Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste2g00452 GAATGGCTTTCTTGGGTATAGTTGGGAATGTACTGAAACAAGCAACGAATAGGAAGATTGGTTCAGAATTATGTTCATTTCCATCTCTTTTCCAGGCTATGCGATGCATGTCAACTGCTCCAAATTCAAGGCTTTTTATTGGAGGTGTTTCAAATTCTATTGATGAGCAAAGTTTGAGGGAAATTTGTTCAAAGTATGGTCAAGTTGTTGATGCAAGGCTAGTTATGGATCGTGAAACTGGTAGGCCCAGAGGATTTGGGTTTATTACTTACAGTACTGTTGAGGAGGCCTCAAGTGCCCTTCAGGCCATGGATGGACAGGATCTGCATGGTCGCCGGGTTAAGGTAAATTTTGCCATCGAAAGACCCCGTGTTGGATTTGGTAGTGGTGGCTTTGATGGATCTTATGGCAATACTCCCTATAGTGCTGGAGCTGGCACCGGATATACAGGCAATTATAGCAACTCTCCATATGGTGCTTCTATAAGTGGTGGTGGGTATGGTAATGCTGGTGGGGACAATGCTGCTGGAGGTTTTGGTAGTGGTGGTGGATACAGTGGAGGTGGCTATGGATCAAGTGACAATTTTGGGAGTGGTGGCTTTGGCAATAACTATGGTGATGCTGGTGCCTATGGTGGAAATGCTGCTGGAGGTTATGGCAGTGGAGGATCAGGTGCTGGTGCCTATGGAAGCAATACTACCGGAGGTTATGGAAGTGGTGGATATGTTGGAGGATCAAGTGGCAGTTTTGGGGACAGCAGCTCTGGCAATAAATATGGTGATGCTAGTGCCTATGGTGACAATGTTACTGCAGGAGGTTTTGACAAAGGTGGATGTACTGGATCAGGTGGTGATGCTGGCGCGTATGGTAGCAATGCCACTGGAACTTATGCGAGTGGTGGATATGATGGAGGATTAGGTGGTGATGCTAGTGTCCATGGTAGTAAAGCTGCTAGAGGTTATGGCAGCAGTGGTGGATCAGGTGGCAGTTTTGGGGACAGCAGCTCTGGCAAGAACTTTGATACTGGTGCCTATGGTGGCAATGCTGTTGGAGGTTATGGTGACAGGGGATATGATGGAGGATCAGGTGGCAGTTTTGGAGACAGAAGCTCTAGCAAGAACCATGGTGATGCTGGTGCATATGGTAATATTACTGCTAGAGGTTATGGCAGCAGTGGTGGAGGACCAGGTGGAAGTTTTGGGGACAGTAACTCTGGCAAGAACTATACTAGTACTGGTGCCTATGGTGGCGATGCTGAGGGAGGTTATGGGAGTGGTAGATATGGTGGAGGATCAGGTGGCAGTTTTGGGGGCAGAAGCTCTGACAAAAACTATGATGATGCCAGTGCCTATGGTGGCAATTCTGCCAGAAGTTATGGCAGCAGTGGATATGGAAGTTATGGGAATGCCGGTAGCTTTCAAAGTGATAAGACTTACAACAATGGAATAGGTGAAGGTTATGGTGTTGGTGTGAGTGGTGGAGGTAAATTAGGTAATACTAGTAATTATGGTGTTCCTGGCAGTGATTATGGTAACTCTGGTGCAGCTGCAGGATTTGGCAAGAATAATAATTATGACAGTTCTGGAGGATTTGGTGGCAGCAGTAGCTATGGTAGTACTGCTGCTGGTGGCAACCATAGTTTTGCCAGTAGTCAGCACCCTACAAGTGCCACAGCATATGGCAATGGTGGCAGCCAGAGTTTTGCCGGTCAACACCCTGGAATTGCCACAGCGGATGAAAGTGGTGGTACAGATACTGGCAATGGCCAATTTGGTAGCAATCAAAGCAGCAATGTGAGTCAACATGGTGGAGATTTTGGAGGTTCATTTCAAGAAAATCTCAGGAATGACGATTATGCAAATGATGCCTTTGCTAGAAGGGCC 1883 0.4695 MAFLGIVGNVLKQATNRKIGSELCSFPSLFQAMRCMSTAPNSRLFIGGVSNSIDEQSLREICSKYGQVVDARLVMDRETGRPRGFGFITYSTVEEASSALQAMDGQDLHGRRVKVNFAIERPRVGFGSGGFDGSYGNTPYSAGAGTGYTGNYSNSPYGASISGGGYGNAGGDNAAGGFGSGGGYSGGGYGSSDNFGSGGFGNNYGDAGAYGGNAAGGYGSGGSGAGAYGSNTTGGYGSGGYVGGSSGSFGDSSSGNKYGDASAYGDNVTAGGFDKGGCTGSGGDAGAYGSNATGTYASGGYDGGLGGDASVHGSKAARGYGSSGGSGGSFGDSSSGKNFDTGAYGGNAVGGYGDRGYDGGSGGSFGDRSSSKNHGDAGAYGNITARGYGSSGGGPGGSFGDSNSGKNYTSTGAYGGDAEGGYGSGRYGGGSGGSFGGRSSDKNYDDASAYGGNSARSYGSSGYGSYGNAGSFQSDKTYNNGIGEGYGVGVSGGGKLGNTSNYGVPGSDYGNSGAAAGFGKNNNYDSSGGFGGSSSYGSTAAGGNHSFASSQHPTSATAYGNGGSQSFAGQHPGIATADESGGTDTGNGQFGSNQSSNVSQHGGDFGGSFQENLRNDDYANDAFARRA 627
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste2g00452 627 ProSiteProfiles Eukaryotic RNA Recognition Motif (RRM) profile. 42 120 IPR000504 GO:0003723
Pste2g00452 627 Pfam RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) 44 114 IPR000504 GO:0003723
Pste2g00452 627 MobiDBLite consensus disorder prediction 580 606 - -
Pste2g00452 627 Gene3D - 27 136 IPR012677 -
Pste2g00452 627 PANTHER HETEROGENEOUS NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN 87F-RELATED 33 198 - -
Pste2g00452 627 MobiDBLite consensus disorder prediction 357 458 - -
Pste2g00452 627 SMART rrm1_1 43 116 IPR000504 GO:0003723
Pste2g00452 627 MobiDBLite consensus disorder prediction 494 627 - -
Pste2g00452 627 MobiDBLite consensus disorder prediction 396 411 - -
Pste2g00452 627 MobiDBLite consensus disorder prediction 516 571 - -
Pste2g00452 627 SUPERFAMILY RNA-binding domain, RBD 39 148 IPR035979 GO:0003676
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste2g00452 Pste-Chr2 4116309 4119579 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pste2g00452 40 159 Eukaryotic Initiation Factors Gene Family AT3G16380 35.156 9.09e-10 59.7