Select | Gene | Cds | Cds_length | GC_content | Pep | Pep_length |
---|---|---|---|---|---|---|
Psa6g0232 | ATGTCTTTCATCAAACTCATTGTTTTTGTGACATTTTTCCTCTCATTTACATTCTCCAATGCTCATCCTGTAGGCTTCAACTTTGGCTGGGGTGCTCATCATCATCATCATCATGGTGGAATGTCCTTTGGTCTTTCTCCTCAATTCTATCAGTTTTCATGTCCTCAAGCTAATGACATTGTCATGTCAGTCTTGGAGAAGGCCATTGCTAAAGATATAAGACTCGCCGCTTCTCTTCTTCGACTTCACTTCCACGATTGCTTCGTCCAGGGTTGCGATGCGTCGATTTTGTTGGACGATAGTAGTGGAGGACCTAATTGGGAGCTACCCTTAGGAAGGAGAGACTCAAAAACAGCGAGCCTAAGGGGTTCAAACAAAAACATCCCTCCACCAAATGCCACCATTGAAGGTCTCTTAACATTTTTCAAGCGTCAAGGTCTCGATGACGTAGACCTTGTTGCTCTTTCAGGTGCACATACAATTGGTGTAGCAAAATGTGCAACGTTCAAGCAAAGACTATACAACCAAAATGGAAACAACCAACCAGATGAGAATCTAGAAAAAACATTTTACTTTGGTTTGAAAACAATGTGTCCAAAATCAGGTGGTGACAACAACATTTCTCCTTTGGATTTTGGTTCTCCAAGAATGTTTGATAACACATATTACAAACTCTTACTTAGAGGAAGAGGATTACTTAATTCAGATGAAGTGCTTGTCACCGGAAATGTTAGAGAAACTCATGAACTGGTGAAGACATATGCACAAGATGAGAGTCTCTTCTTTGAACAATTTGCATTGTCGATGATCAATGTTGATATTGATCATGCTATTTTTGTTACCGTTGTTGTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTTTGCTATTGTTGTTGTTATTATTGTTGTTAATATTATTGTTGTTGTTATTGTTGATGATGTTGTTATTGAAATTGTTGTTGTTGTTGTTATTGTTGTTCTTGTCGATGTCGCAATTGATGTTATTAATGTTGTTGTTGTTGCTATTATTGTTGTTGCTATTGATGTTACTGTTGATGTTGCTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTATTTATTATTGTTAATGTTGCTATTGTCATTGTTGTTAATGTGGTTGTTGCTATTGTTGTTGTTGACGTTGCTGATATTGTTGTTGTTGTTGTTAATATTATTGTTATTGTTATTGTTATTGTTGATGTTGTTATTGTTGTTGTTATTGTTGTTATTGCTATTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTTTTATTAATTTTTCTGTTGTTGATGTTGTTGTTGTTGCTGTTGTTGTTTGTGTTGTTTCGTTGATTGTTGTTATTGTTGTTGTTGCCTTTGATGTTGTTGTTATTATTATTGCAGTTGTTGTTACTATTGTTATTGTTGTTGTTGTTATTGTTGCTCTTGTTGTTGTTGATGTTGTTATTGTTGTTGTTGCTATTATTGTTGTTATTGCTTTTGCTTTTGCTATTGTTGTTATAGTTGCTATTACTGTTGTTGTAGTTATTGTTATTGTTGTTGCAGTTACTGTTGTTGTTTTTGTTATTGTTTTTGTGGTTGTTGTTGTTTCTACTATTGTTGTTGTTGTTACTACTATTATTGTTGTTGTCCTTGTTGTTTTTATTCTTGTTATTATTGTTGTGGTTGTTGTTGATATTATTGTTGTTGTTGTTGCTATTACTGTTTCTTTTGTTGTTATTGTTGTTGTTGTTATTATTGTTGTTATTGTTGTTATTTTTGTTGTTGTTGATGATGTTGGTGTTGTTATTTTGTTGTTGCAATTTGTTTTGCTTTTGATGTTGTTGTTTTGTTTTGTTGTTGTTATTGTTGTTGATATTACTATTGTTGTTGTTGTCCCTGTTATTGTTGTTGTTGTTATTGTTGTTACTATTGATGTTGTTGTTACTGTTGTTGTTATTGTTTTTGTTGTTGTTATTATTGTTGTTGTTACTATTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTAGTGGTGTTGTTGGCTCTATTGTTGTTGTTTTTGTTGTTGTAATTGTTGTTAATATTGCTATTGTTATTATTGTTTCTGTTGCTGTTAATTTTGTTGTTTTTGTTGTTGTTGTTGATGTTGATGTTGCTGTTGTTGTTATTGTTATTGCTATTTTTGTCGTTGTTGATATTGTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTATTATTTTTGTTTTTGTTTTTGTTGTTGTTATTGATGATGATGTTGTTGTTGTTATGGCTATTATTGTTGTTGTTGTTGCTATTTCTTTTGCTTTTAATGTTATTGTTGGTGTTGGTGTTGTTTTTGTTGATGTTGTCGTTGCTGTTGTTGTTATTGATGATGTTGTTGTTGTTATGGCTATTATTGTTGTTGTTGTTGCTGCTGTTTTTTTTTTTGCTTTTAATGTTATTGTCGTTATTATTATTGTTGTTGTTATTGTTGATATTTTTGTTGTTGTTGCAGTTGTTGTTGTTTTCGGTGTTGCTATTGGTGTTGTTTATGTTGCTATTGTTGTTGTTGCTGCTGTTTTTTTCACTTTTAATGTTATTGTTTTGTTTTGCTATTTTGTTTCTTTTGTTGATATTACTGTTGTTGTCGTTATTACTATTGATCTTGCTATTATTACTATTGATGTTACTCTTGCTAATATTGTTGTTGCTGTAGTTGTTAATGCTATTATTTTTGTTGTTGTTGTTGATGTTGATGTTGCTACAGTTATTGTTGTTGTTAATGATGATGTTGTTGTTGTTATTTTTCTCGTTGTTGATGTTGTTGTATTGTTTTTTGTTGTTGATGTAGTAGTTGTTGTTATTGATGTTGTTATTGATGTTGTTATTGATGTTATTGTTATTGATGTTATTGTTGATGTTGTTATTGATGTTATTGTTATTGATGTTGTTGTTGCAGTTGTTGTTGCTGCTTTTGATGTAGTTATTGCAGTTGTTGTTGTTGTTTTCGCTTTTGATGTTGTTGTTTTATTTTGCTTTGTTGTTGTTTTTATTGTTGTTGATGTTATTGTTATTGTTATTGTTATTGTTGTTATTGATGATGGTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGCTGCTTTTCATATTGCTATTGATGTTGTTGTTGTTGTTGATATTGGTGTTATTGTTGCTATTTTTTCGCTTTTGATGATTTTGTTTTTCGTTGTTGTTGTCATTGTTGTTGTTATTGCTATTGTTTTTGTTGTCCCTGTTGTTGTTGTTACTATTGATGTTGATGTTACTGTTGATGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTTGTTGTTGTTACTGTTGTTCTTATTGTTCTTGTTGGTGGTGGTGTTACTCTTGCTTTTACTTTTTCCATTGTTGTTGATGTAGTTGTTGTTATTGTTGTTGTTGATGATGATGATGATGTTGTTATTGTTATGGTTGTTGTTACTGTTGTTTCTTTTACTGTTAATGATATTGTTGGTGGTGTTGTTGTTTGTGTTGTTGTTGTTATTGTTGTTGTTTTTATTGTTGTTGTCGTTGTTGATGTTGATGTTGCTGTTGATGTTGCTGTTGTTGTTGCTATTACAGTAGTTGTTGTTGGTTTTTTTTTCACTTTTGATGTTGTTGTTTTGTTTTGCTTTTGTTATTGTTGTTGTTATTGCAGTAGTTGTTGTTGTTTTATTTCACGTTTGATGTTGTTGTTTTGTTTTGCTTTTGTTATTGTTGTTCTCCCTGTTGTTGTTACTAATGATATTGTTGTTACTGTTGTTGTTGTTTTTGTTGTTTTTGTTGTTTTTGTTGTTGTTGTTACTGTTATTATTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCTCTGTTGTTGGTTTTGTTGTTGTTGTTATTATTATTGGTGGTAGTGGTGTTATTGTTGTTTTTGTTGTTGTTAATGTTGTTGTTTATGTTGTTGTTGTTGTCTTTGTTGTTGTTGATAATGTTGTTGTTGTTATGGCTATTATTGTTGTTGTTGTTGCTATTTCTTTTGCTTTTAATGTTATTGTTGTAGTTGGTGTTAGTGTTGTTGTTGTTGTTATTGATATTTATTTTGTTGTTGTTGCTGTTTTTGATGTTGTTATTGTTGTTGTTATTGTTTTTTTTTTACTTTTGATGTTGTTGTTTTGTTTTGCTATTGCTATTGCTATTGTTGTTGGTGTCCTTGTTGTTGTTGTTATTGATGTTACTATTGATGTTGTTGTTACTGTTGTTGTTATTGTTGTTTTTATTATTGTTGTTGTTATTATTGTTATTGTTGTTACTATTGTTGTTGTTGTTATTGTTATAGTTGGTGGTGTTGTTGGCTTTGTTGTTGTTGTTTTTGTTGTTGTTATTGCTGATACTGTTGTTTTTGTTGTTATTACTGATATTGTTGATATTGTTGTTGTTGTTGGTATTGTTGTTATTATTGTTATTATTGTTATTGTTTTTATTGTTGTTGCGGTTGTTGTTGCTATTGTTATTGTTGTTGTTGGTGGTGGTGGTGTTGTTGGTGTTGTTGTTGTTGATGTTGTTGGTGGTGGTGGTGGTGGTTCTGTTGTTATTGCTTTTGTTGTTGTTGATGATGATGTTGTTGTTGTTGATGTTGTTGTCGTTGATGCTGACGTTGTTGTTTTTGTTGTTGTTATTGTTGTTGTTATTGTTGTTGTTGTTATTGGTGGTGGTGTCGTTGTTGGTGTTATTGGATCAAAAATTCAGTGTAAAACTGCCTGGTTCGAGTCAAACTTGTAA | 4719 | 0.3128 | 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| 1573 |
