAACAGGGTGTGATGCTAGGATATTCTGTTTAGGTGTCCGTATTGTCAAAAGGCTCAGTATCCCAGAGGTCCTAAGCATGATTCCAGAGGAGTTTGATGGTGAGCGTTTTGAAGACGCTCTTGCACGTGTCTGTTGTGTTACGGGTGGAAATGCAAATGATAATGCTGATAGTGATAGTGATTTGGAAGTGGTTTCAGATACTTTTAGCATCAATCTCCGTTGCCCAATGAGTGGTTCAAGAATGAAGATTGCAGGAAGATTTAAACCTTGTGTTCACATGGGGTGTTTTGATCTTGAAGTTTTTGTGGAGATGAATGAACGATCAAGGAAGTGGCAATGCCCCATATGCCTAAAAAATTATGCTTTGGAGAATATCATTATTGACCCTTACTTCAATCGTATCACTACTCTGATGAAAAATTGTGGAGAGGAGATTACCGAGGTTGAGGTGAAACCTGATGGTTGTTGGCGTGTTAAGGCTAAGAATGAAAGTGAACGCCGGGAGTTGGGGACTCTTGCTCAATGGCACCATCCTGATGGGTCCTTCTTTGTTTCTACTGATGAAGTCAAGAGAACTGAAAATTTTAAGTTCAAACAGGAAGGTGTTTCAGATGGTCCTATTGGATTAAAACTTGGCATCAGGAAGAACAGTAATGGTGATTGGGAAGTCAGCAAACCTGAGAACACAAAATCCTCTTCTGGTAATAGATTGGATGAGGATTTTGAAAATCACGAACATGTTATTATTCCAATGAGCAGCAGTAACACTGGAAGTGGCCGGGATGAGGATGATCCTAGCGTAAATCAGGGTGGTGGTGGGCATATTGATTATTCTACAACCAATGGGATTGAGATGGATTCTATGTTTAACAATAATATGGATTCAGCTTATGGATATAATGTTAATAATGCTTCTGCTCCAATGGGTGATGCAGAAGTTATTATTCTTAGTGACTCTGAAGAAGACAATGATGTATTGATGTCTCCTATAACTGGATATAAAAATAATCAAACTAGTGCTCCAGTTGATGTTTACTCGGTTCTACAACCTGGAATTATTGAGCCATTTACAGAAGATCACAATCCTGGTGGAAATCCAGGTTTGGGAGTTTTTAGTAATCCCAATGAAGATGATTTTGAGATGCCCTCCCTCTGGCCATTGCAATCTGGAACTCCAGCAGTCTCAGGATTCCAATTATTCAGTTCAGAAGTGGAGGATGTGTCAGATACATTGGTTGGTTTGCAGCATGGAAATATTAATTGCTCCTCATCACTGAATGGTTATACGTTGGCTCCAGATACTGCTTTGGGATCTAGCGCACTTGTACCAGATTCCTCATCAGGTCGACCTGATGATGATTTAAACGGTGGCTTGGTTGATAATCCACTGGCATTTTCCAGAGAAGATCCCTCCCTCCAGATTTTTCTCCCTACAAAACCAGCGGAATCATCTATACAACATGAATTGAGAGATCATGCAGATATATCTAATGGTGTCTTGACTGAGGATTGGATATCTCTTAGTCTTGGAGGTGGTGCTGGTGCCAGTAATGGTGACACTTCCACTGCAAATGTATTGAATTCCAGACTGCAAATTTCATCCAAAGATACCACTGATTCTTTGACAGACGCCGCTCCTTTGCTTCTAGGTATGAATGATGTTATTAGATCTGACAAGGCAAGTAGGCAAAGATCAGATAGCCCTTTCTCATTTCCCCGCCAAAAACGTTCAGTAAGGCCGCGCCCGTGTCTCTCTATTGATTCAGATTCTGAGTAGAGGTATTAGACCTTGTGTCTATTAATTCTAGATGCCCTTCTTAACGCCACATTTTGTATTTAGAAACTGAAGAAAGTTGAGCAGCACTTTTGGTCCTCAGGAAATGGAAGGTGATGTGGTCTGAGGCACCCCTGGTATTATTTCACCATTGGTGGTCAGCGTGTTGGCTGCAAAGAATGCCAATTCTTTATGCTTGATATTCAAGTTGTTCATATGACACTGAAGGTCAGGGGCATGCTTATATTCCCCAGTTTTCAGTGAGGAACTGTTGGCATTGGTATAGTACTGTAAAGAATATTATATCTGCAATTTTGTCTCTGCTGAGAGTAATTAACCTGTAAATGTTAAGCCAGCAGATTTAATAGTAAAATCAAAAATAGTTTAATCTTATTCACATCCAGGTGGAAGCCCAATTTTGTAATATATGGTTTCCAATATTTGTAATATATTTAGGCATTAAAGTTACCACCTGGATTGTATATCCTGGTGAGGATAAACATTTTTCCTGTCTTCCTGTGTATTTTGTCTGGCACAGCTAGAGTAAAATAGTTGAAATATGATCTTTAGATACG 3516 0.4098 