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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste3g00712 GAAAAATGGTTGGAAATGAACTGAAAAACATCCAACCACAAAACACTATCCTTAGTATGTGTGCTTCAGGTTTTGACTTTGTCTTCCCTCATTCACTCACAGTTTCACTTGCTTGGAAGAAGCACAACGTGACCATGACGATCAAAGCAAGGAATCCATGTGTCTCCACCTTGTTATATTTAATTGGTCATAGCCGTCTGATAGTGACCCTCAATACACCTTTTCCTTACTATATTCCAAACCAAACATAAGAAAAAAAATAAATAAAAATCAGCACTTTGTTTTACCCTTATGCTCTCAGGGTCAATAGCAAGAAGAAAAAAGAAGTGGCGTGGTGGTGTTAATCTTTGCTAATAAGGTTTGGAATTTGGGTGTCTGAAAAGTTCTCAACTTTGAACATGGGGTTGTGGTTCTAAGGTCAAACAGATCAATTGTCTGTTTGCTTTAGTCATCCTTGCATTTTCTCCGCAGTTTTCATTGACAAGATGGAAATAGTGGAGGAGAGAAAATTTTCTAAGTTGTTGTCAGAGCTGATAGTTTTGGCCGATGAAGTTGCTTCTCTTGCTAAGAACTCTGAAATTGAGGTGGATATTTTTGCTGAGTTTGCCATATTGGTTGAGAAATTACCACCAATCTTCAATGACTTTAGGGACAAAATCACAGTCTTGGACAAGCCACCTATAAGAAAATCCTTGGAATCTCTTGAAAATGAGCTGAGGCGTGCAAAAACTTTGACTAAAAGCTCCAATTTGAGACAGCCAATCAAGCAAATTGAGGACATAACACATGATATTGGTCGGTCCTTGGGCCTTCTGCTTGTAGCCAGCCTCGAAGTGTCCACAGATTTCCGAGAAAAGATTGGTACATTGCAAAGGCAATTGATGAATGTGAGATTTGATGGCAGTTTAAGTATAGCTTCAAGTCCAAAATCAGAGTTTGCTGGCAGTGACATGAAGCTGACTGGAGAAATAGAAGAGGAAATAGTTAATGTTTCCATAGAGGATGTTGTTTTACAACTTAAGAATGGTAATGATGAAGAGTTTGCAGTTTCACTTATGAGACTAAAGGAGTTCATGAGGAGTGAAAGACTGGATGGTGGCTTGATTAATGAGGAAGCAACTCTTGCCATTCTTTTCAATCGACTTGGTTCATGTAAGGCAGACAATAGGTTGGCGATCATTCGATTGCTAAGAAGTATTGCTTTTGGAAATGATGAGAAAAAGGTAAAATCCTTAGTATAAGGTTATGTTTCTGGTAAATATTGGTCTAAAATCATTGCACCCATGGTTGTTTTAGCTTACTTTATAAAGTAGTTCACTGCAGGAGAAGATGGTAGACATTGAGTATTTATCATCAGTGGTTAAGTCACTGACAAGAGATTCAGAAGAGAGGAAGGAAGCAGTGGGGTTATTGCTAGACCTCTCTGACATTCAGGCAGTTCGGCGGCGAATTGGAAGAATTCAAGGGTGCATTGTTATGTTAGTTGCTATACTTAATGGGGATGACCCTGATGCCTCACATGATGCAGCAAAGTTATTGGATATATTGTCTAGTAATTCTCAAAATGCACTTCATATGGCTGAGGCTGGCTACTTTAGGCCTCTGGTGCAGTACTTGAAAGAAGGGTCTGACATGAACAAGATCCTAATGGCGACAGCACTTTCTAGATTGGAGCTCACTGATCACAGCAAACTTTCTCTTGGAGAGGATGGGGCAATTGAGCCCCTTGTCAATATGTTTAGTACTGGGAAACTCGAGTCAAAGTTATCAGCTTTAAATGCACTACAAAATCTGTCTACCTTGACAGATAATGTGCAACGCTTGATCAGATCCGGAATTGCAGGATCTCTGCTGCAACTTCTTTTCTCAGTAACATCCGTGCTCATGACTTTGCGAGAGCCAGCATCAGCTATTCTAGCAAGAATTGCTCAGTCAGAATCTGTCCTTGTTAATGAAGATGTGGCTCAACAAATGCTTTCACTTTTGAATCTTTCCAGCCCTATAATTCAAGGTCATCTATTAGAAGCTCTAAATAACATAGCCTCCCATCCTGGTGCATCCAAAGTGAGAAGGAAAATGAAGGATAAAGGTGCACTTCAGCTGCTCTTACCCTTTCTGAAGGAAAATACCTCTAAAGTCAGGAGTAAGATCTTGCATTTGCTGTATACTCTCTCTAAAGATCTAACAGATGAGTTGACTGAACATCTGGATGAAACTCATCTTCTAAACATTGTTAATATAGTCTCAACACCATCATCAGAGAGTGAACAGGCAGATGCGGTTGGCATACTGAGTAATCTTCCTGCTAGTAATAAAAAAGTGACAGATATACTGAAGAGGGCAAATTTGCTTCCTATTTTGATATCCATTATGGATTCTATCACAGGAAGTAATTCATCTACAACAAATACCTTAGCAGAGAATATTGCAAGTGTAATTATTCGCTTCACGAATCCTTCTGACAAAAAACTACAACTTCTTTCAGCCGAACATGGGGTGATTCCTTTGCTTGTAAAACTACTCTCAAGTGGTTCACCAATCACAAAATCAAGGGCTGCAATCTCTCTGGCTCAACTTTCACAGAATTCTCTGTCTCTTAGGAAATCCAAAAAGTCAAGGTGGTCATGTGTTCCGCCATCGGTGAACGCATATTGTGAAGTTCATGATGGATATTGCTTTGTCAACAGCACATTTTGTTTGGTGAAGGCAGGTGCTGTTTCTCCCCTTATCCAATTATTGGAAGACGCTGAGAAAGAAGTAGTTGAAGCAGCTTTGCAAGCTCTCTCAACTCTTTTGCAAGATGAAATCTGGGAAGGTGGCGTCGATTCCATTGCGAAGTTGTCAGGTGTGCAAGCTATTATAAAATGTCTAGAAGTGGGAGATACAAAGGTTCAAGAAAAAGCAATATTGATATTGGAGAAAATATTTAAAGTTTCTGAACATAGAGTAAAATATGGAGAATCTGCTCAGGTGATTCTTATTGATCTTGCCCAGACAAGTGATTCTAGATTGAAGTCAACAGTTGCAAAAGTTTTAGCTGAGATGGAGCTCTTGCAATCTCAATCAAGTTACTTTTGAAACAAGCCTTTCTACTAATACTGTGGCAGTAATTTTGTTTTGATATCCATTTATTTACATTATTTTGGTGTACATGCTTGTACCATGTTTTGGATGAGTCACATAGTGCCATTCTAGCATTTGTATTTTGTAAGACTAGAAGATAGTCAAAATTATTTGGTAATGTATCAAGGTTGATGATTCAGTTTCTTGAATTACTTTGTCTCAAACTTGTTTATTTATTGATTTATTG 3310 0.3873 MVDIEYLSSVVKSLTRDSEERKEAVGLLLDLSDIQAVRRRIGRIQGCIVMLVAILNGDDPDASHDAAKLLDILSSNSQNALHMAEAGYFRPLVQYLKEGSDMNKILMATALSRLELTDHSKLSLGEDGAIEPLVNMFSTGKLESKLSALNALQNLSTLTDNVQRLIRSGIAGSLLQLLFSVTSVLMTLREPASAILARIAQSESVLVNEDVAQQMLSLLNLSSPIIQGHLLEALNNIASHPGASKVRRKMKDKGALQLLLPFLKENTSKVRSKILHLLYTLSKDLTDELTEHLDETHLLNIVNIVSTPSSESEQADAVGILSNLPASNKKVTDILKRANLLPILISIMDSITGSNSSTTNTLAENIASVIIRFTNPSDKKLQLLSAEHGVIPLLVKLLSSGSPITKSRAAISLAQLSQNSLSLRKSKKSRWSCVPPSVNAYCEVHDGYCFVNSTFCLVKAGAVSPLIQLLEDAEKEVVEAALQALSTLLQDEIWEGGVDSIAKLSGVQAIIKCLEVGDTKVQEKAILILEKIFKVSEHRVKYGESAQVILIDLAQTSDSRLKSTVAKVLAEMELLQSQSSYF 582
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste3g00712 582 PANTHER RING-TYPE E3 UBIQUITIN TRANSFERASE 1 582 - -
Pste3g00712 582 SUPERFAMILY ARM repeat 127 537 IPR016024 -
Pste3g00712 582 ProSiteProfiles Armadillo/plakoglobin ARM repeat profile. 461 488 IPR000225 GO:0005515
Pste3g00712 582 Pfam Armadillo/beta-catenin-like repeat 456 488 IPR000225 GO:0005515
Pste3g00712 582 Gene3D - 447 579 IPR011989 -
Pste3g00712 582 ProSiteProfiles Armadillo/plakoglobin ARM repeat profile. 128 170 IPR000225 GO:0005515
Pste3g00712 582 Gene3D - 4 205 IPR011989 -
Pste3g00712 582 Gene3D - 206 440 IPR011989 -
Pste3g00712 582 SMART arm_5 378 418 IPR000225 GO:0005515
Pste3g00712 582 SMART arm_5 450 490 IPR000225 GO:0005515
Pste3g00712 582 SMART arm_5 117 157 IPR000225 GO:0005515
Pste3g00712 582 SMART arm_5 243 283 IPR000225 GO:0005515
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Pste3g00712 582 SUPERFAMILY ARM repeat 7 179 IPR016024 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste3g00712 Pste-Chr3 4514412 4518770 Dispersed/Transposed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pste3g00712 5 582 U-box Gene Family AT1G76390 29.630 7.91e-47 174