Select | Seq ID | Length | Analysis | Description | Start | End | IPR | GO |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Psa6g0232 | 1572 | ProSitePatterns | Peroxidases active site signature. | 76 | 87 | IPR019794 | GO:0004601 | |
Psa6g0232 | 1572 | PRINTS | Haem peroxidase superfamily signature | 76 | 90 | IPR002016 | GO:0004601|GO:0006979|GO:0020037 | |
Psa6g0232 | 1572 | PRINTS | Haem peroxidase superfamily signature | 151 | 166 | IPR002016 | GO:0004601|GO:0006979|GO:0020037 | |
Psa6g0232 | 1572 | PRINTS | Haem peroxidase superfamily signature | 211 | 226 | IPR002016 | GO:0004601|GO:0006979|GO:0020037 | |
Psa6g0232 | 1572 | Gene3D | - | 102 | 128 | - | - | |
Psa6g0232 | 1572 | ProSiteProfiles | G-protein coupled receptors family 1 profile. | 371 | 628 | IPR017452 | GO:0016021 | |
Psa6g0232 | 1572 | Gene3D | Peroxidase, domain 2 | 129 | 271 | - | - | |
Psa6g0232 | 1572 | PRINTS | Plant peroxidase signature | 54 | 73 | IPR000823 | GO:0004601|GO:0006979|GO:0020037 | |
Psa6g0232 | 1572 | PRINTS | Plant peroxidase signature | 78 | 98 | IPR000823 | GO:0004601|GO:0006979|GO:0020037 | |
Psa6g0232 | 1572 | Pfam | Peroxidase | 102 | 257 | IPR002016 | GO:0004601|GO:0006979|GO:0020037 | |
Psa6g0232 | 1572 | Pfam | Peroxidase | 63 | 98 | IPR002016 | GO:0004601|GO:0006979|GO:0020037 | |
Psa6g0232 | 1572 | Gene3D | - | 45 | 101 | - | - | |
Psa6g0232 | 1572 | ProSiteProfiles | Plant heme peroxidase family profile. | 44 | 272 | IPR002016 | GO:0004601|GO:0006979|GO:0020037 | |
Psa6g0232 | 1572 | PANTHER | PEROXIDASE 72-RELATED | 102 | 272 | IPR000823 | GO:0004601|GO:0006979|GO:0020037 | |
Psa6g0232 | 1572 | PANTHER | PEROXIDASE 72-RELATED | 46 | 102 | IPR000823 | GO:0004601|GO:0006979|GO:0020037 | |
Psa6g0232 | 1572 | SUPERFAMILY | Heme-dependent peroxidases | 44 | 272 | IPR010255 | GO:0004601|GO:0006979|GO:0020037 | |
Psa6g0232 | 1572 | PANTHER | PEROXIDASE 9 | 102 | 272 | - | - | |
Psa6g0232 | 1572 | PANTHER | PEROXIDASE 9 | 46 | 102 | - | - | |
Psa6g0232 | 1572 | ProSitePatterns | Peroxidases proximal heme-ligand signature. | 151 | 161 | IPR019793 | - | |
Psa6g0232 | 1572 | ProSiteProfiles | ABC transporter integral membrane type-1 domain profile. | 1364 | 1544 | IPR000515 | GO:0016020|GO:0055085 |
Select | Gene | Chromosome | Start | End | Duplicated_type |
---|---|---|---|---|---|
Psa6g0232 | Psa-Chr6 | 7080978 | 7093604 | Dispersed/Wgd |
Select | Gene | Gene_start | Gene_end | Function | Ath_gene | Identity(%) | E-value | Score |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Psa6g0232 | 6 | 272 | Peroxidase | AT1G44970 | 59.006 | 3.71e-121 | 382 |
Select | Query | KO | Definition | Second KO | KEGG Genes ID | GHOSTX Score |
---|---|---|---|---|---|---|
Psa6g0232 | K00430 | - | gmx:100795020 | 431.795 |