Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste1g02118 CTGTGCAGTACTGCAGTGCAGACTTTGATTTATACAGGGATAGGATATAGCTCTCCCACACTATCTTCCGCTATGATGGACCTTCTCCCTGCTTTTACCTTCATATTTGCCATTTTATCCAGGATGGAAAATTTGAAACTGAAACTGCGTAGCTGCAAGGCTAAAATTATTGGAACAATAATCTCCATTGTAGGAGCATTAATCGTGACTTTATATAAAGGAATTCCATTGACCGGTGGTGGAAGTGCAACTAATCTCTCAGTGCAATCAGATTGGATACTTGGTGGTTTTCTTCTTGCAACTGCTAGCTTGTGTCTTTCAGTTTTGCTTATTGTTCAGACCTGGATTATCAAGGATTACCCTGAAGAGTTAGTGGTAACAACCGTTTGTTGCATACAAGTAGTAATCCTATCTGCAATAGCAATATTTGTTGTATCAATACGCAGTGTTGTAATGGCATGGGCATGTCGGAAGATGGGACCAGTTTATGTAGCTATGCTTACCCCTTTGGGAATGGTTATTGCACTTTTCACGGGGCTAATATTTCTTGGAGACAATATTTATCTTGGAAGTTTCTTGCTTTCTGGTTTTGAACTACTTAAATTGTTCCAGATTATTTTTAACATAATGAAAATAATAAATTGTACAAAGAAATCGGAGGACACAGAGGTAACAACAGTAATGGTTGTGGCTATGGTCCTCAGTGTGGGTTTGAACACTCTTATCAAAGCGTCAATGTCTAAAGGGATGAGCAATTTTGTTTTTGTTGCATACTCAAACCTTCTTGCTTTCTTTTTACTGCTAATAGCTTCCATAATCCATTACAGAAACACAGCTCCCACACCGATCAATAACTCCATTCTCTTTCGAATTTTTATTCTTGGCTTCCTCAGTGTTTCTATTCAGACTCTTATCTATACTGGACTTGGGTATAGTTCTCCAACTCTGACCTCTACCATGGAGGACCTCATTCCAGCTTATACTTTCATAATTGCCATTATTTCCAGTTTATACAAAGGGGTGCCAATGATAAGTGGTGTAGTGCCACATAACGATGCATCACTCTCATCATCAAAATGGCTATTAGGAGGATTTCTCCTTGCAGCGGGTACCTTTTGTGGTTCACTCTCACTTGTTATCCAGACATGGACTATTAAAGACTACCCTGAAGAGCTAATGCTAATAGCCATTTATAGCAGTTTCTCTGTTATCCTATCTTTCATAGTAGCTTTCGTTGCAGAAGACAATCCGAAGGCATGGATACTTAAACCTGATATGGAGTTGGCCATTGTTGTGATGTCTACACGAAATGTGGTGTATGCATGGGCATGTCGAAAGAAAGGACCTGTATATGTTGCTATGTTCAGTCCTTTAGGAATTGTCATTGCACTTGCCATGGGGATTGTGTTTTTGGGAGACACTCTATATCTTGGAAGTTTGATAGGAGCTGCTATAATAGCTGTTGGGTTTTATGCCGTACTATGGGGTCAATCTCAAGAGGAAAATACTACTAGTGAAAAATGTGGAACCTATAGCATTGTTTCGTCTTCATCATCTACAGCTCCTTTGTTGTTGAACAAAAGCAAAGACACAAGTTCTTTGGTATAGAGTTTCAGGATCGATGCTTTTATCTCAAACGCCTGATTTCTATGGTACACATGTATCCTTGTATGATGAGACAACTTAGTACCCCAACCAATCATATCTAGTAAGCGACAAGTCGTTGTCACAAGTTCATATCATCGATAAATATGTTAAAAGACTTGTCGTTATTGCAAATTATTGAAGAAAATATCTGACATATAAGTTTACATCCATAAACCTGCAGCTTGGCCCCTCTGTCATAATCTTTGGAGATCTTCTGAATCTTTTCTATATGTATGAATTTTTTTTAAATATATATCAGTAAATAGAATTGC 1919 0.382 LCSTAVQTLIYTGIGYSSPTLSSAMMDLLPAFTFIFAILSRMENLKLKLRSCKAKIIGTIISIVGALIVTLYKGIPLTGGGSATNLSVQSDWILGGFLLATASLCLSVLLIVQTWIIKDYPEELVVTTVCCIQVVILSAIAIFVVSIRSVVMAWACRKMGPVYVAMLTPLGMVIALFTGLIFLGDNIYLGSFLLSGFELLKLFQIIFNIMKIINCTKKSEDTEVTTVMVVAMVLSVGLNTLIKASMSKGMSNFVFVAYSNLLAFFLLLIASIIHYRNTAPTPINNSILFRIFILGFLSVSIQTLIYTGLGYSSPTLTSTMEDLIPAYTFIIAIISSLYKGVPMISGVVPHNDASLSSSKWLLGGFLLAAGTFCGSLSLVIQTWTIKDYPEELMLIAIYSSFSVILSFIVAFVAEDNPKAWILKPDMELAIVVMSTRNVVYAWACRKKGPVYVAMFSPLGIVIALAMGIVFLGDTLYLGSLIGAAIIAVGFYAVLWGQSQEENTTSEKCGTYSIVSSSSSTAPLLLNKSKDTSSLV 535
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste1g02118 535 SUPERFAMILY Multidrug resistance efflux transporter EmrE 419 499 - -
Pste1g02118 535 PANTHER WAT1-RELATED PROTEIN 225 333 IPR030184 GO:0016020|GO:0022857
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste1g02118 Pste-Chr1 6686562 6704222 Proximal
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pste1g02118 217 530 Nodulin-like Gene Family AT3G28050 35.989 1.81e-56 191
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pste1g02118 1 6686562 6704222 Pste1g02118 1 6686562 6704222 ECH
Pste1g02118 1 6686562 6704222 Pste5g03125 5 24318193 24336945 ECH