Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Psa6g3919 ATGACACACATAAGTCCAGAAAATGCATGTTTTGAAGTGGTCCAGGATGTAGACTCGCCGGCCTTAGCTAATAATGCAGACCCACCGGCCATAGCTAATAATGAAGACCCACCGGTCTTAGCTATGGATGCAGACCCACCGGTCTTAGCTATGGATGCAGACCCGCCGCTATGGATGCGAACCGCCGGTATTAGCTATGGATGTGAACCCCGTATTAGCTATGGATGTGAACCCGCCGGTATTAGCTATGGATGCGAACTCGCTGGTATTAGCTATGGATGTGGACCCGCCGGTATTAGCTATGGATGCGAGCCCGCCGTATTAGCTATGGATGCGGACCCCCCGGTATTAGCTATGGATGCGGATCCGGATCCGCCAGTCTTAGCTACAGGTGCAGACCCAACCGCCTTGTCTTTAGCAGTGGATGCGGACCCTCCTGTCTTAGCTGTGGATGCGGACCCGCCTGTCCTAGGTGTGGATGCAGACCCGCCTTTCCTAGCTATGGATGCAGACCCATCGGTCTTAGCTATGGATGCAAACCCACAATTCTTAGAGTCTGAAACTCCTTTAGGAGATAATGGGTTTTTAAAGAAGATTGATGGAAATTCAGCAACTATATCAGGGGATGCTAATGCAAGTATTGTGCCCAATCCCGATCCAGACAGTGTCCCACTAATATCTAAGCATGATCACGGGACTCCTGCAGTGCTACGGATTGGCAATACAGGGAAGTTACCAGTTGAGCATTTTGATCCACAAAACATAGCCCGGTTGAAGAAGCGGCAGTTTTATCATTCTCACAAAGCTCAGCCAATGTCACTTGAAGAAGTTCTATCAAATTATGATAGTGAGGATGAAGTTGATGATGAAGTTGCCGATATTGAAGAGCGGAGGAAGCTTGATCTTCATCCTTTGAGCAAAGAAGAGAAGCGATTCATGTTCATGTGGAACTCATTTATTCGTAAGCAACGTGTGCGGGTAGATTCTCACCTTCGTTGGGCATGCAAGGCTTTCTCAGTATTGCATGGCTCCGAGATTGTTAAATCCCGCAAATTAACTTGGTATTGGACAATGTTCAGGATCAAATTATATAATTTGGGTCTTATAGATGGAAAAATCATCAATGATTGCAGTAATATTCTCGAACAACACGAGAAGCATAATTCAAATCCTGAGATCCCAGCAGCTAATATAAACTCCATTCATTTGTCCCCTCTTAAAAATAAAAGAAATAAGAAGATAACACAGAAAATGATCTCTTTATAA 1266 0.4534 MTHISPENACFEVVQDVDSPALANNADPPAIANNEDPPVLAMDADPPVLAMDADPPLWMRTAGISYGCEPRISYGCEPAGISYGCELAGISYGCGPAGISYGCEPAVLAMDADPPVLAMDADPDPPVLATGADPTALSLAVDADPPVLAVDADPPVLGVDADPPFLAMDADPSVLAMDANPQFLESETPLGDNGFLKKIDGNSATISGDANASIVPNPDPDSVPLISKHDHGTPAVLRIGNTGKLPVEHFDPQNIARLKKRQFYHSHKAQPMSLEEVLSNYDSEDEVDDEVADIEERRKLDLHPLSKEEKRFMFMWNSFIRKQRVRVDSHLRWACKAFSVLHGSEIVKSRKLTWYWTMFRIKLYNLGLIDGKIINDCSNILEQHEKHNSNPEIPAANINSIHLSPLKNKRNKKITQKMISL* 422
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Psa6g3919 421 PANTHER POLYCOMB GROUP PROTEIN EMBRYONIC FLOWER 2-RELATED 177 391 - -
Psa6g3919 421 Pfam VEFS-Box of polycomb protein 245 379 IPR019135 -
Psa6g3919 421 PANTHER POLYCOMB GROUP PROTEIN 177 391 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Psa6g3919 Psa-Chr6 340807282 340812914 Dispersed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Psa6g3919 234 381 C2H2 Transcription Factor Family AT2G35670 48.993 6.92e-44 161
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Psa6g3919 - - cam:101511538 405.216