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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste3g03229 GAGAGAGAGCTTTTTAAAAAACCCTAATTGAAGAAAGGCATTACACCATACAGTCCGTTCTAGTTCGCTTCTGCTTTCGCCCTTTGATTTGCTCAACAGATCTCCGCAGCAATGGTGAACGTTCCAAAGACAAAGAAGACCTACTGCAAGAGCAAGGAGTGCAAGAAGCACACCCTTCACAAGGTTACCCAATACAAGAAGGGCAAGGACAGTATCGCCGCTCAGGGAAAACGCCGTTATGACCGCAAACAATCCGGTTACGGTGGTCAGACCAAGCCCGTTTTCCACAAAAAGGCCAAAACCACCAAGAAGATTGTGTTGAGGCTCCAGTGCCAGAGTTGCAAACATGTCTCTCAGCACCCAATCAAGAGGTGCAAGCACTTTGAGATCGGTGGCGACAAGAAGGGAAAAGGAACCTCTCTCTTCTAGATGGAGTATTAGGATATTGTGTTTGATAATATTAGAATTTACAATTGTTGGCCCTTTAATTTTGCCCTTTAATTTTGCAGAATATTGTGTTTGATAATATTAGAATTTATAATTTCGTTTTGTTTAAGAATTATTACATTATCAATGAATGACTAGTATCTTTCTTTCCTTGAATTGTTGCCCTTCCGGTGAGCTTATCTTCGTCCATCTATTTAATACTTATATACTAAAGACGGCATTGAATAGTTCCTGACTCTTCTTTGTCCTTTCAATTAAGACAATGTAGCTGTTGGTTATCTAGAAATTAGTTTCGCATAAGTGTTACAGATTTGAGTTCTGGCTTGTTGTTGCCTATAAATCTAGGCTCTCTTGTGACTTGTCTAGTTGCTATTGTTAAAAGTTATGTTTGCTTCCCTATTTTTTTGTGAATTTGGTATTTTCATTGGTTTAACCGTATAATTTTATTTCATTCATTTACTTGATATGAGGGAGGATACATTTGATGCATATCCATGCCATACTCTACTGTATGGTCAATTTGATATTTTTTTTTTATAAATATTAGATGTTAACTAATAGGATAAAATTGCACGAGTACAATAATACTGGAGAGCTAAAATTGTGAGTCAAAAAAGGAGCGGTCAAACATGGATTTTCACTGCGATAACTACCTGAAAGTTCAATGAAGCAAGGAATTGTGAAAAAAAAAAAATAAATACAAGAGTCAATCCCACGAGAACTTAAATCAAACCTCAATAGGGTAGTTTTTTCTTCTTTATGTGGGTTTTTACATTACACTTTTGAGGGTAATCAAACTGCAAGGAGTTTAGAACAAAACGGTCAGTGCAACTGACTAATGGAAAACTTTTCCTAATTAATGATAGTAATTGCCATATTGTTGTGGATACTGTCCCATGTAATAAGTATTGTTAGATTGTTTTGTCAATGCTACATTGCCTTGCATGCCACTCCTTTCATATTGCTGCCACATTACCTGTTCCTCAACTAATAACCTCTGTTTCATCTCTATCTCTGACATTTGAACATAAGATGGAGGTGCCACAGCAAATGAGGCTGCAAAAGGATCTGCACTTGCCCATCTTGAATCATTTCCTGACATAGGTGGTGCTGGTAATGCTAACATTGCAGGCTTACCACCTGATCCTAGTGCCACGCTGCTAGCACTGCCATTCATCCCGTAACTCTGTCCTTGCATACCTGTATATGTTGCTGCTTGCTTATACATACCATCCAATAACAATGTGTCAAAGCCACCACCCAACGATGGCTTCTGGTTGGGCAAGTTGCTAGATGATTGGACTAATGCTGTTTCCCAATCTGCTGCATCATCAAAAGCATGCCATGGAAGAGCTTGTGTGGCACTTGTTCCGGATGCTGCTCCATCGAATAATGCCAATGCTAGTTTATCCTCGTGTTCTTGACTTGTCATCATGTCATCCTCTAAATTCAATAAATTACCCTCAGTTTGCACCAATTTTTCTTTTTTGGGTTCTTCCTTTATCTCTTCCTTCACTTCTGCTGGTTCTTCATAGATATCTTCTGGTGCTGGCAGTGCCTTGATTGCATTCATGTCTTCCTCTAGTTCTGGTTCTGATTCTGATTCTGTTTCTTCTAATTTGTTTTCTTGTTGAATGTTAAGTTTCTTGTTTTGTGCTTTGTCTCTGATGTACTGATCCATAATCTCTAACTTCTTTGTCGTGATCTTCTCAATATTTGGGTACTCAGTTGACCGTGCAATCCCAATACTCTTGGACCAGCTGTAGAACATCTCTAGTTCATCATACAGCTTCCCAACACGGCAGAAAATGTCGTACACCTTAATGCAGTCTGATATCACCATGTCAGTGAAACGATCAATGAAGATGCATAGTATTTCTCTAATGTTGTGATATGTTTGAAAACTCTCCTTAACAATAGGGTAGAGAGCCACTGTAACAATTCGGTGCGTCCTTGCTCTTCCTGTAAAGAAAAAACCGTGAGATGCTTTTTATGCTTTTACGTAGAATGACTATATATGATTCTATGTCTGCTTCAAGAATGCATGATTACACATCTTGATCAATGTAAGTATCTTACAAGAAGATGCTTGTTTGAAATGGCAATTTATACTAGCGTAAAAATGTGAATTGATGATTTGTTGTTGCTTAAAATATCACATCATCGTATTTATCAAAGTATACTGGTTAATTTAATTTTTCACATTTGGATGCACATCCAAAAACTGATAATGTGTATCCAGACATCATATTATATGCACTTGGTGAGCTAGAAAAATGATAAATTGCTAGTGAGACTTGAATTACAAAATGCAAATATTGTTGCCACATTTAAAAGTATTTAGGAAAATAAACGCGTGTTCTAAAAATGCATATAATTTCTTAATTGGTAACAAAATAATGAGACTTCACGAAAGAAACTAGTTGTAATAATAATTACAAACCTGTGGGACGGCAAGCCAGGAAGCGCTCAAGCAGCAATTGTAAGTGCTGCATTTTGGAAAAAAGCTCCTCAGTCTTCATGTCACCGATTGGTGTGGCTCTAACAATTTCTCTATCCTTGTTATCTCTATCTCTAATGTATCTACCTCTTTCTCTTTTGATAGATTCCTCTTCATCCTCATCAAAAGCAAACCTGCTACGCTTTCCACGCCTGTTTTGCATCCTGTACTCAAGTCTTTCATCTAGATACAAGGCATAGGTGCGCACAAATGCAGAGAAGTCCCATGAATTGTGTTTTGCATTGTCCCTGAAATCAGACATGTTGAGGAGGCGAGTGCCCTGGCGAGTTGAGAAGAAAATTTCTTGCTCATATGCAGGATCACCCTCGGACAGCAGTCTTTGAATCAGAATAAGTGTTTTCAGAGCCACTGTCCAACTGCTGGTCTTGCTGAGACGCCTGGAGAGAGTATTTACACATGAACTGATGAATCGTCGAGAGTAACATGTTAAGCTCAGAATCTCCTTTATGTACTTTTCATCAGCAGGGTACTCATCATGCCTTGTTGCCTTCACAATTGCCACATCAAGGTCAGCAAGTGAGTTGCTACTTCCCACCTTCGCTAGCCCTATGCTCGTTTGATCCTTCACTGCCCCAATGGCTCTTCTTAATGTGCTTGAAGACATGGTTTCTTAATGTGCTCCAATTTGCTATGGATCAGGCTTTTAGTTTTGAACCTCTGATTTTATTCAATGCGTCCTGAAATAATGTGCTCCCCCCCCCTCCTGCAAATTTACCAAAATTCAATTTGCTCATACGACATTCCAAATTAGTCAGACTTTAAAACTTCTATATATTACATAAATTTGAAGCATTGGCTTCATGTTATCATGTTATGTCAAAT 3790 0.3839 MVNVPKTKKTYCKSKECKKHTLHKVTQYKKGKDSIAAQGKRRYDRKQSGYGGQTKPVFHKKAKTTKKIVLRLQCQSCKHVSQHPIKRCKHFEIGGDKKGKGTSLF 105
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste3g03229 105 Gene3D - 1 105 - -
Pste3g03229 105 ProSitePatterns Ribosomal protein L44e signature. 63 74 IPR000552 GO:0003735|GO:0005840|GO:0006412
Pste3g03229 105 MobiDBLite consensus disorder prediction 28 56 - -
Pste3g03229 105 PANTHER 60S RIBOSOMAL PROTEIN L36A/L44 1 105 IPR000552 GO:0003735|GO:0005840|GO:0006412
Pste3g03229 105 FunFam 60S ribosomal protein L44 1 105 - -
Pste3g03229 105 SUPERFAMILY Zn-binding ribosomal proteins 2 94 IPR011332 GO:0006412
Pste3g03229 105 MobiDBLite consensus disorder prediction 28 48 - -
Pste3g03229 105 Pfam Ribosomal protein L44 19 94 IPR000552 GO:0003735|GO:0005840|GO:0006412
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste3g03229 Pste-Chr3 24982138 24986187 Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pste3g03229 1 105 Cytoplasmic Ribosomal Protein Gene Family AT3G23390 94.286 3.21e-69 200
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pste3g03229 3 24982138 24986187 Pste2g01655 2 17290351 17290958 PCT