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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste3g01126 CATGTCCTTGTCTTTGTCTTTGTCTTGATTCCGATGCGAATGGTAATTGCAGAAACCCCAACCCTCCTTTCCTCACCCTCCTCCTAGATCGAGTCAGGTTATCCTATTTTATCTGGAGACCTGACATGGGAAAACGGTGACCGAATGATGGTGGTGTTTTAATCTGATTTATACACTTTGCCCTCTGGTTCCATTGGATTTTGAACCATATTTATGATGGGCAAAGGACGGAGATAATTAAAGTCAGATGAAAATTCAGCACATTTTTGTTGGCAAAGAGAGTGAAGTTATTACTAATGGCTTTGAGGGTTATAGCAATTTCAGCTGTTTCTACGGTATTAAGCTTTGTGGGTCTGCAGTTTTGCTCCGACTTGTCTTTGGATAAACTTAGATCAGATGGACTACTTGGCTGGAATTTAATTCACTTGGACAATGCCAGCCAAGACATTGAGTTGCCTTTGGGTTTATACACCACCATAGGGCTACTGGTGAATTGCATGATCAATGTATTTATCCTTCTCAATCTTTGTCTCAAGTGTCCTACTGTGTTTTTCTCGGAGTTATATGCTTCTGAAACCCGTAAATTGATTGAACGCCTAATTAATTATGTCATTTACAAGGGGACATTTCTACCATTGATTGTGCCGCCAACAATTTATCAAGCAGGTCTTTGGTCAACTTGGTTGACTGTACTTTGTTCTTTGAAGATGTTTCAAGCTTTGGCTAGAGATCGTTTGGAACGGCTGAATGCATCTCCATCTGCTACACCCTGGACATATCTTCGTGTATATTCAGCATTGCTATTTGTTTTCATGGTTGATGTTCTCTGGATAAGGTTTTGTCTGACAATATATAGAGCAGATGGGTCCTCTATGTATCTGTTGTTATTCTTTGAGCCTTTCAGTATTGCTTTTGAGACCCTACAGGCCATTTTGGTGCATGGATTTCAGTTGCTTGACATATGGCTGCATCATTCAGCTTGCAATAGCAGTGATTTCCGAACACCTAAACTGCTTGACACATTAACTGCAGGTTCATTGTTGGAATTGAAGGGAATTCTTATTCGGAACTTGGGGTTTTTCCTAGACATGGCAACATTTTTTATGGCACTTGGCCATTACTTGTATATATGGCGGCTTCATGGCATGGCTTTCCATCTTGTTGATGCAGTGCTATTTCTAAATATACGAGCATTGCTAAGTGCAATAATAAATCGCATAAAAAGCTTTATTAGGCTAAGGATAGCTCTAGGAACACTTCATGCAGCTCTTCTTGATGCAACAACTGAGGAGCTAAGAGCATATGATGATGAATGTGCTATATGCAGAGAACCTATGGCTAAGGCTAAAAAGCTAAATTGCAATCATCTGTTCCATCTTGCGTGTTTGAGATCTTGGTTGGATCAAGGCCTGACGGAGACATATACTTGCCCAACATGCCGAAAGCCACTTTTTGCCGGTGTGCCTGAAAGTGAAACAAACTCCAATGTAGGGACGATATCTAGTGATGAGCAACTTGCACGCCAAATAAGTGCTGGGTTAGATCGCCCCAACTCTGCTAGACATACCGTGCCTGCAGGATTGTATCCAAATCAGACAATAAACACTCCAGAAGGTGTTGCTTGGAGGGGTGCAGGGCTGGACTCAGGTTGGTTACATTCTTGGCCTAATCAAGGTGTTGATGGGGCTGGTCCATCTACTGCTATCAGAACAGTTGGATTGGGAAGAGTTCAAATGATGATGAGGCATCTTGCATCTGTAGGAGAAACCTATGCTCAGACTGCTTTTGATGATTCTGCTTGGAACCTTTGGCCCATTAATCCCAATCAGGCTTCTGGAAGTGGTTCAACCGTCCCTCCCCCTACTGGAAGATTGCCAGCACGAACTGGTAGTTTACATTTAAGGACTGCTTCACAGTCTTCTAATGATAATGTCGCAAATATACTTGCCATGGCTGAGACTGTTCGGGAGGTTCTACCTCATATTCCAGATGACATTATATTCCAGGTTTGTTTTGGATTACTTGCCTTGTATAACATGCCAGAATTTTCAAAACCATTTCCATTCATTAGAGTAGTTTTGTTTGAGCATTTAATATTGGGCTTGCATGATGGTTGA 2117 0.4171 MALRVIAISAVSTVLSFVGLQFCSDLSLDKLRSDGLLGWNLIHLDNASQDIELPLGLYTTIGLLVNCMINVFILLNLCLKCPTVFFSELYASETRKLIERLINYVIYKGTFLPLIVPPTIYQAGLWSTWLTVLCSLKMFQALARDRLERLNASPSATPWTYLRVYSALLFVFMVDVLWIRFCLTIYRADGSSMYLLLFFEPFSIAFETLQAILVHGFQLLDIWLHHSACNSSDFRTPKLLDTLTAGSLLELKGILIRNLGFFLDMATFFMALGHYLYIWRLHGMAFHLVDAVLFLNIRALLSAIINRIKSFIRLRIALGTLHAALLDATTEELRAYDDECAICREPMAKAKKLNCNHLFHLACLRSWLDQGLTETYTCPTCRKPLFAGVPESETNSNVGTISSDEQLARQISAGLDRPNSARHTVPAGLYPNQTINTPEGVAWRGAGLDSGWLHSWPNQGVDGAGPSTAIRTVGLGRVQMMMRHLASVGETYAQTAFDDSAWNLWPINPNQASGSGSTVPPPTGRLPARTGSLHLRTASQSSNDNVANILAMAETVREVLPHIPDDIIFQVCFGLLALYNMPEFSKPFPFIRVVLFEHLILGLHDG 606
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste3g01126 606 Gene3D Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger) 314 388 IPR013083 -
Pste3g01126 606 ProSiteProfiles Zinc finger RING-type profile. 340 382 IPR001841 -
Pste3g01126 606 SMART ring_2 340 381 IPR001841 -
Pste3g01126 606 Pfam Ring finger domain 338 382 IPR001841 -
Pste3g01126 606 SUPERFAMILY RING/U-box 327 388 - -
Pste3g01126 606 PANTHER E3 UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE RNF8 9 570 - -
Pste3g01126 606 FunFam E3 ubiquitin protein ligase RIN2 313 392 - -
Pste3g01126 606 CDD RING-H2_AMFR 338 385 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste3g01126 Pste-Chr3 7202176 7209934 Dispersed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pste3g01126 57 423 C3H Transcription Factor Family AT3G16090 26.786 1.04e-26 112