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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste2g01109 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1024
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste2g01109 1024 SUPERFAMILY Ankyrin repeat 793 906 IPR036770 -
Pste2g01109 1024 Gene3D - 767 923 IPR036770 -
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Pste2g01109 1024 PANTHER SQUAMOSA PROMOTER-BINDING-LIKE PROTEIN 4 112 910 IPR044817 GO:0003677
Pste2g01109 1024 MobiDBLite consensus disorder prediction 438 467 - -
Pste2g01109 1024 FunFam Squamosa promoter-binding-like protein 14 139 209 - -
Pste2g01109 1024 SUPERFAMILY SBT domain 146 227 IPR036893 GO:0003677|GO:0005634
Pste2g01109 1024 Gene3D - 139 209 IPR036893 GO:0003677|GO:0005634
Pste2g01109 1024 ProSiteProfiles Zinc finger SBP-type profile. 145 222 IPR004333 GO:0003677
Pste2g01109 1024 Pfam SBP domain 148 221 IPR004333 GO:0003677
Pste2g01109 1024 MobiDBLite consensus disorder prediction 213 233 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste2g01109 Pste-Chr2 11999543 12010511 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pste2g01109 1 1023 SBP-box Gene Family AT3G60030 47.697 0.0 811
       

Transcription factors information

Select Regulatory Factors Family Gene Hmm_acc Hmm_name E_value Clan
TF SBP Pste2g01109 SBP 5.3e-29 No_clan
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pste2g01109 2 11999543 12010511 Pste2g01109 2 11999543 12010511 ECH
Pste6g03893 6 28133750 28143626 Pste2g01109 2 11999543 12010511 PCT