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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste2g03203 ATGTCTCGTTCCCAATGCTTCAAACACTTTCTTCTCTGTACCAAGGGATTCGCAAACACACGGCTTCAAACCCCAGACCTCAATCATCCTTTTCCTTCAATACACTTTCCGAAACACATCTCAGAAACTTCACAGCAGCACTCATTCACGGTTTCCTATCTCATAAATAATTGCGGCTTCTCACCAGAAATCGCTCTCAAGGCTTCAAATGGCGTTCGCTTCAAAACCCCCAGAAAACCCGACTCAGTCATCGATTTCTTAAAAAAAAACGGATTTATGAATTCCCAGATAAACAACATTATCCAAAGGATTCCCAGCGTGCTCACTTGCAACCCCCACAAGACGCTTTCGCCAAAGTTCCAATTTTTATTCTCAAAGGGTGTTTCTGCCTCTGATGTTGTTCAGCTTGTGAATAGGTGCCCCAAGATCCTCCTTGTGAGCGTCGAGAATAGCGTGATTCCCAGCTTTGAATTGGTGAAAAGGTTCCTTCGATCTGATAAGAAAATTATTGATTGTGTTCTCGCTAATAGGCATTTCCTTGATTATAAAATTGCATCACAAAATATTAACATGTTGCTTGATGATTTTGGAGTCAAGCACTCCCACATCACCTATTTGTTCCGTACGAGGCCTTCTATTCTCTTGTCTAATGACTTGAGGAGGACCGTCGAGGAAGTTAAGGAAATGGGGTTTGACCCGTCAAAGATAAGTTTTGTGGTGGCATTGCACGCCAAAAAGGGTGTTTCTAAACTGCGGTGGGATGCAAAAGTTGACGCCTTTAAGAGCTGGGGTTGGTCCGAGGAAGTGGTTCTTGATTCGTTCAGGAAGCACCCCTTCTGTATGTTAGGGTCCAAAGATAAAATTAATGAGGTAATGAGATTTTGGGTTGATCAGTTAGGTTGCGACCCTTTGGCCCTTGCCAAAATGCCCAAGATTTTTGGATATAGTTTGGAGGGTAGGATCATTCCGAGGAGTTTGGTTGTCCAGTATTTGATTGTGAAGGGTTTGAGAAAGAAGAGTTGCAGCTTCTTGACCCCATTTGCTGTTTCTGAAAAGTTGTTTCTCCGTGATTACGTGATGCGTTTTGAGGAGGAAAAATTTCATCTATTAAAGCTATACCAGGGAAAAATCAGTTTCCGAGAAAACAAAGAGGATGATGTAGTATCTGGCAGTTAGCAAATGGAAGAGTAAAATTTTTCTGTGACTTAACCTTGTTATCTTTTTTCTCATCCCATTTAAGTAGTTTTGTTAATTCTATCTAAGTTGAAATTGATTTAACTGAGTTGTTTCATTTTGATGAGTTGAAACTATAGTAGAATATTGCATTCTTTAATTTACATTACAGTTGTAATGTAATCAACTACTATGCTTTATAATGACTTAAGCACAAGTATAAATTCTTTAATATCCAATGCTTAGTTGTAACCTTGCTCACACTTGCATGCTGCTGTTGTTGCCTTGGTAAGAAATATATATTTTGTATTTTGATGGTGAATATATATTTGTTGTTTGTAACCTAACTTACATGGGCATGCTATTATTGTTCTCTTTGCAAGAATATGAATTCACCACCCTTGTGTTCTAAGTTTGCATCATGGAGGATCAATATCATTGTTATTAGTTCTAGTAAATCTCAATTTTTAGGTTTGGCTTGTCACTTGAAGTATTTAAGGATTTTTTTCGTCTTATGGCTTAGACATAAATGAGACAAAGATATAAATACAAACTTCTTAACCATTGTCGAATTTAAAAATGCTCCATATGTCTGTTACTTGTTGCTGATAATGCTACTGAAGACAAAGTTTGAGTGATTGAACAGTTGTTTCTTACATGTTTAGCTGGCAATATATTGTGTGACAGCTGCTGGTTACAGCATCGTAGGTTGGGTAGAATTATTCACTTTTGTAGTTTGATGAGGAATACAAATGAGCATTGAAGTGTTGCATTTTAGATGCAACTAACCATAAGAATCTAATTTTTAACTTTTTATGGTTGAGACGCCGCTTTGAGTTATAATTTAAGCTCTTACATGTAGAAGCTCATAAACTGAGTTATTTCAGTAGAGGTGGCTTTGGGGTGAACCATGGTGTAATGACAAAGTTTTGCCTCGTGACTTGGTGCTGAATGTTTAAGACATAAGACTAACTAACCCCTTTGCTTATGGGATTACAGTTTCATATATTTTACTCCTTCCTTACCATCACAACAGTAGCAGTTTGGTGCAATAGGCCGTCCTTAATGATGAATGTGCAAACATTTGAATAGGAACAAGGGATAAGCTAGTGAAAATTATGCATGACACCTTGTCTTAGAGATTAATACTGGTGTCAGTTGAGCAACGTACTCATTCTCAATTTTACTATCGTATTAGCATAACTAAACTATTAGTTGTACAAGTATTAGACACTAGTTTGTCTTGTAGTTTGTTGCATCATTTTTGGAACTAATTTCACATACCATTTTTGGTAAACCTCTTATATATGTATGGTTTGTAAACATCTTCCAATTATTTGAAAGCTCCTCGCAACATGGATGTTGGTGTGATCCTCGGTGCAATGGGAAGGTTCTGCCTTATGACTTGATGGGGTTTCATACATTTGATTCTCTCCGAGGTGAGCTTAGTGCACTGGCCCATTTTTTACAATAGGGGAGGAAACATGAGTAACAATGATTTCATCGACAATTGATGGTGATTGCTTGTGGAAAATCGAACCCCTTATGCTCACACCTTTGTCTCAAAGATTGAGACCAGTGTCAGTTGAGCTACAAGCTCATTAACAATGTCGTGCAAGTTGCCTTGGCCATGGTTTTTTGTGACAATCAATCTGCCATTTCATATCACATTGACTATCATTTTATCTGGGACCTTTTCAGTCATGCTATAATTGGGCGAGGGAAATGTCAGCATCAAGTGACAGATTTTTTCACCAAGCTCTACCTCTACTTGCCTTTTCTACTTTAACTCGCAAGATTGGAATAATCTGCACATTGAGTAATATAGTTAGTTAAGTTGTTATTTAGCTATATATATGGTGCTGTGCGGAATTGACATGATCCTTTTTAC 3064 0.3776 MSRSQCFKHFLLCTKGFANTRLQTPDLNHPFPSIHFPKHISETSQQHSFTVSYLINNCGFSPEIALKASNGVRFKTPRKPDSVIDFLKKNGFMNSQINNIIQRIPSVLTCNPHKTLSPKFQFLFSKGVSASDVVQLVNRCPKILLVSVENSVIPSFELVKRFLRSDKKIIDCVLANRHFLDYKIASQNINMLLDDFGVKHSHITYLFRTRPSILLSNDLRRTVEEVKEMGFDPSKISFVVALHAKKGVSKLRWDAKVDAFKSWGWSEEVVLDSFRKHPFCMLGSKDKINEVMRFWVDQLGCDPLALAKMPKIFGYSLEGRIIPRSLVVQYLIVKGLRKKSCSFLTPFAVSEKLFLRDYVMRFEEEKFHLLKLYQGKISFRENKEDDVVSGS 391
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste2g03203 391 PANTHER CGI-12 PROTEIN-RELATED 45 361 IPR003690 GO:0003690|GO:0006355
Pste2g03203 391 FunFam Mitochondrial transcription termination factor-like 148 366 - -
Pste2g03203 391 SMART mt_12 204 232 IPR003690 GO:0003690|GO:0006355
Pste2g03203 391 SMART mt_12 303 337 IPR003690 GO:0003690|GO:0006355
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Pste2g03203 391 SMART mt_12 271 302 IPR003690 GO:0003690|GO:0006355
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Pste2g03203 391 Gene3D Transcription termination factor 3, mitochondrial 62 216 IPR038538 -
Pste2g03203 391 Gene3D Transcription termination factor 3, mitochondrial 217 369 IPR038538 -
Pste2g03203 391 Pfam mTERF 254 354 IPR003690 GO:0003690|GO:0006355
Pste2g03203 391 Pfam mTERF 84 292 IPR003690 GO:0003690|GO:0006355
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste2g03203 Pste-Chr2 31879965 31883135 Proximal
       

Transcription factors information


Select Regulatory Factors Family Gene Hmm_acc Hmm_name E_value Clan
TR mTERF Pste2g03203 mTERF 7.3e-15 No_clan