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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste1g03560 GGCTATGCCATTTACAAATTTTACCATTTTATTGATTAAAAAACCGAAAGAATTAAGTAGAAAATTAAGAGATACAGCAGACTTGTCCACCCAAGCGTTGAAGTCAAGTCAACAAATTTTGTGCCTTGAAAATCGAGATTGAAACTGGCTTCTCTGGCGATTCATTCATTTACCAAAACATGGACTCTCATTGCTTCCGACGTCTTCACTTCGCATATTTACTTCTCTTCGTTTCCGCCGCATGTTGTTTTTCACACCCCTCTTTCCTCGGGATACATCCTCTAGTTAGGTTTTGGGTGCAGATGAGAAATATTACAGCTCTGAGGTCATCAAGTGCAAGGATGGATCGAAATCCTTCTCCAGAGACCGTCTCAATGACAATTTCTGTGACTGTCCTGATGGCTCTGATGAGCCTGGATGTTGTGGTTCATTTGACTACAGGGACTTCAGCTTGCCCCAATGGAAAGTTTTATTGCAGAAACCTTGGTAGCAAGCCACTGTTTATAGTTTCTTCTCATGTTAATGATCATTTTTGTGATTGTTGTGATGGGAGTGATGAATATGATGGAAACATTTGTTGCCACAACACTTGTGTCATGGGAGGGAATGCCGAGTCTACATTTAGCAATTGTAAGTCAAAAGCTAGTCAAAATGGAGTGAAGTCAGAGGAATCAGTTCATGGTCTGCAGTGGGTGATTATTCTACAAGTGGTTCTGGTTATTTTTCTGGTATTTCTCTGGAGTTGCCGTTGTCGCACAAGATTTAGAAGGAGATACTATCATTGAATTCAGAGAGACCTTGCTGTTTACCTAACATTAAACTGTGGTAATATTTTAAAATATTTTCGTCATTTTCTTTTCTTGGTTCTTCCTGATTGTGATTTTTTTTATTATGAAATAGTTGATGTTGGGTTGAACTTTCCATAGCATTTGATGAGAAACAGAGTGAGAACAAGAAAGTAGGATGGAATTTATCACCTTTTGAATTTGTACATCCAGGAAAGATATATTAGAAACCACATATTGCATGCTGTAGCTGTACAACTTTAAGATATAAAGACATTTTTCAAATATATTTTTGAATTGATTGGTTGTTGCTGCATTGTATAACAGTATAAAGTTGAAGAATACATAGCTATTTTCTATAATATCATCTTCCCTTTGATCATGGCAACTATTTATGGTTACTTAACACTTTTTTCTTTTTACACATTGATGTCATATTTTCCTAAACTTTCATTGAGAAAATAAATGGTTTGTGGGAACATATAATTAATGGTTCTTTATGTACGTTCTAATTCAAGCCATGAATATTAGGTTATTATTATTATTATTATTTAGGTGGATTTGACAGAAAAGATTGTATTAATTTGTGTGATAAGGCAAGGCATGACAAACATTTTATCTATTACTTGTTAATGTGGGACCCTTTTTACATGTACACGAAATCATTACATGCTTGGTTGCTATTTACTACAAAATATGAATGCTTGGGTACAACATATCGGTTCTATTCATATATTGTTACATATTTTACATTGTAATGTTTAAATGTTGATATATGCTTGTTATTGTGCTGTACATTTGTGTGGAGATATCACTTTTTTATTGAAGTACCAACTGAGTTGTTACATTATTGTGATTTTATAATTATGTGATATTTTTTCACCATTGGTAATGTATAGTTGGTGGTTCCATGTGACATTTGCATTTTCCTCCATGTAATTCTATGTTTTAACACAATGGAGAAAAAAAATTATATTTTATGTGATGAGAGGGTGGCTGACATGGATGGGTTAGTACTTAGTAGTGGCATTACTGAGTTGGAAATGGGATCAAAAGTTGGAAATGATTATAGGGGGCATTGAGTATTGTTTTTAACACTTTCTGGATTCTGTCTCTTTCCCTTCTAATGTCATCTTCTATCTCTCTCATACTAGTTGATGTTTATCTTTGTAATACTGTTAAACTGTTACACCCTGAATCAAATAATATGTTATCTCCATTCTGATACTGCCGTTGTGTTCTCTGTTAAAACTGCTAGCTTCCATTACATTTTATCAATCGCTGGCCTCATCATTTTTATACTGTCTCTTTAGATGCCATATTGATCAATTTAAGCATCTTTTTTACGAACATCTGCAGGTTTCATTTTTATTGTGGTACATTGCTCTGATACTATATTACATTATCAACAGCTGTGATTAGATCAACAGTGCACCATAGATTTCTTCTTTGCTTCTGCCTCTTTATGAACCAACGTCCTTCAATTAGTCCATGGTCATTACAAAACTAGAGCAGCCAATTGGACCTCAAATAGGAGCAGAAAGCTATATGAGAAAATTTTTGAATCAAAATCTTTCTTCTCTTTATTTCCACGTAACTCAAGAATGCAAATTATTGATCAAATGCTGCTATGTTTTAATACTTCTCATACTTCTCTGTAAGGGTCTATTTGCATAAGCTTCTTTAAAAATACTTCTGGAAGAAAAAAATACAAAAATAAGAAGTCAAAACAGCTTCTTCACAAAGTTTTCTAAAAGATGTGATACTTTTTTTTAAACTAATTTTTAGCTAATATGTAGACGTTATTACACATAGCTTTCTAAAAAAATGTGAGGTTTTTTAAAAATTAGCTTATAAAAAGTCTCACATTTAAAAAAACTTATGGAAAAACTGTTATGACTTTTTTCTTTATATTTTTTTCTCCTAGTAAGTGTTTTTGGATAAAATTATCCAAATAGGTCCTATGTCCCAGCAAGCCCATTCATCCATCATGCTCTTGTGACCCTACCACAGACTCAACATTTTGGTTGCATTCTGGTTCCAGAAGTCTGAGTTCTCTCATCGGCTTGGTTGGAGGCTTGTATTATCTACTAGTGTTACCATATCTTCATATATCAGTTGGTGAATGCAGTTAAAGTCTTGTAGGGTATCAATTTTAGACCGTTTTGGTGCAGTTTGCAAATTCAGGACTTTCTACGGCACTGCATTTAATGAAGCAAATGGTGAAATATGGATAGGCCTGGGACACAGAACACTGGTGAAATTGTTGGCAGCATTAATATCAAATAGGGAAATATAGAACTCTGTTGAGATTATCGATTTCCTGGAGACAGTTTTTCCCTGTTAGATTTGAAGATTATGTTATGCTAGTGACTGAATATTTGTATTATGGAGGTACAAAAACTGTGATGCACTATACACACCAACACACAGGAAAACAATTTGAGAAATTAGTTGAAATGAAAAATTAATTAAATTTGAAGA 3269 0.3377 MDSHCFRRLHFAYLLLFVSAACCFSHPSFLGIHPLVRFWVQMRNITALRSSSARMDRNPSPETVSMTISVTVLMALMSLDVVVHLTTGTSACPNGKFYCRNLGSKPLFIVSSHVNDHFCDCCDGSDEYDGNICCHNTCVMGGNAESTFSNCKSKASQNGVKSEESVHGLQWVIILQVVLVIFLVFLWSCRCRTRFRRRYYH 201
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste1g03560 201 ProSiteProfiles Prokaryotic membrane lipoprotein lipid attachment site profile. 1 22 - -
Pste1g03560 201 PANTHER N-LINKED OLIGOSACCHARIDE PROCESSING 88 161 IPR039794 -
Pste1g03560 201 Pfam Glucosidase II beta subunit-like 88 165 IPR028146 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste1g03560 Pste-Chr1 16853796 16858271 Dispersed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pste1g03560 88 144 Calmodulin-binding Proteins AT5G56360 66.667 8.23e-24 96.3