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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste2g01032 GTAAGAAAAGTGGACTTCGCTACTTACTTGTTAGAGTCTAATGCTGAACAATGGTGGAACAGAGCTCGAGGTGGTTTGGTAACTCAAGGAGCTTATATCACTTGGGACAAATTTAAGGCGATGACTATAGTAGAGTATGTGGTTAAGTTCGAGAGCTTGGCTAGGTTTTCTTGTTTTTTGAGAGATCATCCTCAAGATGAATGGAAAGATATCAAGTTTGAGCAGGGCCTAAAGCCAGAGTTACGAAGTGCCAAAGGACCAAGCTTTGTGTTCCTGAGGCTCCTTTCTCTCTTTCTCCTTCCTTCAAGCTCTAGGGTTTTCTCACCCCTTTTCAGAGTCTTTTTAACGGTTTTTTCTTCTGGGGTTGATCGAATTGACGACCCGGGTTTTCGAGTAGAATTTGCTTTGAGTGAAGGGATTGAGGGGTTTCGGGTTGGTTGTGGCTGTTGGTCATGGGAAATGGGGTTGATTTCGTATTATGATGGTAACTTGCTTTGGTCAATGAACGGTGATGCAATGAGACAGTCTTTTGATCCTTCATATTTGGGTCCTTCCAAGATTCCATCTATAAAAATACCTGGAAAAACGGGGAATGGTGCATGGGATGCTCTGTCTGAATCTGATTTCTACCATGCTTCATCTGATGCTAGCCTCTTTTCTAGCTCATTACCTGTTCTTCCGCATGAAAAATTGAACTTGAATGAAACCGCTAATGGTTATCAATCAATTGATGACATCTCATCTGGCTTTAATAAGCTTAATCAGGATGTAGAGGGCAATGGTTCACTTGAAGATGGTGATACGCATGCAATTGGACCTGTGCTTCCTGATGATGAGGATGAGCTTTTGGCTGGCATAATGGATGATTTTGACCTAAGTGGTTTGCCTGGTTCCCTTGAGGACTTAGAAGAGTATGATCTTTTTGGTAGTGGTGGAGGTATGGAACTAGAAACTGATCCACAGGAAAGTCTCATTGTGGGTATGTCTAAGTTAAGCTTCGCTGATAGTAATGTTGGCAATGGTTTGCCCCATTATTCTTTTCCCAATGGTGTGGGAACTGTTGCGGGAGAACATCCATATGGAGAGCATCCTTCTCGAACATTATTTGTTCGTAATATTAACAGTAATGTGGAGGATTCTGAGCTGAGGGCCCTTTTTGAGCAATATGGTGATATTAGAACCCTATATACTGCATGCAAACATCGGGGATTTGTAATGATATCCTATTATGATATCCGGGCTGCTCGAACAGCTATGCGTGCATTACAGAACAAACCTCTTCGGCGCAGGAAACTAGACATTCATTTTTCAATACCAAAGGATAATCCATCAGATAAGGATATCAACCAAGGAACATTGGTAGTTTTCAATTTGGATCCCTCTGTTTCAAATGAAGATCTTCGTCAAATATTTGGGGCTTATGGAGAGGTGAAAGAGATAAGGGAAACTCCTCACAAGAGGCATCACAAGTTTATTGAATTTTATGATGTCAGAGCTGCAGAAGCAGCTCTTAAATCATTAAACAGGAGTGATATAGCTGGTAAACGCATAAAGCTTGAACCTAGTCGACCTGGAGGTGCTCGAAGAAATTTGATGCTGCAATTAAATCAAGAGCTTGACCAAGATGAATCTCGGAGTTTCCGATATCAAGTGGGTTCACCTGTAGCTAACTCTCCTCCAGGTAATTGGTTACAGTTCAACAGTCCTGTTGAGCAGAATTCAATGCAAACTATCAATCATTCTCCTGGTTCTAGGATCATGAGCCCAACAACAGGAAGTCATTTACCTGGATTAGCTTCAATTTTGCAACCACAAGTATCTACTAGTGTGAAGGCTGCTGCTATTGGCAATGACCTGGGAAGGAGCAGTCAAGGAGAGCACATATTTACCGGTATGAATTCATCGCATGGAGCTTTTCAGTCGCATTCACTTCCAGAGCCAAAATTCAGCCAATATCGTGGAGCATTGTCCTCAATTGGTCCATCAACGTCAAATGGATCCTCGGTGGAAACTTTGTCTGGGCCACAGTTTCTATGGGGAAGCCCAACTCTCTACTCAGAGCATACCAAACCTTCAGCTTGGCCAAGATCATCTGTAGGACATCCATTTACATCCAATGGAAAGGGCCATGCCTTTCCATACTCAAGTCAGAATAATTCTTTTGTTGGTTCATCTCAGCATCATAACCATCACGTTGGCTCTGCCCCATCAGTTTTGCCTTTTGAGAGGCACTTTGGTTTCCATCCTGAATCATCCGAAACTTCATTCATGAATAATGTTGGTTATGGAGGCATGAGTCTTGGGCAAAATGATGGAAATTACATGGTTAATGTGGGTGGATCTGTTAATGCTAACATTAATATCCCAAGAAATATATCTGATAATGGTTCATCAAACTTTAGAATGAGATCTTCTCCTAGGCTTAGTCCTGTCTTTTTGGGAAATGGTCCTTATCCAGGACTGCCACCTACCACTTTGGATGGTTTGGCTGACCGTGCTAGGAGTAGATGGATTGAGAACAATGGGAGCCAAGTTGATAGCAAGAAGCAATTTCAGCTTGATTTGGATAAGATTAAAAGTGGTGAAGATATAAGGACTACGTTAATGATAAAGAATATCCCAAACAAATACACCTCAAAAATGTTATTAGCTGCCATTGATGAAAATCACAGGGGTACTTATGATTTTCTCTATTTGCCAATTGACTTTAAGAATAAATGCAATGTGGGCTATGCATTTATCAACATGCTGTCACCATCTCTTATTATTCCATTCTACGAGGTTTTAATGGGACATCTTCGGTTCATTTTATTTTTGCATGCTTGCTATTTAGAAAAGCTTAATGATATCTTCCCCTTAATCAAGTGGCATATTTGGTTGTGTCTGTTTTTGCAGACATTCAATGGGAAGAAATGGGAGAAATTTAACAGTGAAAAAGTTGCTTCTTTGGCATATGCTCGAATCCAAGGAAAGTCTGCTCTTGTGAGCCACTTTCAAAATTCTAGTTTGATGAATGAAGACAAGCGATGCCGCCCTATTCTCTTCCACTCAGAGGGTTCTGAAGCTGGTGATCTGATTGTACAAGAGCATCTTCCATCGAACCCCAACATTCTAAACATTCAAGCACTAAGGTCAAGTGAGTTACATTCAAGTGATTCAACTGGGAGTCCTCCAAAGGCAGACCCTTCTGCAAGCTTGGATGCAAATTAATATATTTATATTAGAAGCAGAGCTGCTTAACCTAAATTGGTTGCTGTTAATGTTAACAATTGCAAATATGTCTCTCTGGGGCCTGCATATATTTAGGAAGAAGGATTACAGAAGGATGTAGATTTTGTATCATAACTATTTTCCCAAGTATTTTGCCAGCAAGGCTTGGAGCATGTTGATTGATTTGCTGCACAGGTAGCTGATCTGATTCTGTAAACAAGGTCAAGGTGGTGGGAGCAAAGGCTGAAGAGTTGACCAAAAGTGTTTGTTTGTTTCTTCTCCAGTTTTTTGCTCATTTTTGCATTTTGGTGTTCTGTCATTGAGCAATTTTTTTCCCTTTCTGAAAAATGTTAATATGGGGTAGAGTTCAGTTTGGTTGGAAGTTGGTAAGTTAACATGTGGGTACAAATTGTATAGAGAGAAATAAAAGACTTCTATGTTTCGTCTAATGTATTGGAAGTTGGCACTCTTGAAAACGCAGGTGTAAAACGCTTATTTAATATGATGGTGTTCAAGTTGCTCACTATCTGAATCAAGA 3748 0.4055 VRKVDFATYLLESNAEQWWNRARGGLVTQGAYITWDKFKAMTIVEYVVKFESLARFSCFLRDHPQDEWKDIKFEQGLKPELRSAKGPSFVFLRLLSLFLLPSSSRVFSPLFRVFLTVFSSGVDRIDDPGFRVEFALSEGIEGFRVGCGCWSWEMGLISYYDGNLLWSMNGDAMRQSFDPSYLGPSKIPSIKIPGKTGNGAWDALSESDFYHASSDASLFSSSLPVLPHEKLNLNETANGYQSIDDISSGFNKLNQDVEGNGSLEDGDTHAIGPVLPDDEDELLAGIMDDFDLSGLPGSLEDLEEYDLFGSGGGMELETDPQESLIVGMSKLSFADSNVGNGLPHYSFPNGVGTVAGEHPYGEHPSRTLFVRNINSNVEDSELRALFEQYGDIRTLYTACKHRGFVMISYYDIRAARTAMRALQNKPLRRRKLDIHFSIPKDNPSDKDINQGTLVVFNLDPSVSNEDLRQIFGAYGEVKEIRETPHKRHHKFIEFYDVRAAEAALKSLNRSDIAGKRIKLEPSRPGGARRNLMLQLNQELDQDESRSFRYQVGSPVANSPPGNWLQFNSPVEQNSMQTINHSPGSRIMSPTTGSHLPGLASILQPQVSTSVKAAAIGNDLGRSSQGEHIFTGMNSSHGAFQSHSLPEPKFSQYRGALSSIGPSTSNGSSVETLSGPQFLWGSPTLYSEHTKPSAWPRSSVGHPFTSNGKGHAFPYSSQNNSFVGSSQHHNHHVGSAPSVLPFERHFGFHPESSETSFMNNVGYGGMSLGQNDGNYMVNVGGSVNANINIPRNISDNGSSNFRMRSSPRLSPVFLGNGPYPGLPPTTLDGLADRARSRWIENNGSQVDSKKQFQLDLDKIKSGEDIRTTLMIKNIPNKYTSKMLLAAIDENHRGTYDFLYLPIDFKNKCNVGYAFINMLSPSLIIPFYEVLMGHLRFILFLHACYLEKLNDIFPLIKWHIWLCLFLQTFNGKKWEKFNSEKVASLAYARIQGKSALVSHFQNSSLMNEDKRCRPILFHSEGSEAGDLIVQEHLPSNPNILNIQALRSSELHSSDSTGSPPKADPSASLDAN 1069
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste2g01032 1069 CDD RRM2_MEI2_like 450 520 - -
Pste2g01032 1069 PANTHER RNA RECOGNITION MOTIF-CONTAINING 964 1021 - -
Pste2g01032 1069 Gene3D - 355 449 IPR012677 -
Pste2g01032 1069 Pfam RNA recognition motif 2 961 999 IPR007201 -
Pste2g01032 1069 Pfam RNA recognition motif 2 865 932 IPR007201 -
Pste2g01032 1069 CDD RRM1_MEI2_like 365 441 IPR034453 -
Pste2g01032 1069 Pfam RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) 453 518 IPR000504 GO:0003723
Pste2g01032 1069 Pfam RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) 368 432 IPR000504 GO:0003723
Pste2g01032 1069 ProSiteProfiles Eukaryotic RNA Recognition Motif (RRM) profile. 366 439 IPR000504 GO:0003723
Pste2g01032 1069 SMART rrm1_1 367 435 IPR000504 GO:0003723
Pste2g01032 1069 SMART rrm1_1 452 520 IPR000504 GO:0003723
Pste2g01032 1069 SUPERFAMILY RNA-binding domain, RBD 363 526 IPR035979 GO:0003676
Pste2g01032 1069 FunFam MEI2-like protein 5 isoform 2 355 449 - -
Pste2g01032 1069 MobiDBLite consensus disorder prediction 1047 1069 - -
Pste2g01032 1069 FunFam Protein MEI2-like 1 450 545 - -
Pste2g01032 1069 ProSiteProfiles Eukaryotic RNA Recognition Motif (RRM) profile. 451 524 IPR000504 GO:0003723
Pste2g01032 1069 CDD RRM3_MEI2_like 868 991 IPR034454 -
Pste2g01032 1069 Gene3D - 450 549 IPR012677 -
Pste2g01032 1069 SUPERFAMILY RNA-binding domain, RBD 867 933 IPR035979 GO:0003676
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste2g01032 Pste-Chr2 10904112 10920438 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pste2g01032 361 559 Eukaryotic Initiation Factors Gene Family AT1G71770 25.561 2.23e-06 50.1