MDLVATCKEKLQYFRIKELKDVLAQLGLSKQGKKQDLVDRILSILSEDQVSKLWIKKNAVGKQQVAKLVDDTYRKLQVSGAIDLASKGQGASDSSNVKIKGEIDDSFQSDTTVRCLCGNILEAEPLVKCEDTRCHVSQHINCVIIQEKPMDGIPPVPDKFYCEICRLDRADPFYVSVTHLLFPVKLTTTNIVTDGANPVQSVESTFQLTKANKDLVSKSEYDVQAWCMLLNDKVSFRMQWPQYTDLKVNGLPVRTINRPGSQLLGANGRDTGPVLTPYTKDGVNKISLTGCDARIFCLGVRIVKRLSIPEVLSMIPEEFDGERFEDALARVCCVTGGNANDNADSDSDLEVVSDTFSINLRCPMSGSRMKIAGRFKPCVHMGCFDLEVFVEMNERSRKWQCPICLKNYALENIIIDPYFNRITTLMKNCGEEITEVEVKPDGCWRVKAKNESERRELGTLAQWHHPDGSFFVSTDEVKRTENFKFKQEGVSDGPIGLKLGIRKNSNGDWEVSKPENTKSSSGNRLDEDFENHEHVIIPMSSSNTGSGRDEDDPSVNQGGGGHIDYSTTNGIEMDSMFNNNMDSAYGYNVNNASAPMGDAEVIILSDSEEDNDVLMSPITGYKNNQTSAPVDVYSVLQPGIIEPFTEDHNPGGNPGLGVFSNPNEDDFEMPSLWPLQSGTPAVSGFQLFSSEVEDVSDTLVGLQHGNINCSSSLNGYTLAPDTALGSSALVPDSSSGRPDDDLNGGLVDNPLAFSREDPSLQIFLPTKPAESSIQHELRDHADISNGVLTEDWISLSLGGGAGASNGDTSTANVLNSRLQISSKDTTDSLTDAAPLLLGMNDVIRSDKASRQRSDSPFSFPRQKRSVRPRPCLSIDSDSE 879
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste3g03250 879 SMART sap_9 11 45 IPR003034 -
Pste3g03250 879 Gene3D Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger) 334 446 IPR013083 -
Pste3g03250 879 FunFam E3 SUMO-protein ligase SIZ1 1 66 - -
Pste3g03250 879 CDD PHD_Bye1p_SIZ1_like 114 165 - -
Pste3g03250 879 Pfam MIZ/SP-RING zinc finger 358 406 IPR004181 GO:0008270
Pste3g03250 879 ProSiteProfiles SAP motif profile. 11 45 IPR003034 -
Pste3g03250 879 MobiDBLite consensus disorder prediction 496 525 - -
Pste3g03250 879 MobiDBLite consensus disorder prediction 844 879 - -
Pste3g03250 879 ProSitePatterns Zinc finger PHD-type signature. 115 165 IPR019786 -
Pste3g03250 879 SUPERFAMILY SAP domain 1 64 IPR036361 -
Pste3g03250 879 SMART PHD_3 114 166 IPR001965 -
Pste3g03250 879 PANTHER ZINC FINGER MIZ DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 9 643 - -
Pste3g03250 879 Gene3D SAP domain 1 63 IPR036361 -
Pste3g03250 879 Gene3D Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger) 98 173 IPR013083 -
Pste3g03250 879 MobiDBLite consensus disorder prediction 538 564 - -
Pste3g03250 879 SUPERFAMILY FYVE/PHD zinc finger 107 169 IPR011011 -
Pste3g03250 879 CDD SP-RING_Siz-like 359 408 IPR031141 -
Pste3g03250 879 Pfam SAP domain 13 42 IPR003034 -
Pste3g03250 879 ProSiteProfiles Zinc finger SP-RING-type profile. 345 428 IPR004181 GO:0008270
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste3g03250 Pste-Chr3 25160730 25173256 Wgd
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pste3g03250 3 25160730 25173256 Pste3g03250 3 25160730 25173256 ECH
Pste3g03250 3 25160730 25173256 Pste1g02562 1 9609214 9617731 PCT