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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste2g01881 GAAGAACATTACATTCTCTCTCACCTCCGACATTGGTACTGAACTCGGAAACGAAATGGGGTTGCTCTGAGAACAAAATGGGTGACGAAAAAGCGTCGAGCAGCGGTCTCCGGCGAGTCACAGCGATAATCTCTTCCTTGATCTCCCTTTCCTTATCGATCAGGGTCTTCGCCGGAAAGTGGCAACTGATTCGGAGCAGGCTGGAGGAGCTCCAATCGGCACTGGTTGCCGGAGATGCGACATCACTATCGGGCGAGATCCCGGCGATAACGATGACGGCGGAGGAGTGCCAGGAGCTGGCGCGGCGGTGCGTGGATCTGTCGTACAGCGGGAAGCTTTTGATGCAGAGCGACTTGGACGTGACTTTGGGGAAGTTGGAAGCGCACGTTAAGAAGCTGTCTCAGATATTCAAGAAGGGTGTGTCAATGCACGGCTATGCCGTCGTCGTTTCAAGGCCTGGTTTTGGAGCTTGCAAAGAGGACATGAGGTTCTACCTAAGAGACTTATTGACTCGAATGAAGGTTGGTGATTTGGGTATGAAGAGACAAGCTTTGGTGAACTTGCATGAGGTTCTTCTGGAGGATGACAAGTATGTGAAGCTGGTTGTTGAGGTTTCTGAGTTTGTTCACCTTTTGGTTGATTTCCTAGGTTCTAATGAGGTTGAGGTTGTCCAAGAGGCTGCCAAGGTTGTTTCTGTGGTTGCGGCCTTTGATTCTTACAAAAGGGTTTTGGTTGGTGCTGGCGTTATTGCCCCTTTGATTCGGGTTTTGGAATGTGGGAGTGAGGTTGGGAAGGTTGGTGCTGCCAGGTGTTTGCAAAGGTTGACTGAGAATTCTGATAATGCGTGGTGTGTTTCGGCTCATGGGGGTGTTACTGCCTTGTTGAGGATATGTGAGAGTGGGGATTGTAAAGGGGAATTGGTTGGTCCTGCTTGTGGGGTGTTGAGGAATCTTTGTGGTGTTGAGGAAATCAAGAGGTTTATGGTTGAGGAGGGTGTGGTTTCAACGTTTGTGAGGCATGTGAGGTCTAGGGATGAAGCAGTTCAGGTGAGTTCTATTGAGTTGATTCAGAACATTGCCTCTGGTGATGAATTGGTTAGGCAGATGGTGGTTAGAGAAGGAGGGGTTCGTCTTCTTTTGCGTGTTTTGGATCCAAAGTGGATTTGTTCGTCTAAAACTAGGGAGGTTGTGATGAGGGCTATTGAGAATTTGTGTTTTTGTTCACCTAGTTGTGTTACTGTTTTGCTGGGTTATGGCTTTGTGAACCAGCTAATGTATTATGTTCGAAATGGGGAGATCTTGATTCAGGAATTGGCGCTGAAGGTGGCTTTTAGATTGTGTGAAACTTCCGAGGAGGCTAAGAAAGCCCTGGGTGATGCCGGCTTCATGGCTGAGCTTGTGAAGTTTCTAAATGCCAAATCATTTGATGTTCGTGAAATGGCAGCTGAGGCACTCTCTGGCATGGTTATGGTGGCAAAAAATAGGAAGAGGTTTGTGCAGGATGACCAAAACATTGCTCTTCTTCTGCAATTGCTGGATCCAGGGGAGGGTAATTCAGGTAATAAAAAGTTGTTGATCTCTATCTTGATGTCACTAACAAGTTGCAACAGTGGGAGGAAAAAAATTGTGAGTTCCGGGTATGCCAAAAACATAGAGAGGCTTGCAGAAGCTGAGGTTTCTTCTGATGCCAAGAGGCTTGTGAGGAAACTATCCACAAACCGGTTCCGCAGTATGTTGAGTGGAATCTGGCACTCTTGATTTTATTTCATTTGCCTTGGCGATGACAAGAGTAGCTCAGCATTTTTATTGAGATTGTAACAAGAAATAGTGATAACATGAAAGATTTGTTGTAGATTTTTCTTGGGGATACCATATCATTGTTTTAGGCTCTTCTTAGCTTTGGCAGTTCTTTACTGAAGAAGAAAAGGATGATATTGCTATATAACATAAAAGAATGTATTTAATTACTGGTGATAGTTATTTCACTAGTTTGTGTTCCAAAAATATTATATTGTGTATAAATACGTGCATGTGTGATCACATGGGGAAGACATCAATCCTTGAGGGGCATGTGAGTAGTGGCTATCTTGCTTCTCTCTATCTAGCACTATGTGGAAAGAGATAGCGATAGATGAAGTTTCCCATCTGTATTGCTTTGTCTCTTAGCTAGTTTGTCTTTTATACTGTAGCAGCTTCCTTATTGTTAATTGAGAAAGCACAACATGCCAATTCTTTGCATGTTTGTTGCCTGGGATACTTCAGATAAGACAACAAAATGAACCTACATTGTTCTCTATCTGTTTATGCTTCTTTTAAATAACCCCTATTAGTTTCTAGAGTTGTAGAAAATAACATTGTGAATGTGTAAGTTTCTAAATCTGGGTGAAGATCGAGGCACTAGGATTCTGTGAAGAAGGAAATCAGAGGTGTTGACGGCATTTATTATACCGCGTATATGCAACCAATGCAAGAGGACTAATGAATGGGAAACATGTGAATCAAGATGGATGATATTGGATTGAGAAAAGCACAGGACACCCATGTTTCTTCCAATTTCCAAGATGTGATCTCATCCCAAACGAATGATTTCATTCATTGTGTTTGTTCAAGGCCTGAAGCATTCTATTGAAAAGAGAGATGTGCAGTAATATATCTTTAAAGAGTTTTAAGGTAAACATAGCAACTAATGGTTGAATAACTGTACATTGTGGTAGTTGTGAACCACTTAATGGCATGTTACTATTACAATTTTGCTATAAGTTCGGTGCCCATGTTCAAGTTATATTTTGTGTTTTATGATTTAGTCTTGGCTTGTTCCAAACGCTACTACATCAACAATTAAC 2842 0.4275 MGDEKASSSGLRRVTAIISSLISLSLSIRVFAGKWQLIRSRLEELQSALVAGDATSLSGEIPAITMTAEECQELARRCVDLSYSGKLLMQSDLDVTLGKLEAHVKKLSQIFKKGVSMHGYAVVVSRPGFGACKEDMRFYLRDLLTRMKVGDLGMKRQALVNLHEVLLEDDKYVKLVVEVSEFVHLLVDFLGSNEVEVVQEAAKVVSVVAAFDSYKRVLVGAGVIAPLIRVLECGSEVGKVGAARCLQRLTENSDNAWCVSAHGGVTALLRICESGDCKGELVGPACGVLRNLCGVEEIKRFMVEEGVVSTFVRHVRSRDEAVQVSSIELIQNIASGDELVRQMVVREGGVRLLLRVLDPKWICSSKTREVVMRAIENLCFCSPSCVTVLLGYGFVNQLMYYVRNGEILIQELALKVAFRLCETSEEAKKALGDAGFMAELVKFLNAKSFDVREMAAEALSGMVMVAKNRKRFVQDDQNIALLLQLLDPGEGNSGNKKLLISILMSLTSCNSGRKKIVSSGYAKNIERLAEAEVSSDAKRLVRKLSTNRFRSMLSGIWHS 559
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste2g01881 559 ProSiteProfiles Armadillo/plakoglobin ARM repeat profile. 263 307 IPR000225 GO:0005515
Pste2g01881 559 SMART arm_5 295 335 IPR000225 GO:0005515
Pste2g01881 559 SMART arm_5 211 251 IPR000225 GO:0005515
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Pste2g01881 559 SMART arm_5 252 294 IPR000225 GO:0005515
Pste2g01881 559 SMART arm_5 337 380 IPR000225 GO:0005515
Pste2g01881 559 SMART arm_5 169 210 IPR000225 GO:0005515
Pste2g01881 559 PANTHER ARM REPEAT SUPERFAMILY PROTEIN 5 558 - -
Pste2g01881 559 Gene3D - 140 548 IPR011989 -
Pste2g01881 559 SUPERFAMILY ARM repeat 141 541 IPR016024 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste2g01881 Pste-Chr2 19198226 19201165 Dispersed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pste2g01881 140 413 U-box Gene Family AT2G23140 25.725 1.66e-11 65.1