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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste1g02074 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Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste1g02074 860 FunFam Trehalose-6-phosphate synthase 2 674 753 - -
Pste1g02074 860 CDD HAD_TPP 592 833 - -
Pste1g02074 860 Gene3D Glycogen Phosphorylase B; 313 528 - -
Pste1g02074 860 FunFam Alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase [UDP-forming] 6 720 851 - -
Pste1g02074 860 NCBIfam HAD-IIB family hydrolase 592 794 IPR006379 -
Pste1g02074 860 SUPERFAMILY UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase 59 548 - -
Pste1g02074 860 NCBIfam trehalose-phosphatase 590 836 IPR003337 GO:0003824|GO:0005992
Pste1g02074 860 Gene3D Glycogen Phosphorylase B; 53 312 - -
Pste1g02074 860 PANTHER TREHALOSE-6-PHOSPHATE SYNTHASE 28 840 IPR001830 GO:0003824|GO:0005992
Pste1g02074 860 SUPERFAMILY HAD-like 591 838 IPR036412 -
Pste1g02074 860 Gene3D - 590 707 IPR023214 -
Pste1g02074 860 Gene3D - 720 850 IPR023214 -
Pste1g02074 860 Pfam Trehalose-phosphatase 594 828 IPR003337 GO:0003824|GO:0005992
Pste1g02074 860 Pfam Glycosyltransferase family 20 59 544 IPR001830 GO:0003824|GO:0005992
Pste1g02074 860 FunFam alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase [UDP-forming] 6 52 311 - -
Pste1g02074 860 CDD GT20_TPS 59 544 IPR001830 GO:0003824|GO:0005992
Pste1g02074 860 FunFam Alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase 313 528 - -
Pste1g02074 860 FunFam alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase [UDP-forming] 6 590 707 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste1g02074 Pste-Chr1 6505982 6510552 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pste1g02074 1 860 Trehalose Biosynthesis Gene Families AT1G23870 74.194 0.0 1356
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pste1g02074 1 6505982 6510552 Pste1g02074 1 6505982 6510552 ECH
Pste1g02074 1 6505982 6510552 Pste7g00706 7 6454391 6459616 PCT