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Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste1g02493 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4043 0.3965 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1133
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste1g02493 1133 Pfam RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) 112 190 IPR000504 GO:0003723
Pste1g02493 1133 FunFam RNA binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein 111 192 - -
Pste1g02493 1133 Gene3D Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger) 1 77 IPR013083 -
Pste1g02493 1133 Gene3D - 111 192 IPR012677 -
Pste1g02493 1133 ProSiteProfiles Eukaryotic RNA Recognition Motif (RRM) profile. 110 196 IPR000504 GO:0003723
Pste1g02493 1133 PANTHER CCR4-NOT TRANSCRIPTION COMPLEX RELATED 1 1016 IPR039780 GO:0004842|GO:0030014
Pste1g02493 1133 SMART rrm2_1 111 192 IPR003954 GO:0003676
Pste1g02493 1133 CDD RRM_CNOT4 105 204 IPR034261 -
Pste1g02493 1133 SUPERFAMILY RING/U-box 3 66 - -
Pste1g02493 1133 SUPERFAMILY RNA-binding domain, RBD 104 190 IPR035979 GO:0003676
Pste1g02493 1133 SMART rrm1_1 111 192 IPR000504 GO:0003723
Pste1g02493 1133 ProSiteProfiles Zinc finger RING-type profile. 9 57 IPR001841 -
Pste1g02493 1133 FunFam RNA binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein 1 77 - -
Pste1g02493 1133 Pfam RING/Ubox like zinc-binding domain 9 61 - -
Pste1g02493 1133 MobiDBLite consensus disorder prediction 349 424 - -
Pste1g02493 1133 CDD mRING-HC-C4C4_CNOT4 8 58 IPR039515 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste1g02493 Pste-Chr1 9206287 9219573 Proximal